Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FJS4

Protein Details
Accession A0A5N6FJS4    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-119PTQAASKPSSRKRKRVAGEDLEHydrophilic
129-154EEQKEEEKRRSEKPKRQKAEDDQEDEAcidic
414-443YPPMLPRKLRVTRAKKQPKKREASGSNQGQHydrophilic
491-522DGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSQRAAAYKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-112SSRKRKR
128-146KEEQKEEEKRRSEKPKRQK
340-345KRKKKK
420-435RKLRVTRAKKQPKKRE
495-531RIRVKTKSRGSKGKPKNRSSQRAAAYKAAGGKKRKTA
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSKSQPENIPQAEKSETSLPFLRGNASVDPALASLFETSAGPVKAPSFPKNTITAGKPTADDDIREDVSESEDGPEDEDQVMQEASDVSIDAGEPTQAASKPSSRKRKRVAGEDLEESYMRRIAKEEQKEEEKRRSEKPKRQKAEDDQEDEVDSTDKSENEDEEDESSEEGGEIVIPQHESRSGEASSSDIDKSNRTVFLSNVSSEAIKSKSAKKALLKHFESFLSTLPESTGPHKVESIRFRSTAFASGGKVPKRAAFAKRDVLDETTPSTNAYVVLSTVQAARKAPAALNGTIVLDRHLRVDSVAHPAPVDNKRCVFVGNLNFVDHESNPDDEEKRKKKKAPADVEEGLWRTFNAHTSKPKDQTSRHGNVESVRVVRDSVTRVSKGFAYVQFYDQNCVEEALLLDGKQYPPMLPRKLRVTRAKKQPKKREASGSNQGQNLREADKTLQGRAGKLFGRAGAAKAKADAAKSISNNSLVFEGHRATDDGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSQRAAAYKAAGGKKRKTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.56
3 0.46
4 0.4
5 0.36
6 0.32
7 0.31
8 0.34
9 0.33
10 0.33
11 0.33
12 0.32
13 0.27
14 0.29
15 0.26
16 0.25
17 0.22
18 0.19
19 0.19
20 0.16
21 0.14
22 0.11
23 0.1
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.15
34 0.21
35 0.26
36 0.31
37 0.32
38 0.36
39 0.39
40 0.42
41 0.44
42 0.44
43 0.42
44 0.43
45 0.4
46 0.38
47 0.35
48 0.32
49 0.34
50 0.3
51 0.27
52 0.24
53 0.26
54 0.25
55 0.25
56 0.24
57 0.18
58 0.2
59 0.19
60 0.16
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.09
87 0.1
88 0.12
89 0.14
90 0.2
91 0.3
92 0.4
93 0.51
94 0.56
95 0.65
96 0.73
97 0.8
98 0.81
99 0.82
100 0.82
101 0.79
102 0.75
103 0.69
104 0.62
105 0.53
106 0.45
107 0.36
108 0.27
109 0.22
110 0.17
111 0.13
112 0.14
113 0.21
114 0.3
115 0.38
116 0.42
117 0.45
118 0.54
119 0.62
120 0.66
121 0.67
122 0.66
123 0.62
124 0.66
125 0.71
126 0.72
127 0.75
128 0.8
129 0.81
130 0.82
131 0.85
132 0.85
133 0.84
134 0.85
135 0.82
136 0.76
137 0.67
138 0.59
139 0.52
140 0.42
141 0.33
142 0.22
143 0.14
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.14
154 0.16
155 0.14
156 0.13
157 0.13
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.05
162 0.04
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.18
188 0.15
189 0.2
190 0.21
191 0.19
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.16
197 0.11
198 0.11
199 0.14
200 0.19
201 0.25
202 0.28
203 0.33
204 0.37
205 0.45
206 0.52
207 0.59
208 0.56
209 0.51
210 0.5
211 0.46
212 0.41
213 0.32
214 0.24
215 0.19
216 0.16
217 0.14
218 0.13
219 0.14
220 0.13
221 0.15
222 0.2
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.24
228 0.29
229 0.33
230 0.29
231 0.29
232 0.29
233 0.29
234 0.28
235 0.26
236 0.21
237 0.17
238 0.15
239 0.2
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.21
244 0.21
245 0.24
246 0.27
247 0.28
248 0.29
249 0.32
250 0.37
251 0.37
252 0.37
253 0.34
254 0.31
255 0.26
256 0.22
257 0.2
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.15
279 0.17
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.1
294 0.1
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.21
301 0.26
302 0.27
303 0.23
304 0.24
305 0.25
306 0.25
307 0.26
308 0.21
309 0.21
310 0.23
311 0.25
312 0.25
313 0.24
314 0.24
315 0.24
316 0.24
317 0.17
318 0.16
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.15
323 0.16
324 0.2
325 0.3
326 0.36
327 0.44
328 0.51
329 0.57
330 0.62
331 0.7
332 0.75
333 0.76
334 0.72
335 0.71
336 0.65
337 0.6
338 0.55
339 0.47
340 0.37
341 0.27
342 0.2
343 0.14
344 0.13
345 0.17
346 0.18
347 0.21
348 0.29
349 0.36
350 0.44
351 0.47
352 0.53
353 0.55
354 0.54
355 0.59
356 0.61
357 0.61
358 0.57
359 0.53
360 0.48
361 0.43
362 0.44
363 0.37
364 0.29
365 0.23
366 0.19
367 0.18
368 0.18
369 0.18
370 0.17
371 0.2
372 0.23
373 0.23
374 0.23
375 0.25
376 0.24
377 0.24
378 0.25
379 0.22
380 0.23
381 0.23
382 0.26
383 0.3
384 0.3
385 0.3
386 0.27
387 0.25
388 0.2
389 0.19
390 0.16
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.09
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.13
401 0.11
402 0.17
403 0.26
404 0.33
405 0.35
406 0.4
407 0.49
408 0.56
409 0.64
410 0.68
411 0.7
412 0.72
413 0.79
414 0.85
415 0.85
416 0.88
417 0.9
418 0.9
419 0.89
420 0.87
421 0.87
422 0.83
423 0.82
424 0.81
425 0.79
426 0.73
427 0.68
428 0.63
429 0.53
430 0.49
431 0.42
432 0.34
433 0.26
434 0.23
435 0.21
436 0.27
437 0.27
438 0.27
439 0.3
440 0.29
441 0.3
442 0.3
443 0.33
444 0.26
445 0.27
446 0.27
447 0.22
448 0.25
449 0.24
450 0.24
451 0.26
452 0.26
453 0.24
454 0.23
455 0.26
456 0.24
457 0.24
458 0.24
459 0.22
460 0.26
461 0.27
462 0.3
463 0.29
464 0.3
465 0.29
466 0.27
467 0.24
468 0.19
469 0.19
470 0.18
471 0.17
472 0.15
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.2
477 0.21
478 0.21
479 0.23
480 0.26
481 0.28
482 0.32
483 0.37
484 0.38
485 0.44
486 0.51
487 0.59
488 0.65
489 0.72
490 0.78
491 0.81
492 0.86
493 0.9
494 0.9
495 0.9
496 0.87
497 0.88
498 0.88
499 0.9
500 0.87
501 0.85
502 0.83
503 0.81
504 0.77
505 0.72
506 0.63
507 0.56
508 0.55
509 0.53
510 0.52
511 0.52