FuNGI

A0A5N6FRJ1

Protein Details

Accession

A0A5N6FRJ1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MPSDKVEKKRKRASNGHERPSKKP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-23	EKKRKRASNGHERPSKK
488-495	KVSRGGKR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 10.333, cyto 7.5, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSDKVEKKRKRASNGHERPSKKPALELQDLPPLAVSVLDDDSELAPVIVTTPGVNAPQNLRLKPYLKDRAHGPSPGRSTRNKGIVSSELLLQTSEHPKMDFVGREAEDDADSQLKHYIAVVDPEKKSWQFVEVRKLTLRGAVRRIKVAAEEEEEVESEDEEMKTLRAQRTELTNTFGTKQSRKAAQSMAENAQLSNAPAGAASAAESAILSSMPLDSATDIATKTAAVQAQVQANKPLPQANLAASHPSDVYPIDVLVPGGLSTLQQLPGINVWEEAVSSGQAVATTSQYVSRRLEAVVNSTNATQIQILRFIFLLFEFSRALRSGNLKSSSGPGSKRLPPREELRRILSSPTGAESDTTETLPDPVIDAIRRKFAPQGSYLTKNDVTYLHTTICALSLLIPPQPAKDGGSSSQGGNAPNELATDPSDLRDDLRVESTAILQYFRELGCRIDKPRESEFAKWNIKGGKAEANTRRVARLRVPVEFPKVSRGGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.89
2	0.89
3	0.89
4	0.88
5	0.83
6	0.79
7	0.78
8	0.75
9	0.64
10	0.6
11	0.58
12	0.58
13	0.6
14	0.57
15	0.53
16	0.53
17	0.52
18	0.45
19	0.37
20	0.29
21	0.22
22	0.18
23	0.14
24	0.08
25	0.09
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.1
30	0.1
31	0.1
32	0.07
33	0.06
34	0.06
35	0.07
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.09
41	0.11
42	0.12
43	0.14
44	0.16
45	0.24
46	0.3
47	0.3
48	0.33
49	0.37
50	0.39
51	0.42
52	0.49
53	0.52
54	0.48
55	0.5
56	0.51
57	0.54
58	0.55
59	0.56
60	0.49
61	0.47
62	0.52
63	0.56
64	0.56
65	0.52
66	0.56
67	0.58
68	0.63
69	0.56
70	0.5
71	0.47
72	0.46
73	0.45
74	0.39
75	0.33
76	0.25
77	0.24
78	0.22
79	0.18
80	0.19
81	0.21
82	0.21
83	0.19
84	0.19
85	0.19
86	0.21
87	0.25
88	0.22
89	0.18
90	0.23
91	0.23
92	0.24
93	0.25
94	0.23
95	0.19
96	0.18
97	0.17
98	0.13
99	0.12
100	0.12
101	0.13
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.13
106	0.11
107	0.17
108	0.2
109	0.24
110	0.25
111	0.27
112	0.3
113	0.28
114	0.29
115	0.24
116	0.27
117	0.28
118	0.32
119	0.41
120	0.4
121	0.43
122	0.43
123	0.43
124	0.37
125	0.35
126	0.35
127	0.3
128	0.36
129	0.39
130	0.39
131	0.4
132	0.41
133	0.36
134	0.33
135	0.31
136	0.25
137	0.21
138	0.2
139	0.18
140	0.18
141	0.17
142	0.16
143	0.13
144	0.1
145	0.08
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.09
152	0.14
153	0.17
154	0.17
155	0.18
156	0.2
157	0.27
158	0.32
159	0.31
160	0.3
161	0.29
162	0.28
163	0.29
164	0.32
165	0.29
166	0.26
167	0.3
168	0.31
169	0.36
170	0.36
171	0.37
172	0.36
173	0.36
174	0.37
175	0.37
176	0.33
177	0.3
178	0.28
179	0.25
180	0.22
181	0.18
182	0.15
183	0.1
184	0.08
185	0.05
186	0.04
187	0.05
188	0.04
189	0.03
190	0.04
191	0.04
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.1
218	0.14
219	0.16
220	0.16
221	0.17
222	0.17
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.15
230	0.16
231	0.14
232	0.15
233	0.12
234	0.13
235	0.11
236	0.1
237	0.09
238	0.07
239	0.07
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.09
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.09
277	0.11
278	0.14
279	0.15
280	0.15
281	0.16
282	0.16
283	0.19
284	0.15
285	0.19
286	0.19
287	0.19
288	0.18
289	0.17
290	0.17
291	0.14
292	0.14
293	0.11
294	0.09
295	0.09
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.11
302	0.09
303	0.12
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.12
309	0.12
310	0.13
311	0.12
312	0.16
313	0.18
314	0.24
315	0.26
316	0.25
317	0.25
318	0.28
319	0.3
320	0.3
321	0.28
322	0.26
323	0.29
324	0.36
325	0.44
326	0.47
327	0.46
328	0.47
329	0.54
330	0.59
331	0.62
332	0.59
333	0.57
334	0.54
335	0.52
336	0.5
337	0.43
338	0.34
339	0.27
340	0.24
341	0.19
342	0.14
343	0.14
344	0.13
345	0.15
346	0.14
347	0.14
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.1
353	0.08
354	0.07
355	0.09
356	0.11
357	0.16
358	0.17
359	0.22
360	0.23
361	0.23
362	0.27
363	0.29
364	0.31
365	0.29
366	0.35
367	0.36
368	0.42
369	0.41
370	0.42
371	0.39
372	0.36
373	0.34
374	0.27
375	0.25
376	0.22
377	0.24
378	0.19
379	0.18
380	0.18
381	0.17
382	0.16
383	0.12
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.12
388	0.13
389	0.15
390	0.15
391	0.15
392	0.17
393	0.16
394	0.16
395	0.16
396	0.18
397	0.18
398	0.23
399	0.23
400	0.21
401	0.25
402	0.26
403	0.25
404	0.22
405	0.21
406	0.17
407	0.16
408	0.17
409	0.12
410	0.11
411	0.11
412	0.14
413	0.13
414	0.14
415	0.16
416	0.15
417	0.16
418	0.19
419	0.19
420	0.18
421	0.2
422	0.19
423	0.18
424	0.19
425	0.19
426	0.19
427	0.18
428	0.17
429	0.14
430	0.14
431	0.16
432	0.16
433	0.17
434	0.14
435	0.17
436	0.23
437	0.29
438	0.33
439	0.4
440	0.45
441	0.48
442	0.52
443	0.58
444	0.55
445	0.56
446	0.58
447	0.59
448	0.62
449	0.56
450	0.57
451	0.53
452	0.52
453	0.48
454	0.44
455	0.43
456	0.39
457	0.48
458	0.5
459	0.51
460	0.53
461	0.52
462	0.56
463	0.51
464	0.53
465	0.5
466	0.53
467	0.52
468	0.52
469	0.56
470	0.56
471	0.6
472	0.59
473	0.53
474	0.5
475	0.52

A0A5N6FRJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer