Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5F247

Protein Details
Accession A0A5J5F247    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-276YDDAGPKRKRTRSRSRSRSPRRRSPPPRRRRSPQGLFPDSRRRSRSPRRNRGVELFBasic
399-422SDSMGSSSRRHRGRRGRKKADEFMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-271PKRKRTRSRSRSRSPRRRSPPPRRRRSPQGLFPDSRRRSRSPRRNR
407-417RRHRGRRGRKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MSAFGAPLQAMAMPNIQVDDDDILMDYEDEVPTELSAAPPADAMTMDAPEAPRFVDEEVIAPERVHLRGVDNLNTAQIKAYASEHFPTPPQRLEWIDDTSLNLVYENPALARAALAMLSEQAAAEELPLLQLRFTKPFSQSPDSRLSARIARPTDRKEPGARERSRYYLFHPEEDRGERRERHPRSHNSRERERGDYSRRYYDSREDGVRRRNEEFAEDMYDDAGPKRKRTRSRSRSRSPRRRSPPPRRRRSPQGLFPDSRRRSRSPRRNRGVELFPEYTSSSRSTSRPKELFPEKTSGSKELFPESTTRSSAAMDAYPIYTNTHTYNPSPPAAPRELFPASKPMANSNPFATKLPKSLAERITMPAKSLAERISLHPSPNDDLFAEKMAGAKGEALYSDSMGSSSRRHRGRRGRKKADEFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.16
46 0.18
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.15
54 0.15
55 0.21
56 0.25
57 0.26
58 0.26
59 0.26
60 0.29
61 0.28
62 0.26
63 0.19
64 0.17
65 0.14
66 0.13
67 0.15
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.21
74 0.25
75 0.27
76 0.28
77 0.27
78 0.29
79 0.31
80 0.34
81 0.34
82 0.33
83 0.3
84 0.27
85 0.27
86 0.24
87 0.22
88 0.17
89 0.14
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.09
119 0.11
120 0.14
121 0.17
122 0.2
123 0.24
124 0.29
125 0.36
126 0.4
127 0.41
128 0.42
129 0.46
130 0.44
131 0.42
132 0.38
133 0.34
134 0.33
135 0.33
136 0.35
137 0.31
138 0.35
139 0.4
140 0.44
141 0.5
142 0.47
143 0.48
144 0.46
145 0.51
146 0.55
147 0.59
148 0.56
149 0.54
150 0.53
151 0.54
152 0.53
153 0.46
154 0.41
155 0.42
156 0.4
157 0.39
158 0.38
159 0.34
160 0.34
161 0.37
162 0.36
163 0.29
164 0.33
165 0.31
166 0.35
167 0.44
168 0.45
169 0.49
170 0.56
171 0.63
172 0.67
173 0.75
174 0.77
175 0.74
176 0.77
177 0.77
178 0.71
179 0.65
180 0.6
181 0.56
182 0.56
183 0.56
184 0.51
185 0.49
186 0.47
187 0.45
188 0.43
189 0.41
190 0.39
191 0.35
192 0.36
193 0.33
194 0.37
195 0.43
196 0.44
197 0.42
198 0.39
199 0.38
200 0.34
201 0.31
202 0.28
203 0.21
204 0.2
205 0.16
206 0.14
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.15
212 0.14
213 0.18
214 0.26
215 0.33
216 0.43
217 0.52
218 0.63
219 0.67
220 0.77
221 0.83
222 0.86
223 0.9
224 0.92
225 0.93
226 0.91
227 0.91
228 0.88
229 0.89
230 0.9
231 0.9
232 0.9
233 0.9
234 0.92
235 0.89
236 0.89
237 0.88
238 0.87
239 0.84
240 0.82
241 0.81
242 0.78
243 0.71
244 0.69
245 0.7
246 0.63
247 0.61
248 0.58
249 0.53
250 0.56
251 0.65
252 0.71
253 0.71
254 0.78
255 0.8
256 0.82
257 0.81
258 0.77
259 0.72
260 0.66
261 0.61
262 0.52
263 0.43
264 0.38
265 0.34
266 0.28
267 0.23
268 0.2
269 0.16
270 0.17
271 0.2
272 0.27
273 0.33
274 0.42
275 0.43
276 0.42
277 0.49
278 0.54
279 0.58
280 0.52
281 0.51
282 0.44
283 0.46
284 0.47
285 0.42
286 0.36
287 0.32
288 0.3
289 0.29
290 0.28
291 0.24
292 0.24
293 0.26
294 0.26
295 0.24
296 0.23
297 0.2
298 0.19
299 0.19
300 0.18
301 0.14
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.13
310 0.15
311 0.18
312 0.19
313 0.21
314 0.27
315 0.28
316 0.29
317 0.29
318 0.29
319 0.31
320 0.34
321 0.32
322 0.26
323 0.29
324 0.31
325 0.3
326 0.29
327 0.3
328 0.27
329 0.29
330 0.29
331 0.28
332 0.32
333 0.34
334 0.35
335 0.32
336 0.35
337 0.34
338 0.36
339 0.35
340 0.3
341 0.31
342 0.33
343 0.35
344 0.36
345 0.43
346 0.43
347 0.42
348 0.41
349 0.41
350 0.44
351 0.38
352 0.34
353 0.3
354 0.29
355 0.26
356 0.28
357 0.25
358 0.23
359 0.24
360 0.26
361 0.31
362 0.32
363 0.32
364 0.32
365 0.34
366 0.33
367 0.33
368 0.31
369 0.23
370 0.23
371 0.23
372 0.22
373 0.19
374 0.15
375 0.16
376 0.14
377 0.14
378 0.12
379 0.13
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.17
392 0.24
393 0.33
394 0.4
395 0.47
396 0.57
397 0.67
398 0.77
399 0.82
400 0.85
401 0.88
402 0.91