FuNGI

H1V5Y4

Protein Details

Accession

H1V5Y4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-141	QPSSIEEKDAKKKRKREDLDESDPKL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
125-131	AKKKRKR
718-726	RREDKARKA

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034482 Mrd1_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0042134 F:rRNA primary transcript binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0034462 P:small-subunit processome assembly
KEGG	chig:CH63R_05730 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12568 RRM3_MRD1

Amino Acid Sequences

MSATTAAPTTSMETSRIFVRGLPPKITEADFRQHFSAGGREVTDVKVIPLRRIGYVGYKTPEVAAKAVKYFNRSYIRMSRINVELARPIADPAPQHTNGSTGQTYVATSSGSAAPQPSSIEEKDAKKKRKREDLDESDPKLREFLQVMGPSKNAANEMSDVMDPVAVKEQKKLLQDGESDDEYEAIPSRPEKRQMREAPKGEQRTEPMPEKDEAMSDAAPAPESMEDVPQEQASAAPINTVTTDDDWLRSRTNRLLDLVDVGEAVQPPVQQNSGETAGSASAGQREVSAEVTELPKAETKGGTMVDNALAPIESVEENGTLATIKRSSRLFVRNLPFSANEEDLRAHFEHYGELQEVHLPVTVGGASKGFAMVQFTNAESAVAAFQSTDGQTFQGRLLHVLPAEVKRDAGLDEFAISKLPLKKQNLIRKKAEAASSTFNWNSLYMSQDAVNASVANRLGVSKSELLDPTSADAGVKQAIAETSIIQETKAYFVSNGVDLDAFKSQKRGDTTILVKNFPFGTTMEELRTMFEEHGTVLRVLMPPSGTIAIIDFAQPAHAKAAFAKLAYRRIKDTVLFLEKAPRDLFKNDASVSMTQGKEDRPAGVQKLSVTELLGRDEQGETDVVTTSLFVRNLNFSTTTEKLAETFKPLDGFVSARVKTKMDPKKPGQVLSMGFGFVVFKTKEQAQAALQAMDGFVLEGHTLAVKASHKGQDAAEERRREDKARKAAGQRTKIVIKNLPFEVTKKDIRTLFGTYGQLRAVRLPKKFGNTTRGFAFAEFVAPREAENALNALRDTHLLGRRLVLDYAEAEAVDAEEEIAKMQRKIGGQVNKVAISQLMGQNRKRVNIGGDNVDEMDM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.22
3	0.23
4	0.19
5	0.19
6	0.26
7	0.33
8	0.37
9	0.39
10	0.39
11	0.4
12	0.43
13	0.43
14	0.4
15	0.37
16	0.41
17	0.41
18	0.42
19	0.41
20	0.38
21	0.36
22	0.33
23	0.33
24	0.26
25	0.25
26	0.22
27	0.22
28	0.23
29	0.23
30	0.24
31	0.18
32	0.18
33	0.21
34	0.21
35	0.23
36	0.27
37	0.28
38	0.26
39	0.28
40	0.28
41	0.31
42	0.34
43	0.37
44	0.35
45	0.34
46	0.33
47	0.33
48	0.35
49	0.28
50	0.26
51	0.25
52	0.24
53	0.28
54	0.33
55	0.34
56	0.36
57	0.36
58	0.42
59	0.45
60	0.44
61	0.47
62	0.5
63	0.54
64	0.54
65	0.54
66	0.5
67	0.46
68	0.5
69	0.44
70	0.37
71	0.35
72	0.3
73	0.3
74	0.25
75	0.23
76	0.19
77	0.2
78	0.19
79	0.2
80	0.26
81	0.25
82	0.27
83	0.25
84	0.27
85	0.26
86	0.3
87	0.26
88	0.18
89	0.18
90	0.17
91	0.17
92	0.15
93	0.14
94	0.09
95	0.08
96	0.1
97	0.11
98	0.1
99	0.11
100	0.12
101	0.12
102	0.13
103	0.14
104	0.14
105	0.18
106	0.18
107	0.23
108	0.27
109	0.34
110	0.43
111	0.52
112	0.6
113	0.64
114	0.72
115	0.77
116	0.82
117	0.83
118	0.83
119	0.84
120	0.84
121	0.85
122	0.85
123	0.79
124	0.74
125	0.67
126	0.57
127	0.47
128	0.38
129	0.32
130	0.25
131	0.23
132	0.24
133	0.29
134	0.31
135	0.32
136	0.31
137	0.29
138	0.28
139	0.26
140	0.2
141	0.14
142	0.14
143	0.13
144	0.14
145	0.15
146	0.14
