Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5F3J1

Protein Details
Accession A0A5J5F3J1    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-50VTRHADVKAPAKRQKKPTPSATTKTKSKHydrophilic
53-78ALPPRSPSPPLKKRWKDEPPHNYTLAHydrophilic
316-338FEEGEKRRQKREYRATRKAMFQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-68KAPAKRQKKPTPSATTKTKSKTPALPPRSPSPPLKKRWK
320-327EKRRQKRE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MTYSDSDSPLSSPPESEDEAPAVTRHADVKAPAKRQKKPTPSATTKTKSKTPALPPRSPSPPLKKRWKDEPPHNYTLADVPELAFIVMFRSRFSDAFKGVPNLGCQDLERGIVDSTPSEQVEQLLCGLISLCLNRKKPVEYVLALTAQLLSKLRRGHHNRALEESLHTYQSQWPRSWEGRNPMSGGKHFGDLDTAGRLAVLKALINWALNSSEQIRAIIANNYTSSRREDDFNVGLSVQPYGRDGQKRKYWMIEGRDDTPFRLYREKATSPRTRDWISVAGTIDELRAVATELEADDGTKPALAVKKKIEGDIPRFEEGEKRRQKREYRATRKAMFQQPSGMSLYEGRTRGKRIKYTFSDHEDDNASSFDDSRSRRSGRSTRATPLPTAGAPTPDQPRFTASGRQIRKPQTGLYGES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.27
4 0.26
5 0.23
6 0.24
7 0.24
8 0.21
9 0.17
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.17
15 0.2
16 0.29
17 0.36
18 0.44
19 0.51
20 0.58
21 0.65
22 0.73
23 0.8
24 0.81
25 0.82
26 0.84
27 0.86
28 0.86
29 0.85
30 0.85
31 0.82
32 0.8
33 0.76
34 0.72
35 0.68
36 0.66
37 0.67
38 0.67
39 0.71
40 0.71
41 0.73
42 0.71
43 0.72
44 0.72
45 0.68
46 0.66
47 0.66
48 0.67
49 0.69
50 0.76
51 0.78
52 0.78
53 0.84
54 0.85
55 0.84
56 0.86
57 0.87
58 0.84
59 0.81
60 0.75
61 0.64
62 0.55
63 0.49
64 0.39
65 0.29
66 0.2
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.08
72 0.06
73 0.08
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.15
79 0.16
80 0.2
81 0.23
82 0.23
83 0.26
84 0.28
85 0.28
86 0.28
87 0.29
88 0.26
89 0.23
90 0.22
91 0.19
92 0.17
93 0.17
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.09
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.13
119 0.19
120 0.21
121 0.25
122 0.27
123 0.29
124 0.3
125 0.34
126 0.34
127 0.29
128 0.3
129 0.29
130 0.27
131 0.24
132 0.22
133 0.17
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.09
138 0.12
139 0.16
140 0.18
141 0.28
142 0.36
143 0.44
144 0.51
145 0.57
146 0.55
147 0.56
148 0.56
149 0.47
150 0.4
151 0.35
152 0.28
153 0.22
154 0.2
155 0.16
156 0.2
157 0.26
158 0.27
159 0.24
160 0.25
161 0.3
162 0.34
163 0.37
164 0.37
165 0.38
166 0.37
167 0.38
168 0.37
169 0.34
170 0.33
171 0.29
172 0.28
173 0.21
174 0.2
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.09
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.22
218 0.22
219 0.22
220 0.2
221 0.17
222 0.16
223 0.14
224 0.13
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.13
230 0.2
231 0.23
232 0.3
233 0.35
234 0.4
235 0.41
236 0.42
237 0.43
238 0.42
239 0.44
240 0.44
241 0.41
242 0.4
243 0.42
244 0.39
245 0.35
246 0.33
247 0.29
248 0.25
249 0.28
250 0.26
251 0.27
252 0.34
253 0.39
254 0.41
255 0.47
256 0.53
257 0.53
258 0.57
259 0.57
260 0.52
261 0.47
262 0.44
263 0.4
264 0.34
265 0.31
266 0.26
267 0.21
268 0.19
269 0.18
270 0.15
271 0.1
272 0.08
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.14
290 0.16
291 0.21
292 0.24
293 0.32
294 0.33
295 0.35
296 0.38
297 0.39
298 0.43
299 0.47
300 0.48
301 0.42
302 0.41
303 0.4
304 0.41
305 0.39
306 0.43
307 0.44
308 0.46
309 0.52
310 0.6
311 0.68
312 0.71
313 0.78
314 0.79
315 0.8
316 0.84
317 0.86
318 0.82
319 0.8
320 0.79
321 0.77
322 0.69
323 0.6
324 0.57
325 0.49
326 0.47
327 0.42
328 0.33
329 0.25
330 0.23
331 0.24
332 0.23
333 0.24
334 0.25
335 0.27
336 0.33
337 0.4
338 0.46
339 0.51
340 0.52
341 0.6
342 0.63
343 0.68
344 0.69
345 0.68
346 0.64
347 0.55
348 0.53
349 0.46
350 0.4
351 0.33
352 0.25
353 0.19
354 0.16
355 0.16
356 0.15
357 0.18
358 0.2
359 0.25
360 0.32
361 0.34
362 0.37
363 0.46
364 0.53
365 0.56
366 0.64
367 0.63
368 0.63
369 0.68
370 0.68
371 0.61
372 0.55
373 0.49
374 0.39
375 0.38
376 0.32
377 0.27
378 0.25
379 0.29
380 0.34
381 0.34
382 0.35
383 0.32
384 0.35
385 0.36
386 0.38
387 0.41
388 0.41
389 0.48
390 0.53
391 0.6
392 0.64
393 0.68
394 0.72
395 0.67
396 0.62
397 0.61