Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5F0H6

Protein Details
Accession A0A5J5F0H6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-298VGGNKTKGGRIDKNKNKKKGGKGKGAGPERKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-299KTKGGRIDKNKNKKKGGKGKGAGPERKV
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MSYPPPPGTSNNSLPPRPPPPINNFTRFAPRQVASATPHHSAPPQHTYHAPPQQPDYSASYAAPAYGGYGMPAASTYSAPAPNVSAAPHIVNPFPLPGTGRKNADPRYADLDPELQAQIAQQQSIYDPSNAENLKARSMPKPAVEAAASAGTQAAAKVPTVVRHGGGQTWTDPTLLEWDPSHFRLFVGNLAGEVTDDSLLKAFSKYPSVKKARVVRDKRTTKSKGYGFVAFADGDEYFRAAREMQGKYIGSHPVLLKRSNTEIKPVIVGGNKTKGGRIDKNKNKKKGGKGKGAGPERKVLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.55
3 0.54
4 0.53
5 0.53
6 0.51
7 0.53
8 0.61
9 0.66
10 0.65
11 0.61
12 0.58
13 0.62
14 0.56
15 0.51
16 0.49
17 0.42
18 0.39
19 0.37
20 0.38
21 0.32
22 0.37
23 0.37
24 0.32
25 0.32
26 0.31
27 0.32
28 0.31
29 0.33
30 0.35
31 0.33
32 0.34
33 0.36
34 0.4
35 0.46
36 0.52
37 0.49
38 0.43
39 0.46
40 0.47
41 0.45
42 0.42
43 0.39
44 0.32
45 0.3
46 0.27
47 0.23
48 0.2
49 0.18
50 0.15
51 0.09
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.15
85 0.2
86 0.24
87 0.26
88 0.3
89 0.36
90 0.4
91 0.44
92 0.41
93 0.38
94 0.41
95 0.38
96 0.35
97 0.29
98 0.27
99 0.2
100 0.2
101 0.17
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.12
112 0.13
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.16
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.22
126 0.24
127 0.21
128 0.22
129 0.21
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.12
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.16
192 0.2
193 0.25
194 0.35
195 0.41
196 0.44
197 0.5
198 0.58
199 0.61
200 0.68
201 0.7
202 0.7
203 0.74
204 0.8
205 0.78
206 0.79
207 0.74
208 0.69
209 0.7
210 0.65
211 0.61
212 0.56
213 0.54
214 0.45
215 0.41
216 0.36
217 0.27
218 0.23
219 0.17
220 0.13
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.07
228 0.11
229 0.18
230 0.2
231 0.21
232 0.26
233 0.27
234 0.27
235 0.3
236 0.3
237 0.23
238 0.25
239 0.26
240 0.28
241 0.31
242 0.33
243 0.31
244 0.32
245 0.39
246 0.43
247 0.41
248 0.41
249 0.41
250 0.39
251 0.39
252 0.35
253 0.32
254 0.28
255 0.31
256 0.29
257 0.32
258 0.34
259 0.33
260 0.35
261 0.37
262 0.41
263 0.48
264 0.53
265 0.58
266 0.65
267 0.76
268 0.84
269 0.87
270 0.89
271 0.89
272 0.89
273 0.89
274 0.88
275 0.88
276 0.84
277 0.83
278 0.82
279 0.83
280 0.79
281 0.72