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.1
151	0.09
152	0.16
153	0.18
154	0.18
155	0.22
156	0.27
157	0.3
158	0.34
159	0.36
160	0.31
161	0.32
162	0.33
163	0.34
164	0.34
165	0.3
166	0.28
167	0.25
168	0.22
169	0.18
170	0.17
171	0.13
172	0.09
173	0.1
174	0.12
175	0.18
176	0.23
177	0.32
178	0.39
179	0.44
180	0.54
181	0.63
182	0.7
183	0.74
184	0.73
185	0.72
186	0.74
187	0.73
188	0.65
189	0.58
190	0.52
191	0.47
192	0.49
193	0.46
194	0.4
195	0.37
196	0.36
197	0.34
198	0.31
199	0.27
200	0.23
201	0.19
202	0.15
203	0.13
204	0.14
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.1
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.1
215	0.11
216	0.1
217	0.1
218	0.09
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.08
223	0.07
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.08
230	0.1
231	0.1
232	0.13
233	0.15
234	0.16
235	0.18
236	0.19
237	0.22
238	0.25
239	0.28
240	0.28
241	0.28
242	0.27
243	0.25
244	0.25
245	0.21
246	0.16
247	0.12
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.09
259	0.13
260	0.14
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.07
277	0.08
278	0.09
279	0.1
280	0.09
281	0.09
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.13
288	0.14
289	0.13
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.07
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.05
309	0.06
310	0.08
311	0.09
312	0.12
313	0.13
314	0.15
315	0.21
316	0.26
317	0.29
318	0.34
319	0.39
320	0.4
321	0.4
322	0.4
323	0.34
324	0.31
325	0.3
326	0.24
327	0.19
328	0.16
329	0.16
330	0.15
331	0.17
332	0.15
333	0.13
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.12
389	0.11
390	0.13
391	0.12
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.07
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.09
405	0.12
406	0.16
407	0.22
408	0.24
409	0.31
410	0.39
411	0.49
412	0.55
413	0.58
414	0.58
415	0.54
416	0.55
417	0.51
418	0.46
419	0.37
420	0.31
421	0.28
422	0.26
423	0.26
424	0.23
425	0.2
426	0.17
427	0.16
428	0.14
429	0.1
430	0.11
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.07
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.11
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.1
456	0.09
457	0.08
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.05
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.07
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.1
488	0.1
489	0.1
490	0.12
491	0.13
492	0.17
493	0.2
494	0.21
495	0.21
496	0.25
497	0.3
498	0.34
499	0.35
500	0.32
501	0.29
502	0.28
503	0.26
504	0.2
505	0.17
506	0.11
507	0.13
508	0.14
509	0.15
510	0.14
511	0.15
512	0.15
513	0.14
514	0.15
515	0.12
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.09
521	0.1
522	0.08
523	0.07
524	0.09
