Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SRS3

Protein Details
Accession Q8SRS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-210EKVENVKKRPTIKIKKDRRSRRKIRITNTHVKGLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-200VKKRPTIKIKKDRRSRRKIR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ecu:ECU06_0350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MDRDRIDSIDRGVQRHTNTYIHAVISLLKQHDRPLSFEEIKDKTRIDLHNNYVLLQSIKRNPRIVATHSTLMFKPLYSIRSVEDMRKVVRGLGGEEGLEMSKLMDSPVNVVPFVEELKKSNEIIILNDIDGSEVVFWNDTQESPVDPQIKSLWNQVRITTYHDLIRELNTAGLKTEKVENVKKRPTIKIKKDRRSRRKIRITNTHVKGLDLSGVQDER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.39
4 0.33
5 0.33
6 0.36
7 0.34
8 0.29
9 0.26
10 0.21
11 0.19
12 0.19
13 0.21
14 0.19
15 0.2
16 0.2
17 0.25
18 0.31
19 0.3
20 0.31
21 0.32
22 0.37
23 0.37
24 0.38
25 0.41
26 0.38
27 0.39
28 0.39
29 0.34
30 0.28
31 0.32
32 0.34
33 0.35
34 0.39
35 0.41
36 0.45
37 0.44
38 0.43
39 0.36
40 0.34
41 0.27
42 0.21
43 0.21
44 0.23
45 0.29
46 0.33
47 0.35
48 0.34
49 0.38
50 0.41
51 0.41
52 0.4
53 0.37
54 0.37
55 0.35
56 0.37
57 0.31
58 0.29
59 0.25
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.19
68 0.2
69 0.2
70 0.22
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.18
76 0.18
77 0.16
78 0.13
79 0.12
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.07
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.09
102 0.07
103 0.08
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.15
132 0.17
133 0.16
134 0.18
135 0.2
136 0.22
137 0.22
138 0.29
139 0.3
140 0.33
141 0.34
142 0.34
143 0.34
144 0.33
145 0.38
146 0.33
147 0.28
148 0.25
149 0.25
150 0.25
151 0.23
152 0.24
153 0.19
154 0.16
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.17
163 0.18
164 0.24
165 0.33
166 0.41
167 0.49
168 0.57
169 0.61
170 0.62
171 0.68
172 0.73
173 0.75
174 0.78
175 0.79
176 0.83
177 0.87
178 0.92
179 0.94
180 0.94
181 0.94
182 0.93
183 0.94
184 0.94
185 0.93
186 0.93
187 0.92
188 0.91
189 0.9
190 0.84
191 0.81
192 0.7
193 0.62
194 0.53
195 0.43
196 0.37
197 0.26
198 0.23