FuNGI

A0A5N6FDV1

Protein Details

Accession

A0A5N6FDV1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-40	RLSACPDLYRPKKKKFSTTKNPTDIKS	Hydrophilic
69-134	PAAILSPEKERKRKHKNKDASSSSPSKKKRKHESNQFTDETAAHDSEKKRKSKKSKDNGKSKQAST	Hydrophilic
446-474	LIKAKEPKGEKEKSKSSKFSKSKKKEKKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
76-100	EKERKRKHKNKDASSSSPSKKKRKH
116-129	KKRKSKKSKDNGKS
448-474	KAKEPKGEKEKSKSSKFSKSKKKEKKK

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 11, cyto_mito 9.166, cyto_nucl 7.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MKLCRMLSSYMKLRLSACPDLYRPKKKKFSTTKNPTDIKSHYNSKVAPIVPLLCAMAVDAMDIDSKPVPAAILSPEKERKRKHKNKDASSSSPSKKKRKHESNQFTDETAAHDSEKKRKSKKSKDNGKSKQASTGEATIPGSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHAKASLLAEHLSPLLLTYYPPLRGIVLAYSDASISSTPPSSSSSSDPADPNPKPLTVAKTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVALNLFSVGIERKRLPSNWKWLPPGEEGSVNGDKKTAASTTASEDDDLEPSASFNPEKEHFNPVSLANPISDTLNEEANAEDDESPAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDIDVIPGSERDRSFLSIEGTMLSPEDEVRVLEDERNGILTSSATPRRGHSQEPRASMSGALAAPVPAAVAEPETLIKAKEPKGEKEKSKSSKFSKSKKKEKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.48
3	0.47
4	0.43
5	0.4
6	0.43
7	0.52
8	0.6
9	0.65
10	0.67
11	0.7
12	0.77
13	0.79
14	0.86
15	0.86
16	0.88
17	0.88
18	0.9
19	0.9
20	0.89
21	0.87
22	0.79
23	0.75
24	0.68
25	0.64
26	0.6
27	0.58
28	0.53
29	0.53
30	0.51
31	0.49
32	0.51
33	0.45
34	0.39
35	0.33
36	0.31
37	0.25
38	0.25
39	0.21
40	0.14
41	0.13
42	0.11
43	0.08
44	0.06
45	0.06
46	0.05
47	0.05
48	0.06
49	0.06
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.07
57	0.09
58	0.12
59	0.19
60	0.2
61	0.28
62	0.36
63	0.44
64	0.52
65	0.6
66	0.65
67	0.7
68	0.79
69	0.83
70	0.85
71	0.88
72	0.91
73	0.92
74	0.9
75	0.86
76	0.83
77	0.81
78	0.77
79	0.75
80	0.74
81	0.74
82	0.74
83	0.77
84	0.81
85	0.83
86	0.87
87	0.89
88	0.91
89	0.9
90	0.89
91	0.8
92	0.7
93	0.6
94	0.49
95	0.41
96	0.32
97	0.23
98	0.16
99	0.2
100	0.23
101	0.31
102	0.38
103	0.44
104	0.5
105	0.59
106	0.69
107	0.75
108	0.83
109	0.85
110	0.88
111	0.9
112	0.93
113	0.92
114	0.91
115	0.87
116	0.77
117	0.75
118	0.65
119	0.57
120	0.49
121	0.44
122	0.34
123	0.28
124	0.28
125	0.2
126	0.19
127	0.16
128	0.13
129	0.09
130	0.08
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.09
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.09
146	0.09
147	0.11
148	0.14
149	0.16
150	0.16
151	0.17
152	0.17
153	0.15
154	0.17
155	0.18
156	0.17
157	0.15
158	0.14
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.09
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.07
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.09
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.06
184	0.05
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.1
190	0.12
191	0.14
192	0.15
193	0.18
194	0.18
195	0.21
196	0.21
197	0.21
198	0.26
199	0.24
200	0.27
201	0.24
202	0.23
203	0.23
204	0.24
205	0.26
206	0.21
207	0.24
208	0.19
209	0.2
210	0.2
211	0.18
212	0.16
213	0.11
214	0.08
215	0.06
216	0.05
217	0.04
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.14
230	0.15
231	0.18
232	0.18
233	0.19
234	0.14
235	0.2
236	0.2
237	0.18
238	0.17
239	0.16
240	0.15
241	0.14
242	0.12
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.02
257	0.03
258	0.05
259	0.06
260	0.08
261	0.1
262	0.13
263	0.16
264	0.19
265	0.26
266	0.31
267	0.4
268	0.45
269	0.49
270	0.49
271	0.48
272	0.49
273	0.45
274	0.41
275	0.32
276	0.26
277	0.21
278	0.24
279	0.27
280	0.23
281	0.21
282	0.18
283	0.16
284	0.16
285	0.17
286	0.12
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.14
291	0.17
292	0.17
293	0.15
294	0.16
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.11
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.12
306	0.14
307	0.18
308	0.2
309	0.26
310	0.25
311	0.27
312	0.28
313	0.24
314	0.25
315	0.21
316	0.2
317	0.13
318	0.13
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.1
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.07
337	0.07
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.08
344	0.12
345	0.14
346	0.16
347	0.16
348	0.19
349	0.2
350	0.28
351	0.32
352	0.35
353	0.37
354	0.36
355	0.36
356	0.36
357	0.35
358	0.3
359	0.25
360	0.22
361	0.17
362	0.16
363	0.16
364	0.13
365	0.14
366	0.16
367	0.15
368	0.14
369	0.16
370	0.18
371	0.19
372	0.21
373	0.22
374	0.18
375	0.19
376	0.17
377	0.16
378	0.13
379	0.12
380	0.1
381	0.08
382	0.07
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.11
388	0.12
389	0.14
390	0.15
391	0.15
392	0.15
393	0.17
394	0.15
395	0.13
396	0.12
397	0.1
398	0.12
399	0.19
400	0.23
401	0.25
402	0.26
403	0.29
404	0.37
405	0.4
406	0.45
407	0.48
408	0.54
409	0.58
410	0.62
411	0.64
412	0.57
413	0.54
414	0.46
415	0.36
416	0.3
417	0.23
418	0.18
419	0.13
420	0.11
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.04
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.11
433	0.11
434	0.15
435	0.21
436	0.25
437	0.33
438	0.37
439	0.45
440	0.55
441	0.64
442	0.68
443	0.71
444	0.77
445	0.79
446	0.83
447	0.83
448	0.81
449	0.83
450	0.84
451	0.85
452	0.86
453	0.87
454	0.89

A0A5N6FDV1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer