Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VDG4

Protein Details
Accession H1VDG4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
202-235KMHPDYRYTPRKPSEKRRRKPQKRVTPVHPASRPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-226YTPRKPSEKRRRKPQKRV
Subcellular Location(s) plas 7, cyto 5, nucl 4, mito 4, mito_nucl 4, extr 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG chig:CH63R_09970  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MALNFNPGQIIVRNIDPTQVDPNVLRAVTETLDLHLNTFESTVAVSGWDYMAYGEEGRLFMALQMGRILRKPVMWVKDGIHNNVDRWVLGPCDRFIAGIHMIVSVDGIAVVVRRPPPQLLEEAPGALVPCVNAPERTPKITRPPNAFILYRSDFQAQLKLMNPHIQNHDISKRLGAAWNSESHEVRERYRALAKAYKERHNKMHPDYRYTPRKPSEKRRRKPQKRVTPVHPASRPGLETVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.23
4 0.24
5 0.26
6 0.25
7 0.24
8 0.21
9 0.24
10 0.24
11 0.23
12 0.2
13 0.16
14 0.17
15 0.15
16 0.17
17 0.14
18 0.12
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.05
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.18
59 0.22
60 0.25
61 0.25
62 0.26
63 0.26
64 0.34
65 0.35
66 0.33
67 0.3
68 0.27
69 0.26
70 0.27
71 0.26
72 0.17
73 0.16
74 0.14
75 0.12
76 0.14
77 0.15
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.02
95 0.02
96 0.02
97 0.03
98 0.05
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.13
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.1
113 0.07
114 0.06
115 0.03
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.16
122 0.18
123 0.21
124 0.23
125 0.25
126 0.34
127 0.42
128 0.47
129 0.45
130 0.47
131 0.49
132 0.51
133 0.48
134 0.39
135 0.38
136 0.35
137 0.29
138 0.27
139 0.23
140 0.21
141 0.21
142 0.24
143 0.17
144 0.17
145 0.19
146 0.2
147 0.2
148 0.25
149 0.25
150 0.25
151 0.29
152 0.28
153 0.26
154 0.29
155 0.32
156 0.28
157 0.28
158 0.25
159 0.22
160 0.21
161 0.24
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.23
166 0.24
167 0.26
168 0.26
169 0.25
170 0.32
171 0.3
172 0.29
173 0.32
174 0.31
175 0.32
176 0.37
177 0.37
178 0.35
179 0.39
180 0.41
181 0.45
182 0.5
183 0.56
184 0.6
185 0.63
186 0.67
187 0.69
188 0.73
189 0.72
190 0.75
191 0.7
192 0.69
193 0.71
194 0.71
195 0.73
196 0.69
197 0.69
198 0.68
199 0.74
200 0.75
201 0.8
202 0.81
203 0.82
204 0.88
205 0.9
206 0.94
207 0.94
208 0.96
209 0.96
210 0.96
211 0.95
212 0.94
213 0.9
214 0.9
215 0.86
216 0.85
217 0.78
218 0.71
219 0.64
220 0.59
221 0.53