FuNGI

A0A5N6FF64

Protein Details

Accession

A0A5N6FF64

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-40	LMRIRRPKAADPLVRPKRRP	Basic
130-152	ESQFTRPVRLQRRDPRARPHEMS	Hydrophilic
517-539	GTDTSRKKGKSKHPSTQPTPQPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-43	RIRRPKAADPLVRPKRRPAVK
408-431	REKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
496-498	KKG
503-505	PRK
523-526	KKGK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTNDSNGRTPTGSNGPPLMRIRRPKAADPLVRPKRRPAVKPAVPVSGNGPASKAVASRPVTSDPLSAPHTERGKPASDFSANGFSGPLLSETYMDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARPHEMSSEKGQGMQKTASESSHQMDEVEREELEARKAAREKERAENMAQIAPSIGSAPKRANVPKQKTQQVSKTDMTPEEMAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLETTGKMRMIPVEKWYRFSAKNQFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPSGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDELFNEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKRERDYEEEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDDSEAERLKEEERKAEEEKNKKDTTTSSKGNNTPSGRPKHTDPLKKGTATGPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKSKHPSTQPTPQPSSRNMSPAAALPMPLGKKRVRNVPPGGAGSCSDADGGAGSGGEMSEGGKTKKLKLNPPSAASQSGTPQGSRAGSPTPLAGRSFSGSRASSPESFRGQTRVSTPGPTGSQSFPTPAEIHAAIPSSGILSSDLLRIFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.35
3	0.34
4	0.35
5	0.34
6	0.39
7	0.45
8	0.47
9	0.47
10	0.55
11	0.59
12	0.63
13	0.67
14	0.67
15	0.71
16	0.73
17	0.73
18	0.73
19	0.77
20	0.78
21	0.81
22	0.77
23	0.76
24	0.76
25	0.77
26	0.74
27	0.73
28	0.74
29	0.73
30	0.79
31	0.74
32	0.72
33	0.63
34	0.58
35	0.51
36	0.48
37	0.41
38	0.32
39	0.29
40	0.22
41	0.23
42	0.23
43	0.2
44	0.14
45	0.21
46	0.23
47	0.25
48	0.28
49	0.31
50	0.33
51	0.33
52	0.34
53	0.27
54	0.29
55	0.28
56	0.27
57	0.27
58	0.31
59	0.35
60	0.34
61	0.37
62	0.36
63	0.38
64	0.37
65	0.37
66	0.36
67	0.33
68	0.32
69	0.32
70	0.35
71	0.3
72	0.28
73	0.26
74	0.19
75	0.17
76	0.17
77	0.14
78	0.08
79	0.09
80	0.09
81	0.1
82	0.13
83	0.13
84	0.12
85	0.11
86	0.11
87	0.15
88	0.16
89	0.16
90	0.17
91	0.22
92	0.29
93	0.32
94	0.34
95	0.35
96	0.42
97	0.48
98	0.55
99	0.57
100	0.53
101	0.51
102	0.54
103	0.5
104	0.49
105	0.48
106	0.44
107	0.43
108	0.42
109	0.47
110	0.5
111	0.58
112	0.54
113	0.53
114	0.53
115	0.55
116	0.57
117	0.54
118	0.51
119	0.49
120	0.46
121	0.47
122	0.45
123	0.46
124	0.52
125	0.57
126	0.62
127	0.65
128	0.75
129	0.79
130	0.82
131	0.83
132	0.81
133	0.82
134	0.76
135	0.71
136	0.7
137	0.63
138	0.61
139	0.55
140	0.53
141	0.44
142	0.45
143	0.43
144	0.35
145	0.35
146	0.32
147	0.27
148	0.26
149	0.27
150	0.23
151	0.22
152	0.23
153	0.21
154	0.22
155	0.21
156	0.17
157	0.16
158	0.17
159	0.17
160	0.16
161	0.13
162	0.12
163	0.14
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.15
168	0.19
169	0.23
170	0.28
171	0.34
172	0.4
173	0.43
174	0.49
175	0.55
176	0.53
177	0.5
178	0.49
179	0.43
180	0.38
181	0.34
182	0.24
183	0.18
184	0.15
185	0.13
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.11
190	0.12
191	0.14
192	0.2
193	0.24
194	0.33
195	0.42
196	0.49
197	0.56
198	0.63
199	0.69
200	0.7
201	0.72
202	0.71
203	0.66
204	0.65
205	0.57
206	0.52
207	0.47
208	0.41
209	0.38
210	0.31
211	0.26
212	0.23
213	0.23
214	0.22
215	0.22
216	0.23
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.21
221	0.22
222	0.26
223	0.27
224	0.3
225	0.28
226	0.27
227	0.25
228	0.24
229	0.22
230	0.18
231	0.18
232	0.18
233	0.19
234	0.18
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.16
239	0.13
240	0.09
241	0.08
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.08
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.11
263	0.14
264	0.15
265	0.21
266	0.3
267	0.3
268	0.34
269	0.36
270	0.37
271	0.35
272	0.4
273	0.44
274	0.43
275	0.49
276	0.48
277	0.47
278	0.43
279	0.44
280	0.39
281	0.31
282	0.23
283	0.19
284	0.17
285	0.17
286	0.16
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.16
291	0.14
292	0.2
293	0.29
294	0.38
295	0.44
296	0.49
297	0.5
298	0.54
299	0.56
300	0.52
301	0.53
302	0.46
303	0.41
304	0.43
305	0.46
306	0.41
307	0.41
308	0.43
309	0.35
310	0.33
311	0.35
312	0.31
313	0.26
314	0.27
315	0.34
316	0.37
317	0.43
318	0.42
319	0.4
320	0.41
321	0.45
322	0.43
323	0.44
324	0.42
325	0.38
326	0.41
327	0.4
328	0.37
329	0.31
330	0.29
331	0.2
332	0.14
333	0.1
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.07
352	0.08
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.11
368	0.14
369	0.17
370	0.24
371	0.31
372	0.32
373	0.4
374	0.46
375	0.51
376	0.52
377	0.49
378	0.44
379	0.42
380	0.4
381	0.37
382	0.34
383	0.29
384	0.27
385	0.28
386	0.28
387	0.25
388	0.29
389	0.3
390	0.3
391	0.28
392	0.28
393	0.29
394	0.29
395	0.32
396	0.29
397	0.29
398	0.33
399	0.38
400	0.44
401	0.51
402	0.54
403	0.58
404	0.63
405	0.65
406	0.67
407	0.67
408	0.64
409	0.63
410	0.64
411	0.63
412	0.66
413	0.69
414	0.7
415	0.73
416	0.73
417	0.75
418	0.73
419	0.68
420	0.63
421	0.59
422	0.5
423	0.43
424	0.4
425	0.32
426	0.28
427	0.26
428	0.23
429	0.17
430	0.15
431	0.13
432	0.13
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.13
437	0.14
438	0.14
439	0.13
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.12
444	0.1
445	0.1
446	0.12
447	0.17
448	0.19
449	0.23
450	0.26
451	0.3
452	0.32
453	0.4
454	0.46
455	0.49
456	0.55
457	0.56
458	0.54
459	0.49
460	0.48
461	0.45
462	0.46
463	0.44
464	0.43
465	0.41
466	0.46
467	0.5
468	0.52
469	0.54
470	0.48
471	0.48
472	0.52
473	0.54
474	0.51
475	0.51
476	0.5
477	0.53
478	0.59
479	0.61
480	0.58
481	0.59
482	0.6
483	0.58
484	0.55
485	0.51
486	0.52
487	0.52
488	0.55
489	0.54
490	0.52
491	0.53
492	0.54
493	0.56
494	0.52
495	0.51
496	0.46
497	0.45
498	0.43
499	0.41
500	0.39
501	0.32
502	0.3
503	0.24
504	0.21
505	0.2
506	0.21
507	0.24
508	0.31
509	0.34
510	0.34
511	0.42
512	0.52
513	0.58
514	0.64
515	0.72
516	0.76
517	0.83
518	0.83
519	0.84
520	0.82
521	0.79
522	0.75
523	0.71
524	0.65
525	0.6
526	0.61
527	0.53
528	0.48
529	0.41
530	0.36
531	0.31
532	0.29
533	0.29
534	0.21
535	0.19
536	0.15
537	0.18
538	0.19
539	0.2
540	0.23
541	0.23
542	0.29
543	0.34
544	0.44
545	0.46
546	0.53
547	0.58
548	0.6
549	0.61
550	0.57
551	0.53
552	0.44
553	0.38
554	0.32
555	0.26
556	0.19
557	0.14
558	0.11
559	0.1
560	0.08
561	0.08
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.03
569	0.03
570	0.06
571	0.09
572	0.1
573	0.15
574	0.17
575	0.25
576	0.32
577	0.38
578	0.45
579	0.52
580	0.62
581	0.63
582	0.65
583	0.63
584	0.59
585	0.55
586	0.47
587	0.4
588	0.32
589	0.32
590	0.29
591	0.24
592	0.22
593	0.22
594	0.22
595	0.21
596	0.2
597	0.17
598	0.18
599	0.18
600	0.21
601	0.2
602	0.21
603	0.22
604	0.21
605	0.2
606	0.22
607	0.22
608	0.21
609	0.24
610	0.22
611	0.23
612	0.26
613	0.29
614	0.31
615	0.33
616	0.36
617	0.36
618	0.38
619	0.38
620	0.38
621	0.35
622	0.34
623	0.34
624	0.35
625	0.32
626	0.33
627	0.32
628	0.32
629	0.32
630	0.31
631	0.31
632	0.27
633	0.29
634	0.27
635	0.28
636	0.24
637	0.26
638	0.25
639	0.22
640	0.24
641	0.21
642	0.2
643	0.2
644	0.2
645	0.16
646	0.15
647	0.15
648	0.11
649	0.1
650	0.1
651	0.09
652	0.08
653	0.1
654	0.13
655	0.14
656	0.14
657	0.16
658	0.2
659	0.21
660	0.22
661	0.25
662	0.26
663	0.33
664	0.39
665	0.45
666	0.46
667	0.55
668	0.63
669	0.64
670	0.63
671	0.56
672	0.5
673	0.45
674	0.49
675	0.45
676	0.39
677	0.37
678	0.35
679	0.35
680	0.33
681	0.32
682	0.25
683	0.19
684	0.17
685	0.18
686	0.21
687	0.22
688	0.23
689	0.29
690	0.31
691	0.3
692	0.34

A0A5N6FF64

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer