Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VA53

Protein Details
Accession H1VA53    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
604-657RSRDQSRERKSDRGRHRTRRRRRSSRSVDDRDDEHRRRKHKSRKHTSYNDEDEVBasic
673-731ASPSDSKRSSHRSRRDRDEKRRDREKDKYRDEDYDDYHRKSSHRSHRDRDRDRDREYDRBasic
733-784RDRDRDRDRDRDRDRDRKDREREKDRKRDKHRDREHRHRSSRKHSAEPPTPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
570-649SRRRDASREREREPDVRSERDYAGRERDHSRSPSRSRDQSRERKSDRGXRHRTRRRRRSXSRSVDDRDDEHRRRKHKSRK
679-701DSKRSSHRSRRDRDEKRRDREKD
719-779SHRDRDRDRDREYDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRKDREREKDRKRDKHRDREHRHRSSRKHS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033489  RBBP6  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16620  vRING-HC-C4C4_RBBP6  
Amino Acid Sequences MASSLAPDDIPIKLRCAICSKLAVNAFRLPCCEQAICETCQSSLPSSCPVCEHSPVSAEDCTPHKSLRTTIKVFLRTQEKKREEARSKDAKDSAPPAPVDAKPIVQQAAPSESPAVETPSQPAVVANAQFENTDSQAAQAADASTNGSANADADAAAAQNSTGEDDDDEIVIITGDENAAAARQNTDQQEGDAMENNGAEGDDADANGNANFNGMNGSNFSNMNFNGNGDFSQMQMMMAMQNGMGANSFGNFPMMGMGMDPMAMQNMYMNGGYGPQGMGMGGFGGGFGSGSNNWNGQQSWNFGQDNFNSANAAGMGSGDFGNYNSGFQSGYNQGNYGHQFNDYRRNNYGNRGRGRGRGFYGGGYGRGGYQQYGGYGDQGHMQQQQQFGHNTHGQGSDEGSRATANVDEFGRERKDDQDATSNAGGGNNDNNGEGGEGPKPVDEGGNEQGPRDASEHEKAENGSHMAQDSGDYAAYNGNGMPGGYGPSGFPNQNLGFAPAAPDVPINAPTGPKAMRQGLPNTSLHTLRARGYVIPDEGGRQTSVDGVQSPTVEHQRSRSNSSAPIKDQDKSRRRDASREREREPDVRSERDYAGRERDHSRSPSRSRDQSRERKSDRGXRHRTRRRRRSXSRSVDDRDDEHRRRKHKSRKHTSYNDEDEVKSRSKDDGHEERSRSASPSDSKRSSHRSRRDRDEKRRDREKDKYRDEDYDDYHRKSSHRSHRDRDRDRDREYDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRKDREREKDRKRDKHRDREHRHRSSRKHSAEPPTPVEKDFNPPTGPRGSTSGLEIRGAGSKPGRSSDRQDAGRRDSQASVNSKSAGGVPTKDAHALEREARDRERLLKETQRMAGLAGLAGVKRSRDDVSGGGGGGXG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.34
4 0.35
5 0.33
6 0.4
7 0.37
8 0.39
9 0.43
10 0.42
11 0.4
12 0.45
13 0.43
14 0.38
15 0.41
16 0.37
17 0.34
18 0.37
19 0.33
20 0.27
21 0.32
22 0.35
23 0.33
24 0.34
25 0.31
26 0.27
27 0.3
28 0.31
29 0.26
30 0.25
31 0.25
32 0.29
33 0.29
34 0.3
35 0.29
36 0.32
37 0.32
38 0.34
39 0.34
40 0.29
41 0.31
42 0.32
43 0.33
44 0.29
45 0.25
46 0.24
47 0.25
48 0.27
49 0.26
50 0.26
51 0.26
52 0.28
53 0.35
54 0.42
55 0.48
56 0.48
57 0.53
58 0.59
59 0.62
60 0.6
61 0.61
62 0.61
63 0.61
64 0.65
65 0.68
66 0.64
67 0.65
68 0.71
69 0.75
70 0.73
71 0.73
72 0.75
73 0.74
74 0.74
75 0.75
76 0.72
77 0.64
78 0.6
79 0.57
80 0.51
81 0.45
82 0.41
83 0.36
84 0.36
85 0.34
86 0.33
87 0.29
88 0.28
89 0.25
90 0.28
91 0.26
92 0.22
93 0.22
94 0.2
95 0.25
96 0.23
97 0.22
98 0.2
99 0.18
100 0.2
101 0.2
102 0.22
103 0.16
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.18
110 0.15
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.16
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.09
171 0.14
172 0.16
173 0.19
174 0.19
175 0.18
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.18
180 0.17
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.17
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.04
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.02
272 0.02
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.17
286 0.19
287 0.23
288 0.23
289 0.22
290 0.25
291 0.23
292 0.24
293 0.21
294 0.18
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.1
299 0.09
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.1
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.18
322 0.21
323 0.18
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.19
328 0.29
329 0.29
330 0.31
331 0.32
332 0.36
333 0.36
334 0.43
335 0.49
336 0.46
337 0.47
338 0.49
339 0.49
340 0.5
341 0.52
342 0.46
343 0.41
344 0.36
345 0.32
346 0.27
347 0.28
348 0.22
349 0.19
350 0.15
351 0.13
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.07
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.13
369 0.14
370 0.17
371 0.19
372 0.19
373 0.21
374 0.2
375 0.23
376 0.24
377 0.22
378 0.2
379 0.2
380 0.18
381 0.16
382 0.16
383 0.14
384 0.12
385 0.12
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.08
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.17
402 0.17
403 0.19
404 0.23
405 0.22
406 0.25
407 0.24
408 0.22
409 0.18
410 0.18
411 0.16
412 0.09
413 0.1
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.08
431 0.1
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.15
438 0.13
439 0.12
440 0.11
441 0.15
442 0.16
443 0.15
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.15
448 0.13
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.07
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.13
478 0.13
479 0.15
480 0.15
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.1
486 0.1
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.07
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.14
500 0.17
501 0.19
502 0.22
503 0.25
504 0.26
505 0.29
506 0.28
507 0.27
508 0.25
509 0.23
510 0.22
511 0.2
512 0.18
513 0.16
514 0.18
515 0.16
516 0.14
517 0.16
518 0.17
519 0.15
520 0.14
521 0.13
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.11
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.11
537 0.16
538 0.16
539 0.16
540 0.19
541 0.26
542 0.29
543 0.34
544 0.34
545 0.32
546 0.38
547 0.43
548 0.45
549 0.39
550 0.42
551 0.39
552 0.39
553 0.44
554 0.47
555 0.5
556 0.5
557 0.56
558 0.59
559 0.59
560 0.67
561 0.69
562 0.7
563 0.72
564 0.74
565 0.69
566 0.66
567 0.68
568 0.63
569 0.55
570 0.54
571 0.48
572 0.45
573 0.44
574 0.41
575 0.39
576 0.39
577 0.39
578 0.32
579 0.35
580 0.33
581 0.34
582 0.35
583 0.37
584 0.38
585 0.41
586 0.44
587 0.45
588 0.5
589 0.56
590 0.59
591 0.64
592 0.65
593 0.69
594 0.73
595 0.75
596 0.78
597 0.79
598 0.76
599 0.77
600 0.79
601 0.79
602 0.79
603 0.8
604 0.81
605 0.82
606 0.89
607 0.9
608 0.93
609 0.94
610 0.94
611 0.94
612 0.93
613 0.93
614 0.93
615 0.93
616 0.92
617 0.89
618 0.83
619 0.75
620 0.68
621 0.64
622 0.64
623 0.59
624 0.57
625 0.56
626 0.58
627 0.64
628 0.71
629 0.75
630 0.75
631 0.81
632 0.83
633 0.86
634 0.91
635 0.91
636 0.88
637 0.87
638 0.83
639 0.77
640 0.68
641 0.58
642 0.5
643 0.44
644 0.39
645 0.3
646 0.24
647 0.22
648 0.22
649 0.25
650 0.31
651 0.37
652 0.41
653 0.48
654 0.49
655 0.49
656 0.5
657 0.47
658 0.4
659 0.32
660 0.3
661 0.3
662 0.36
663 0.42
664 0.42
665 0.44
666 0.49
667 0.57
668 0.62
669 0.66
670 0.68
671 0.7
672 0.75
673 0.84
674 0.88
675 0.89
676 0.9
677 0.91
678 0.91
679 0.91
680 0.92
681 0.89
682 0.87
683 0.87
684 0.86
685 0.86
686 0.84
687 0.82
688 0.76
689 0.74
690 0.71
691 0.66
692 0.6
693 0.6
694 0.57
695 0.51
696 0.49
697 0.46
698 0.42
699 0.44
700 0.49
701 0.5
702 0.54
703 0.61
704 0.68
705 0.76
706 0.86
707 0.88
708 0.88
709 0.88
710 0.85
711 0.81
712 0.81
713 0.75
714 0.75
715 0.71
716 0.71
717 0.66
718 0.68
719 0.66
720 0.66
721 0.68
722 0.68
723 0.69
724 0.69
725 0.7
726 0.71
727 0.74
728 0.76
729 0.76
730 0.77
731 0.79
732 0.79
733 0.8
734 0.8
735 0.82
736 0.82
737 0.85
738 0.85
739 0.86
740 0.86
741 0.89
742 0.89
743 0.91
744 0.92
745 0.92
746 0.92
747 0.93
748 0.93
749 0.94
750 0.94
751 0.94
752 0.94
753 0.94
754 0.95
755 0.94
756 0.94
757 0.93
758 0.92
759 0.91
760 0.91
761 0.87
762 0.85
763 0.82
764 0.82
765 0.8
766 0.77
767 0.73
768 0.7
769 0.64
770 0.57
771 0.53
772 0.45
773 0.45
774 0.42
775 0.4
776 0.36
777 0.35
778 0.38
779 0.4
780 0.39
781 0.33
782 0.33
783 0.31
784 0.29
785 0.32
786 0.33
787 0.28
788 0.27
789 0.25
790 0.22
791 0.24
792 0.23
793 0.23
794 0.21
795 0.24
796 0.25
797 0.32
798 0.35
799 0.35
800 0.42
801 0.48
802 0.54
803 0.57
804 0.63
805 0.64
806 0.67
807 0.69
808 0.65
809 0.58
810 0.52
811 0.49
812 0.49
813 0.48
814 0.45
815 0.41
816 0.38
817 0.35
818 0.32
819 0.31
820 0.26
821 0.23
822 0.21
823 0.22
824 0.24
825 0.25
826 0.27
827 0.25
828 0.24
829 0.26
830 0.28
831 0.3
832 0.35
833 0.38
834 0.41
835 0.42
836 0.44
837 0.44
838 0.48
839 0.49
840 0.46
841 0.49
842 0.54
843 0.58
844 0.6
845 0.6
846 0.54
847 0.47
848 0.43
849 0.37
850 0.28
851 0.21
852 0.15
853 0.13
854 0.11
855 0.13
856 0.13
857 0.13
858 0.13
859 0.17
860 0.17
861 0.18
862 0.21
863 0.21
864 0.25
865 0.25