Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V2T6

Protein Details
Accession H1V2T6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-260YLTSKEQKKLRRQRRMAELKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-255KKLRRQRRM
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG chig:CH63R_12828  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MDRRPDSTGLGPRHDPNSRVTKPESAADKMAALKARVAAAIGGTKAKGGLNVGLHPVLEGLGQAKPPGRTGDAKPSGSRSQFESGSATASSYRMPDKSGRGRDGPQSNPYFNEQLAAQPAGGKQRQARPLHFHPKGKFIQQAAALRRQAALEEMKKRIAAQTRKAGIEDELDMEKNLVIEPPPDIEWFDEGLVDGTYDNIGDEARLKINKEDTIVTEYIQHPVALEPPQEKNAPAVKPMYLTSKEQKKLRRQRRMAELKEQQAKIRLGLVPAPPPKVKKSNMMRVYADSAVKDPTAVENLVNRQIAERQQNHLQTNEERKLTKEEKHDKLATNQEKDAAKGIHVLVLKINSLANGQHRFKIQKNAEQHALTGICIMHPKMNLVIVEGGEHSIRKYKRLMLDRIDWTENTPSREGNTQKQMREWLVAENEKGDLKDMSHNECKLVFEGEEKTRAFRKWGNKVCESDAEAKDALTRAKMENFWALAKTM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.47
3 0.46
4 0.51
5 0.49
6 0.51
7 0.5
8 0.5
9 0.48
10 0.54
11 0.52
12 0.45
13 0.44
14 0.4
15 0.38
16 0.33
17 0.34
18 0.3
19 0.26
20 0.23
21 0.23
22 0.23
23 0.2
24 0.18
25 0.15
26 0.13
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.15
37 0.16
38 0.18
39 0.21
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.12
45 0.1
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.11
51 0.14
52 0.15
53 0.17
54 0.2
55 0.22
56 0.26
57 0.31
58 0.4
59 0.44
60 0.46
61 0.46
62 0.49
63 0.52
64 0.49
65 0.46
66 0.4
67 0.38
68 0.35
69 0.35
70 0.32
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.18
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.16
80 0.14
81 0.17
82 0.21
83 0.29
84 0.38
85 0.45
86 0.47
87 0.49
88 0.52
89 0.57
90 0.6
91 0.55
92 0.54
93 0.52
94 0.48
95 0.47
96 0.47
97 0.4
98 0.33
99 0.29
100 0.21
101 0.18
102 0.2
103 0.18
104 0.13
105 0.13
106 0.15
107 0.21
108 0.22
109 0.23
110 0.25
111 0.33
112 0.41
113 0.44
114 0.48
115 0.5
116 0.58
117 0.66
118 0.67
119 0.67
120 0.61
121 0.64
122 0.62
123 0.59
124 0.54
125 0.45
126 0.42
127 0.4
128 0.45
129 0.41
130 0.45
131 0.41
132 0.36
133 0.35
134 0.3
135 0.25
136 0.21
137 0.23
138 0.22
139 0.27
140 0.28
141 0.29
142 0.29
143 0.29
144 0.31
145 0.34
146 0.35
147 0.37
148 0.44
149 0.47
150 0.48
151 0.48
152 0.43
153 0.35
154 0.3
155 0.23
156 0.16
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.05
190 0.06
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.19
201 0.19
202 0.17
203 0.18
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.15
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.15
216 0.16
217 0.15
218 0.17
219 0.21
220 0.2
221 0.2
222 0.19
223 0.17
224 0.18
225 0.19
226 0.2
227 0.17
228 0.19
229 0.24
230 0.31
231 0.36
232 0.4
233 0.47
234 0.53
235 0.62
236 0.69
237 0.73
238 0.71
239 0.74
240 0.8
241 0.83
242 0.76
243 0.75
244 0.7
245 0.66
246 0.67
247 0.61
248 0.51
249 0.47
250 0.43
251 0.34
252 0.3
253 0.24
254 0.17
255 0.2
256 0.2
257 0.21
258 0.22
259 0.25
260 0.24
261 0.26
262 0.3
263 0.33
264 0.34
265 0.37
266 0.43
267 0.5
268 0.54
269 0.56
270 0.53
271 0.48
272 0.49
273 0.42
274 0.34
275 0.24
276 0.19
277 0.16
278 0.14
279 0.12
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.13
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.15
291 0.17
292 0.22
293 0.27
294 0.28
295 0.28
296 0.34
297 0.4
298 0.41
299 0.39
300 0.38
301 0.35
302 0.41
303 0.41
304 0.38
305 0.33
306 0.33
307 0.4
308 0.41
309 0.41
310 0.43
311 0.48
312 0.51
313 0.58
314 0.6
315 0.55
316 0.56
317 0.61
318 0.58
319 0.52
320 0.47
321 0.45
322 0.41
323 0.4
324 0.38
325 0.28
326 0.2
327 0.2
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.09
338 0.09
339 0.11
340 0.16
341 0.23
342 0.24
343 0.26
344 0.3
345 0.34
346 0.38
347 0.46
348 0.45
349 0.45
350 0.5
351 0.53
352 0.55
353 0.51
354 0.47
355 0.41
356 0.36
357 0.28
358 0.22
359 0.17
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.13
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.13
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.16
379 0.17
380 0.19
381 0.23
382 0.29
383 0.37
384 0.45
385 0.52
386 0.5
387 0.58
388 0.61
389 0.62
390 0.58
391 0.5
392 0.44
393 0.45
394 0.42
395 0.38
396 0.34
397 0.29
398 0.29
399 0.36
400 0.38
401 0.38
402 0.45
403 0.48
404 0.48
405 0.51
406 0.55
407 0.49
408 0.49
409 0.42
410 0.37
411 0.38
412 0.38
413 0.35
414 0.3
415 0.3
416 0.27
417 0.26
418 0.22
419 0.15
420 0.14
421 0.22
422 0.24
423 0.3
424 0.36
425 0.36
426 0.36
427 0.37
428 0.37
429 0.3
430 0.29
431 0.22
432 0.19
433 0.25
434 0.26
435 0.31
436 0.3
437 0.33
438 0.35
439 0.36
440 0.39
441 0.4
442 0.46
443 0.52
444 0.61
445 0.65
446 0.66
447 0.69
448 0.68
449 0.66
450 0.61
451 0.59
452 0.5
453 0.46
454 0.39
455 0.35
456 0.33
457 0.3
458 0.27
459 0.21
460 0.22
461 0.22
462 0.27
463 0.28
464 0.29
465 0.32
466 0.33
467 0.32