Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5F8P4

Protein Details
Accession A0A5J5F8P4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-113DAAAKAGKRRRRDKSARHEEEEDBasic
137-162KMDEALKGPKKKKRRKNDHDLERMDDBasic
391-411ADDFIRKLKAKKAKKGVKGPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-106KKKGTAKASVGDAAAKAGKRRRRDKSA
141-152ALKGPKKKKRRK
396-411RKLKAKKAKKGVKGPA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDHEENAPVGNPPSDMIEASELAQDEVRPFDDGDDSQLSDLDDEIFADYNDGISGSKSAEEQEQVPIDEDTVTTLGKYKKKGTAKASVGDAAAKAGKRRRRDKSARHEEEEDEVVQPVIEKPLTEEERRRQELDRKMDEALKGPKKKKRRKNDHDLERMDDEAVENLRLAMLEAAKCDTEAIENGQPATHKLAMVDQVRDMLNRQNLISVAVDCGILKGIRRWLEPLPNKSLPAYNVQKLMFEVLAKLKPDFTHLQESGIGKIVMFYTKDARPERHIKREAEKLVRDWSRPILGRSDDYRSKDIPIADGSRPLPTTRYADTSPPIFHRLTNRFHSRPHKDSNAPNPLAAPARDTGRARAMIPTAQSYDIAPKDRIIPGNKKFSKPMNAEADDFIRKLKAKKAKKGVKGPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.15
5 0.16
6 0.15
7 0.16
8 0.18
9 0.15
10 0.14
11 0.15
12 0.14
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.16
21 0.2
22 0.2
23 0.19
24 0.18
25 0.19
26 0.17
27 0.14
28 0.14
29 0.11
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.21
54 0.19
55 0.17
56 0.15
57 0.14
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.13
63 0.19
64 0.24
65 0.28
66 0.32
67 0.4
68 0.48
69 0.56
70 0.58
71 0.61
72 0.62
73 0.61
74 0.58
75 0.51
76 0.44
77 0.36
78 0.3
79 0.21
80 0.19
81 0.16
82 0.19
83 0.24
84 0.3
85 0.39
86 0.49
87 0.56
88 0.64
89 0.74
90 0.8
91 0.84
92 0.89
93 0.88
94 0.83
95 0.77
96 0.68
97 0.61
98 0.52
99 0.42
100 0.31
101 0.23
102 0.17
103 0.13
104 0.12
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.09
110 0.18
111 0.22
112 0.25
113 0.31
114 0.37
115 0.46
116 0.5
117 0.5
118 0.47
119 0.52
120 0.57
121 0.6
122 0.56
123 0.49
124 0.47
125 0.48
126 0.44
127 0.41
128 0.41
129 0.41
130 0.44
131 0.49
132 0.55
133 0.63
134 0.72
135 0.77
136 0.79
137 0.82
138 0.84
139 0.89
140 0.92
141 0.92
142 0.91
143 0.84
144 0.77
145 0.66
146 0.56
147 0.45
148 0.34
149 0.23
150 0.15
151 0.13
152 0.09
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.14
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.11
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.13
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.07
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.17
211 0.19
212 0.28
213 0.34
214 0.37
215 0.4
216 0.39
217 0.4
218 0.38
219 0.37
220 0.29
221 0.3
222 0.3
223 0.25
224 0.28
225 0.27
226 0.27
227 0.25
228 0.25
229 0.17
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.18
239 0.2
240 0.2
241 0.26
242 0.25
243 0.26
244 0.28
245 0.29
246 0.25
247 0.24
248 0.2
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.13
256 0.15
257 0.22
258 0.24
259 0.27
260 0.32
261 0.42
262 0.48
263 0.54
264 0.59
265 0.57
266 0.6
267 0.66
268 0.67
269 0.64
270 0.59
271 0.52
272 0.54
273 0.53
274 0.48
275 0.41
276 0.37
277 0.35
278 0.34
279 0.33
280 0.3
281 0.29
282 0.31
283 0.32
284 0.36
285 0.36
286 0.38
287 0.4
288 0.36
289 0.36
290 0.36
291 0.33
292 0.28
293 0.27
294 0.27
295 0.24
296 0.27
297 0.26
298 0.25
299 0.25
300 0.24
301 0.21
302 0.2
303 0.23
304 0.21
305 0.26
306 0.25
307 0.28
308 0.3
309 0.32
310 0.31
311 0.3
312 0.32
313 0.27
314 0.28
315 0.34
316 0.38
317 0.41
318 0.47
319 0.53
320 0.52
321 0.59
322 0.67
323 0.66
324 0.67
325 0.69
326 0.68
327 0.66
328 0.73
329 0.75
330 0.75
331 0.67
332 0.6
333 0.52
334 0.47
335 0.44
336 0.35
337 0.27
338 0.19
339 0.21
340 0.26
341 0.27
342 0.27
343 0.3
344 0.31
345 0.29
346 0.31
347 0.3
348 0.28
349 0.28
350 0.28
351 0.25
352 0.24
353 0.23
354 0.2
355 0.25
356 0.26
357 0.28
358 0.26
359 0.25
360 0.29
361 0.33
362 0.39
363 0.39
364 0.45
365 0.49
366 0.6
367 0.64
368 0.63
369 0.65
370 0.66
371 0.68
372 0.64
373 0.65
374 0.63
375 0.61
376 0.59
377 0.56
378 0.53
379 0.46
380 0.41
381 0.33
382 0.29
383 0.29
384 0.31
385 0.38
386 0.43
387 0.5
388 0.61
389 0.71
390 0.76
391 0.82