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.09
529	0.08
530	0.09
531	0.1
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.13
548	0.12
549	0.12
550	0.16
551	0.18
552	0.26
553	0.31
554	0.32
555	0.31
556	0.33
557	0.35
558	0.32
559	0.33
560	0.31
561	0.31
562	0.3
563	0.27
564	0.33
565	0.3
566	0.32
567	0.29
568	0.24
569	0.22
570	0.23
571	0.26
572	0.21
573	0.24
574	0.22
575	0.23
576	0.23
577	0.21
578	0.22
579	0.25
580	0.22
581	0.19
582	0.21
583	0.2
584	0.21
585	0.21
586	0.2
587	0.17
588	0.2
589	0.22
590	0.22
591	0.22
592	0.19
593	0.21
594	0.21
595	0.18
596	0.15
597	0.14
598	0.14
599	0.15
600	0.15
601	0.13
602	0.12
603	0.12
604	0.12
605	0.11
606	0.1
607	0.07
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.14
619	0.15
620	0.17
621	0.17
622	0.15
623	0.21
624	0.22
625	0.23
626	0.21
627	0.2
628	0.19
629	0.21
630	0.21
631	0.2
632	0.2
633	0.19
634	0.19
635	0.19
636	0.18
637	0.16
638	0.16
639	0.16
640	0.21
641	0.21
642	0.24
643	0.25
644	0.26
645	0.28
646	0.37
647	0.43
648	0.44
649	0.53
650	0.54
651	0.63
652	0.66
653	0.66
654	0.58
655	0.53
656	0.45
657	0.39
658	0.34
659	0.24
660	0.2
661	0.17
662	0.15
663	0.1
664	0.14
665	0.11
666	0.11
667	0.14
668	0.16
669	0.22
670	0.23
671	0.26
672	0.21
673	0.28
674	0.29
675	0.26
676	0.24
677	0.18
678	0.17
679	0.14
680	0.12
681	0.06
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.08
691	0.09
692	0.11
693	0.16
694	0.21
695	0.22
696	0.24
697	0.24
698	0.3
699	0.34
700	0.41
701	0.44
702	0.43
703	0.44
704	0.49
705	0.51
706	0.48
707	0.51
708	0.52
709	0.55
710	0.6
711	0.65
712	0.66
713	0.73
714	0.76
715	0.75
716	0.7
717	0.66
718	0.65
719	0.62
720	0.59
721	0.57
722	0.51
723	0.5
724	0.47
725	0.44
726	0.38
727	0.36
728	0.37
729	0.36
730	0.38
731	0.35
732	0.39
733	0.38
734	0.4
735	0.41
736	0.39
737	0.37
738	0.36
739	0.38
740	0.33
741	0.33
742	0.31
743	0.29
744	0.25
745	0.28
746	0.32
747	0.33
748	0.36
749	0.4
750	0.44
751	0.5
752	0.57
753	0.58
754	0.6
755	0.58
756	0.59
757	0.55
758	0.53
759	0.46
760	0.38
761	0.33
762	0.23
763	0.23
764	0.19
765	0.18
766	0.16
767	0.15
768	0.15
769	0.15
770	0.16
771	0.12
772	0.12
773	0.14
774	0.13
775	0.14
776	0.14
777	0.13
778	0.13
779	0.14
780	0.15
781	0.2
782	0.25
783	0.26
784	0.27
785	0.28
786	0.3
787	0.31
788	0.3
789	0.23
790	0.18
791	0.17
792	0.18
793	0.16
794	0.13
795	0.11
796	0.1
797	0.1
798	0.08
799	0.07
800	0.05
801	0.05
802	0.06
803	0.07
804	0.11
805	0.14
806	0.14
807	0.17
808	0.21
809	0.22
810	0.28
811	0.36
812	0.41
813	0.42
814	0.49
815	0.51
816	0.48
817	0.47
818	0.42
819	0.33
820	0.26
821	0.27
822	0.25
823	0.29
824	0.35
825	0.37
826	0.45
827	0.48
828	0.5
829	0.47
830	0.45
831	0.44
832	0.46
833	0.48
834	0.46
835	0.44
836	0.43

H1V5Y4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer