Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VKU0

Protein Details
Accession H1VKU0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-97VVDTGSRGRKRKRKEDETDASTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-88RGRKRKRK
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 11, cyto 9.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR014816  tRNA_MeTrfase_Gcd14  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08704  GCD14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51620  SAM_TRM61  
Amino Acid Sequences MAKPSPFLEPGPRTTANSLAIVQLSRDNLVPLILHDSASAVDGYAEGAVLNTRFGSFPHSTLINVPWGSQIRASVVDTGSRGRKRKRKEDETDASTPAAAXAADDAETESSAPAKKATAAASGFIHILQPTAELWTAGLPHRTQVVYTPDYSYILQRIRARPGTRLIEAXAGSGSFSHASARAVYNGYPENETQRRGKVYSFEFNKDRYEKMEEEIQAHALEGIVKLSHRDVYNGGFLVDGKSPEAEAVFLXLPAPWEALQHLARRKPAATSNKDGQATTEEWVSPLNPKKSVYICTFSPCIEQVQKTINTMRTMGWVDIDMVEISHKKFNVIRDRAGYGQPERGIPPIARDVNEAVGKLREIERRTREYHNTADPNSAEDSPAAGNAMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.38
4 0.35
5 0.31
6 0.25
7 0.25
8 0.21
9 0.2
10 0.19
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.11
19 0.15
20 0.15
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.14
26 0.12
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.04
34 0.04
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.19
46 0.2
47 0.2
48 0.22
49 0.24
50 0.23
51 0.21
52 0.2
53 0.22
54 0.24
55 0.24
56 0.22
57 0.21
58 0.17
59 0.19
60 0.2
61 0.17
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.21
66 0.27
67 0.31
68 0.38
69 0.45
70 0.53
71 0.61
72 0.71
73 0.77
74 0.8
75 0.82
76 0.85
77 0.85
78 0.84
79 0.78
80 0.69
81 0.58
82 0.47
83 0.37
84 0.27
85 0.18
86 0.1
87 0.06
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.12
103 0.13
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.14
111 0.13
112 0.08
113 0.08
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.15
131 0.2
132 0.19
133 0.2
134 0.21
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.2
142 0.24
143 0.26
144 0.31
145 0.37
146 0.37
147 0.36
148 0.41
149 0.4
150 0.35
151 0.33
152 0.28
153 0.22
154 0.21
155 0.18
156 0.11
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.18
176 0.19
177 0.21
178 0.21
179 0.22
180 0.23
181 0.23
182 0.24
183 0.22
184 0.24
185 0.3
186 0.31
187 0.33
188 0.33
189 0.34
190 0.38
191 0.35
192 0.31
193 0.26
194 0.28
195 0.24
196 0.24
197 0.27
198 0.24
199 0.24
200 0.23
201 0.21
202 0.16
203 0.15
204 0.13
205 0.08
206 0.07
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.1
244 0.13
245 0.18
246 0.24
247 0.26
248 0.29
249 0.31
250 0.31
251 0.3
252 0.36
253 0.41
254 0.42
255 0.45
256 0.48
257 0.52
258 0.52
259 0.49
260 0.41
261 0.35
262 0.3
263 0.24
264 0.2
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.13
269 0.16
270 0.23
271 0.25
272 0.26
273 0.27
274 0.32
275 0.35
276 0.4
277 0.38
278 0.34
279 0.32
280 0.34
281 0.35
282 0.31
283 0.3
284 0.25
285 0.25
286 0.25
287 0.25
288 0.23
289 0.29
290 0.29
291 0.3
292 0.35
293 0.34
294 0.31
295 0.31
296 0.29
297 0.26
298 0.27
299 0.24
300 0.2
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.1
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.16
311 0.16
312 0.18
313 0.21
314 0.3
315 0.38
316 0.41
317 0.45
318 0.45
319 0.49
320 0.5
321 0.5
322 0.47
323 0.39
324 0.4
325 0.36
326 0.34
327 0.31
328 0.3
329 0.3
330 0.25
331 0.27
332 0.29
333 0.31
334 0.3
335 0.31
336 0.31
337 0.33
338 0.34
339 0.3
340 0.23
341 0.22
342 0.21
343 0.21
344 0.25
345 0.26
346 0.29
347 0.38
348 0.44
349 0.49
350 0.54
351 0.59
352 0.62
353 0.61
354 0.65
355 0.65
356 0.64
357 0.59
358 0.61
359 0.53
360 0.47
361 0.44
362 0.37
363 0.28
364 0.21
365 0.21
366 0.16
367 0.16