Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FPQ5

Protein Details
Accession A0A5N6FPQ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
565-588MASALQQRRTRRRRGSLRKTALLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
572-583RRTRRRRGSLRK
Subcellular Location(s) nucl 12, plas 11, mito 1, cyto 1, golg 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR029164  PIG-Y  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF15159  PIG-Y  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12614  RRM1_PUB1  
cd12619  RRM2_PUB1  
cd12622  RRM3_PUB1  
Amino Acid Sequences MADNVPAQTPSTLPPPPQASAPPGQQYDGAQGNGQANPSHMPPPPRPPVVIPQNTNPIPTAITSPMSGNMMSPTSAGGYVRRAAPEPNKRALYVGGLDPRVTEDILKQIFETTGHVISVKIIPDKNKFNSKGYNYGFVEFDDPGAAERAMQTLNGRRIHQSEIRVNWAYQSNTLSKEDTSNHFHIFVGDLSNEVNDEILTQAFSAFGSVSEARVMWDMKTGRSRGYGFVAFRDRADADKALSSMDGEWLGSRAIRCNWANQKGQPSISQQQAMAAMGMTPTTAFGHHHFPTHGIQSYDMVIQQTPQWQTTCYVGNLTPYTTQNDLVPLFQNFGYVLETRLQADRGFAFIKMDTHENAAMAICQLNGYNVNGRPLKCSWGKDRPPTGQFDNFSGQQGTSPFNNSPAPYFPQYGGPGGPMTPQGPNSAGRGWDQSGMAGQNYGQVPGNAGYGRGQATPASGWNQANNANFGNGFGGYQAMHLAPMEDASDNGRVALSLDNDDQLSGRTRSGSASSGHKRSSSGSLLSKLSFLRMIQATHNTPERAHSGIDGNDGDGFTSSARGGRAMASALQQRRTRRRRGSLRKTALLGTRFEYRDKKTTRAPIDVPRADALGQQQQTEQQQQLPPGSRIQQPFPDPIPPENNVAPHRSTEQGSREDDAAWEGFMNAPLKSLDKSAQHNRQNRSKGSVLGGEVTTDDEDIVSFSRLKNTNAAVAAAAGLHLQSASSSSDSYFALSADSTYRAMHRTKSPLATHAVGIASNQDMSWDYSETEWWGWIILIVTWLVFVMGMGSCFGVWKWAWDVGETPYAPPELEDDNTLPIVGYYPALIIMTAVMSWVWVVVAWVGMKYFKHANISGDDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.34
4 0.36
5 0.37
6 0.37
7 0.4
8 0.44
9 0.44
10 0.4
11 0.4
12 0.38
13 0.36
14 0.36
15 0.34
16 0.28
17 0.22
18 0.24
19 0.26
20 0.25
21 0.26
22 0.2
23 0.18
24 0.19
25 0.21
26 0.22
27 0.23
28 0.29
29 0.34
30 0.43
31 0.49
32 0.51
33 0.51
34 0.51
35 0.57
36 0.61
37 0.64
38 0.59
39 0.57
40 0.63
41 0.61
42 0.58
43 0.48
44 0.39
45 0.31
46 0.28
47 0.25
48 0.18
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.18
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.14
66 0.17
67 0.19
68 0.21
69 0.21
70 0.27
71 0.36
72 0.45
73 0.48
74 0.54
75 0.53
76 0.52
77 0.52
78 0.46
79 0.4
80 0.33
81 0.32
82 0.29
83 0.28
84 0.27
85 0.26
86 0.27
87 0.24
88 0.21
89 0.17
90 0.12
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.15
103 0.14
104 0.15
105 0.18
106 0.17
107 0.19
108 0.21
109 0.26
110 0.33
111 0.4
112 0.45
113 0.52
114 0.53
115 0.54
116 0.6
117 0.6
118 0.63
119 0.58
120 0.6
121 0.52
122 0.5
123 0.45
124 0.37
125 0.34
126 0.24
127 0.21
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.19
140 0.27
141 0.3
142 0.31
143 0.33
144 0.35
145 0.41
146 0.42
147 0.42
148 0.42
149 0.42
150 0.47
151 0.46
152 0.43
153 0.41
154 0.41
155 0.34
156 0.29
157 0.3
158 0.26
159 0.27
160 0.29
161 0.27
162 0.23
163 0.25
164 0.27
165 0.28
166 0.32
167 0.32
168 0.31
169 0.31
170 0.3
171 0.26
172 0.24
173 0.2
174 0.15
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.09
203 0.15
204 0.16
205 0.19
206 0.25
207 0.26
208 0.25
209 0.29
210 0.3
211 0.26
212 0.3
213 0.31
214 0.26
215 0.3
216 0.33
217 0.3
218 0.28
219 0.29
220 0.24
221 0.22
222 0.24
223 0.2
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.12
241 0.18
242 0.19
243 0.26
244 0.35
245 0.41
246 0.45
247 0.45
248 0.51
249 0.48
250 0.49
251 0.44
252 0.42
253 0.4
254 0.39
255 0.37
256 0.29
257 0.27
258 0.26
259 0.23
260 0.16
261 0.11
262 0.08
263 0.06
264 0.06
265 0.04
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.09
272 0.15
273 0.16
274 0.18
275 0.17
276 0.2
277 0.22
278 0.24
279 0.24
280 0.18
281 0.18
282 0.17
283 0.18
284 0.16
285 0.14
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.15
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.15
310 0.17
311 0.16
312 0.14
313 0.15
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.1
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.09
345 0.08
346 0.07
347 0.06
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.1
355 0.1
356 0.16
357 0.18
358 0.19
359 0.22
360 0.22
361 0.26
362 0.26
363 0.29
364 0.32
365 0.39
366 0.45
367 0.49
368 0.54
369 0.55
370 0.54
371 0.55
372 0.52
373 0.46
374 0.41
375 0.36
376 0.33
377 0.28
378 0.26
379 0.22
380 0.18
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.13
386 0.12
387 0.14
388 0.15
389 0.14
390 0.15
391 0.15
392 0.18
393 0.18
394 0.19
395 0.17
396 0.19
397 0.2
398 0.19
399 0.17
400 0.14
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.07
424 0.06
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.11
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.08
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.1
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.14
449 0.17
450 0.17
451 0.18
452 0.15
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.11
457 0.07
458 0.07
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.04
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.11
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.13
496 0.14
497 0.13
498 0.21
499 0.26
500 0.29
501 0.29
502 0.29
503 0.28
504 0.28
505 0.31
506 0.25
507 0.23
508 0.23
509 0.25
510 0.25
511 0.25
512 0.24
513 0.19
514 0.18
515 0.15
516 0.12
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.15
521 0.2
522 0.2
523 0.22
524 0.26
525 0.22
526 0.21
527 0.22
528 0.22
529 0.18
530 0.17
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.17
535 0.14
536 0.12
537 0.12
538 0.11
539 0.1
540 0.08
541 0.07
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.11
554 0.17
555 0.2
556 0.26
557 0.29
558 0.36
559 0.47
560 0.53
561 0.6
562 0.64
563 0.71
564 0.76
565 0.84
566 0.87
567 0.87
568 0.87
569 0.81
570 0.73
571 0.67
572 0.61
573 0.52
574 0.43
575 0.34
576 0.33
577 0.31
578 0.32
579 0.34
580 0.33
581 0.4
582 0.42
583 0.44
584 0.44
585 0.52
586 0.53
587 0.54
588 0.54
589 0.53
590 0.6
591 0.57
592 0.51
593 0.43
594 0.38
595 0.33
596 0.3
597 0.24
598 0.22
599 0.21
600 0.19
601 0.19
602 0.22
603 0.25
604 0.27
605 0.25
606 0.22
607 0.24
608 0.26
609 0.3
610 0.3
611 0.29
612 0.28
613 0.31
614 0.32
615 0.33
616 0.34
617 0.35
618 0.35
619 0.38
620 0.36
621 0.38
622 0.35
623 0.36
624 0.37
625 0.33
626 0.34
627 0.31
628 0.34
629 0.31
630 0.32
631 0.29
632 0.26
633 0.27
634 0.25
635 0.26
636 0.26
637 0.29
638 0.31
639 0.33
640 0.32
641 0.3
642 0.28
643 0.26
644 0.23
645 0.18
646 0.12
647 0.1
648 0.08
649 0.08
650 0.11
651 0.11
652 0.09
653 0.1
654 0.11
655 0.12
656 0.13
657 0.15
658 0.16
659 0.2
660 0.28
661 0.37
662 0.46
663 0.53
664 0.61
665 0.65
666 0.7
667 0.73
668 0.68
669 0.65
670 0.58
671 0.52
672 0.48
673 0.44
674 0.36
675 0.31
676 0.28
677 0.21
678 0.19
679 0.17
680 0.14
681 0.1
682 0.09
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.08
688 0.09
689 0.09
690 0.17
691 0.2
692 0.21
693 0.25
694 0.26
695 0.29
696 0.28
697 0.28
698 0.21
699 0.18
700 0.17
701 0.12
702 0.1
703 0.06
704 0.05
705 0.04
706 0.04
707 0.03
708 0.03
709 0.05
710 0.07
711 0.08
712 0.08
713 0.09
714 0.11
715 0.11
716 0.12
717 0.11
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.11
724 0.11
725 0.12
726 0.13
727 0.16
728 0.19
729 0.23
730 0.28
731 0.34
732 0.39
733 0.46
734 0.47
735 0.47
736 0.5
737 0.47
738 0.4
739 0.35
740 0.3
741 0.22
742 0.2
743 0.17
744 0.12
745 0.11
746 0.1
747 0.08
748 0.09
749 0.12
750 0.14
751 0.13
752 0.13
753 0.13
754 0.15
755 0.16
756 0.15
757 0.13
758 0.11
759 0.11
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.07
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.07
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.04
772 0.04
773 0.05
774 0.05
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.07
779 0.07
780 0.09
781 0.09
782 0.12
783 0.15
784 0.18
785 0.19
786 0.2
787 0.22
788 0.21
789 0.28
790 0.26
791 0.23
792 0.22
793 0.22
794 0.21
795 0.19
796 0.19
797 0.16
798 0.16
799 0.19
800 0.18
801 0.2
802 0.2
803 0.19
804 0.16
805 0.13
806 0.13
807 0.1
808 0.09
809 0.07
810 0.07
811 0.08
812 0.08
813 0.07
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.05
818 0.05
819 0.04
820 0.04
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.04
827 0.07
828 0.07
829 0.08
830 0.08
831 0.11
832 0.11
833 0.15
834 0.2
835 0.22
836 0.28
837 0.3
838 0.33