Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R1U2

Protein Details
Accession C4R1U2    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-88ILAAIEKRRRRRTDANSDSGYHydrophilic
138-161VDQERRKKKTAFEARKKRKKLASABasic
531-551YGNNRCTQRARIRRGLKVLGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-158RRKKKTAFEARKKRKKL
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.333, cyto 5.5, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006553  Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031463  C:Cul3-RING ubiquitin ligase complex  
GO:0000113  C:nucleotide-excision repair factor 4 complex  
GO:0008094  F:ATP-dependent activity, acting on DNA  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0070911  P:global genome nucleotide-excision repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0008104  P:protein localization  
GO:0009411  P:response to UV  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0443  -  
Amino Acid Sequences MSRRRADKKENEPEVRGPNSALTAFLREQGIDAGAIRRRYEQSLLTERNEQTSHLHEQEEPFQENEIILAAIEKRRRRRTDANSDSGYSDSSFSSDDVKDSHYCMNCDREFKITVYSKKLEKDGKVGYLCTECTRFQVDQERRKKKTAFEARKKRKKLASALLNRQELKIPSLQDICIKLLSKHIDDVHALGDISVVSLNKISRILSKNRSLNNRTMMLFLDVTLKHLEFWDCSNIDMAYLDKITAFCPKLESMTLNMCGQLHNSNLISFAQNLLDLNSIVLNGPFLISEPTWVQFFELMNARLKLFHVSNTHRFSGDSLQSLLTNCGTSLESLSLSRLDGLMSKAAYDVLPYHLRNLKHLDLSNPFKENLIDDNLIMSILSVNGESIETLLLDGCSGLTDLFLVKGVKRYCSSLKRISLESLDQVTDSGLTQLFGGWTINSGLIEVNLKRCFGLGDRGILTFLNHSASSLVSLNLNSVYSLSHTLFQTLSRTLKLPLLTALDLGFVRSVDDKAIAILSRICPKLKELEVYGNNRCTQRARIRRGLKVLGRQSDSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.68
3 0.58
4 0.48
5 0.39
6 0.36
7 0.31
8 0.26
9 0.2
10 0.22
11 0.21
12 0.23
13 0.22
14 0.19
15 0.19
16 0.18
17 0.17
18 0.13
19 0.13
20 0.16
21 0.2
22 0.22
23 0.23
24 0.26
25 0.29
26 0.32
27 0.35
28 0.34
29 0.38
30 0.46
31 0.49
32 0.48
33 0.53
34 0.5
35 0.51
36 0.46
37 0.39
38 0.33
39 0.33
40 0.37
41 0.31
42 0.32
43 0.29
44 0.32
45 0.38
46 0.4
47 0.37
48 0.3
49 0.29
50 0.28
51 0.25
52 0.22
53 0.15
54 0.1
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.14
59 0.21
60 0.28
61 0.37
62 0.48
63 0.54
64 0.61
65 0.69
66 0.75
67 0.8
68 0.82
69 0.8
70 0.74
71 0.69
72 0.62
73 0.52
74 0.42
75 0.32
76 0.23
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.11
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.18
86 0.18
87 0.2
88 0.26
89 0.24
90 0.26
91 0.28
92 0.35
93 0.34
94 0.37
95 0.35
96 0.33
97 0.33
98 0.32
99 0.37
100 0.36
101 0.39
102 0.42
103 0.45
104 0.45
105 0.46
106 0.52
107 0.5
108 0.45
109 0.47
110 0.44
111 0.46
112 0.44
113 0.41
114 0.37
115 0.32
116 0.31
117 0.26
118 0.25
119 0.19
120 0.2
121 0.24
122 0.22
123 0.24
124 0.33
125 0.4
126 0.47
127 0.57
128 0.65
129 0.64
130 0.71
131 0.71
132 0.66
133 0.68
134 0.69
135 0.7
136 0.71
137 0.78
138 0.82
139 0.89
140 0.89
141 0.86
142 0.82
143 0.79
144 0.77
145 0.75
146 0.75
147 0.74
148 0.78
149 0.77
150 0.75
151 0.67
152 0.58
153 0.52
154 0.42
155 0.35
156 0.29
157 0.23
158 0.22
159 0.23
160 0.23
161 0.23
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.17
167 0.21
168 0.23
169 0.21
170 0.23
171 0.22
172 0.21
173 0.21
174 0.21
175 0.16
176 0.14
177 0.12
178 0.09
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.14
191 0.19
192 0.26
193 0.31
194 0.39
195 0.44
196 0.49
197 0.57
198 0.54
199 0.55
200 0.53
201 0.5
202 0.43
203 0.37
204 0.32
205 0.26
206 0.22
207 0.17
208 0.16
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.09
217 0.11
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.05
275 0.04
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.12
294 0.15
295 0.18
296 0.23
297 0.31
298 0.35
299 0.35
300 0.32
301 0.32
302 0.3
303 0.3
304 0.26
305 0.2
306 0.17
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.11
312 0.09
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.14
339 0.14
340 0.19
341 0.23
342 0.23
343 0.26
344 0.31
345 0.29
346 0.29
347 0.3
348 0.3
349 0.32
350 0.38
351 0.39
352 0.35
353 0.32
354 0.28
355 0.28
356 0.25
357 0.21
358 0.19
359 0.16
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.09
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.15
394 0.16
395 0.19
396 0.21
397 0.25
398 0.32
399 0.39
400 0.45
401 0.47
402 0.53
403 0.53
404 0.54
405 0.52
406 0.46
407 0.4
408 0.36
409 0.3
410 0.23
411 0.2
412 0.18
413 0.15
414 0.12
415 0.1
416 0.08
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.05
425 0.06
426 0.07
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.11
433 0.11
434 0.17
435 0.18
436 0.18
437 0.18
438 0.18
439 0.18
440 0.17
441 0.24
442 0.2
443 0.23
444 0.24
445 0.25
446 0.25
447 0.24
448 0.22
449 0.15
450 0.14
451 0.12
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.13
469 0.13
470 0.16
471 0.16
472 0.17
473 0.18
474 0.19
475 0.2
476 0.21
477 0.23
478 0.21
479 0.22
480 0.23
481 0.26
482 0.26
483 0.23
484 0.22
485 0.23
486 0.22
487 0.21
488 0.19
489 0.17
490 0.16
491 0.15
492 0.13
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.1
498 0.12
499 0.11
500 0.11
501 0.13
502 0.12
503 0.12
504 0.15
505 0.18
506 0.24
507 0.27
508 0.28
509 0.27
510 0.3
511 0.37
512 0.37
513 0.38
514 0.35
515 0.43
516 0.49
517 0.55
518 0.59
519 0.56
520 0.56
521 0.52
522 0.51
523 0.45
524 0.47
525 0.51
526 0.55
527 0.59
528 0.65
529 0.72
530 0.77
531 0.81
532 0.81
533 0.78
534 0.77
535 0.77
536 0.75