Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5FB78

Protein Details
Accession A0A5J5FB78    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-122DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
762-782SRFYSKKQDSKKYKINMRVSEHydrophilic
883-906RSDRGPPPPRHNQHPQQPQQPQHVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-423RRDAEQRREANAKRRK
983-990AGRGGRGG
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSQRYPKIVSSVIEEEPKVIDGVEIPVDYTKPNPNGEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPTTEEEMMLEVFKYTERVVNMVRPRKILMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKEQDTADFIKLLEKQQGKKIDDSLKDKKVWDSNAITPGTPFMDILAMSLRYWTAYKLNTDPAWAKLKVIISDSTVPGEGEHKIMEFIRSQRANPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFAADAKAKTCKICGQTGHRPENCIGKAKVKNGEFDEKAAPVKKKPFIWLHVSILREYLAVELDVKNQGFRFDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRDGGIDTLMSIWKENLPVMGGYLTKDGTVELDKVQYVLDGLAQQEDAIFRRRRDAEQRREANAKRRKMNEQGHDHNSGRANINETPGYENAVMSAPSNRKKGPPDSAPPPMIPLMKPGDLSKETKKLNYDMVMNRESIRKANLQNKSAAQALKSQLMSGTLETAAESPVNGAESEESTPTADTEPVVLPHKRKAAEFDSEAPTPKPAQQGDEMPPDTVRLWESGYRDRYYEQKFHVDPKDIEFRNKVAAHYVEGLCWVLMYYFQGCPSWNWYYPYHYAPFAQDFKDVGKLDIKFKKGKPFKPFEQLMGVLPAASKHNLPVPFQMLMTDADSEIIDFYPENFPIDLNGKKFAWQGVALLPFIDEQRLLDAAQKIYPKLTPEDSARNAMGHDTLLVSDGHPLYDDIASRFYSKKQDSKKYKINMRVSEGLAGSVEKDDSFIPRSRLVFPLQEGNMPDLDEDRTMSLHYEIPKSKNIHKSMLLRGLRLDPPTLTQADIDTTRHKANKGGRTYGGAPFHRGGGRGGRNDFRSDRGPPPPRHNQHPQQPQQPQHVIPPPFAPPGQSAYGGWGGWGGVPPPPPPGQWGQFPPPPGPGGFGGGFPPPPPGVREAGSYVGPPRNDDRRGGGYNRAGRGGRGGGGGGHRDDRRDDRDSGNRGYDGYGWSGRSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.51
4 0.5
5 0.44
6 0.42
7 0.39
8 0.37
9 0.35
10 0.34
11 0.3
12 0.27
13 0.27
14 0.2
15 0.15
16 0.12
17 0.09
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.17
26 0.22
27 0.25
28 0.27
29 0.29
30 0.3
31 0.34
32 0.37
33 0.38
34 0.31
35 0.29
36 0.27
37 0.25
38 0.22
39 0.18
40 0.14
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.18
49 0.21
50 0.23
51 0.31
52 0.41
53 0.46
54 0.51
55 0.52
56 0.51
57 0.52
58 0.53
59 0.45
60 0.39
61 0.34
62 0.3
63 0.27
64 0.22
65 0.17
66 0.14
67 0.13
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.13
72 0.13
73 0.17
74 0.2
75 0.28
76 0.37
77 0.44
78 0.46
79 0.45
80 0.46
81 0.45
82 0.44
83 0.39
84 0.32
85 0.29
86 0.27
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.37
98 0.45
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.82
104 0.79
105 0.76
106 0.76
107 0.73
108 0.7
109 0.71
110 0.65
111 0.6
112 0.62
113 0.55
114 0.46
115 0.39
116 0.31
117 0.24
118 0.22
119 0.2
120 0.14
121 0.13
122 0.17
123 0.19
124 0.21
125 0.26
126 0.3
127 0.33
128 0.4
129 0.49
130 0.47
131 0.48
132 0.53
133 0.54
134 0.56
135 0.6
136 0.62
137 0.6
138 0.6
139 0.59
140 0.57
141 0.56
142 0.52
143 0.5
144 0.46
145 0.45
146 0.48
147 0.47
148 0.41
149 0.34
150 0.32
151 0.26
152 0.21
153 0.15
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.14
167 0.16
168 0.2
169 0.23
170 0.29
171 0.28
172 0.32
173 0.31
174 0.32
175 0.35
176 0.32
177 0.29
178 0.27
179 0.29
180 0.27
181 0.28
182 0.24
183 0.21
184 0.25
185 0.25
186 0.22
187 0.2
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.17
200 0.24
201 0.26
202 0.26
203 0.33
204 0.37
205 0.41
206 0.42
207 0.48
208 0.45
209 0.49
210 0.52
211 0.47
212 0.51
213 0.45
214 0.41
215 0.32
216 0.27
217 0.23
218 0.22
219 0.19
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.05
232 0.07
233 0.08
234 0.11
235 0.13
236 0.14
237 0.18
238 0.2
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.14
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.18
253 0.23
254 0.23
255 0.28
256 0.33
257 0.38
258 0.47
259 0.56
260 0.63
261 0.58
262 0.57
263 0.54
264 0.56
265 0.5
266 0.47
267 0.39
268 0.39
269 0.43
270 0.45
271 0.51
272 0.44
273 0.47
274 0.45
275 0.51
276 0.42
277 0.4
278 0.37
279 0.31
280 0.33
281 0.33
282 0.31
283 0.28
284 0.35
285 0.37
286 0.37
287 0.43
288 0.46
289 0.45
290 0.5
291 0.49
292 0.48
293 0.47
294 0.45
295 0.38
296 0.33
297 0.28
298 0.2
299 0.16
300 0.11
301 0.07
302 0.06
303 0.08
304 0.07
305 0.09
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.14
315 0.17
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.2
320 0.19
321 0.15
322 0.13
323 0.11
324 0.1
325 0.08
326 0.08
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.06
349 0.04
350 0.05
351 0.06
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.14
391 0.17
392 0.17
393 0.23
394 0.26
395 0.3
396 0.41
397 0.5
398 0.53
399 0.6
400 0.65
401 0.63
402 0.68
403 0.67
404 0.67
405 0.65
406 0.62
407 0.58
408 0.58
409 0.59
410 0.61
411 0.66
412 0.65
413 0.65
414 0.65
415 0.62
416 0.63
417 0.57
418 0.51
419 0.45
420 0.38
421 0.31
422 0.24
423 0.23
424 0.19
425 0.21
426 0.18
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.17
431 0.14
432 0.12
433 0.11
434 0.11
435 0.1
436 0.08
437 0.12
438 0.15
439 0.19
440 0.22
441 0.22
442 0.25
443 0.3
444 0.35
445 0.37
446 0.39
447 0.41
448 0.44
449 0.48
450 0.46
451 0.42
452 0.38
453 0.33
454 0.28
455 0.21
456 0.19
457 0.17
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.17
462 0.19
463 0.22
464 0.23
465 0.27
466 0.27
467 0.28
468 0.3
469 0.27
470 0.28
471 0.26
472 0.27
473 0.24
474 0.27
475 0.26
476 0.25
477 0.24
478 0.24
479 0.22
480 0.18
481 0.17
482 0.18
483 0.22
484 0.3
485 0.34
486 0.34
487 0.36
488 0.36
489 0.35
490 0.33
491 0.28
492 0.21
493 0.2
494 0.19
495 0.2
496 0.19
497 0.17
498 0.14
499 0.15
500 0.14
501 0.1
502 0.09
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.05
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.18
533 0.23
534 0.22
535 0.22
536 0.26
537 0.26
538 0.28
539 0.29
540 0.29
541 0.29
542 0.28
543 0.29
544 0.24
545 0.22
546 0.18
547 0.19
548 0.19
549 0.16
550 0.17
551 0.18
552 0.22
553 0.25
554 0.3
555 0.28
556 0.23
557 0.23
558 0.21
559 0.19
560 0.16
561 0.13
562 0.08
563 0.09
564 0.11
565 0.15
566 0.2
567 0.24
568 0.24
569 0.24
570 0.24
571 0.3
572 0.32
573 0.34
574 0.3
575 0.33
576 0.34
577 0.4
578 0.42
579 0.4
580 0.36
581 0.36
582 0.42
583 0.36
584 0.37
585 0.33
586 0.3
587 0.31
588 0.32
589 0.27
590 0.22
591 0.22
592 0.2
593 0.23
594 0.22
595 0.15
596 0.15
597 0.15
598 0.11
599 0.1
600 0.08
601 0.04
602 0.04
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.08
608 0.09
609 0.1
610 0.15
611 0.18
612 0.19
613 0.22
614 0.23
615 0.27
616 0.29
617 0.32
618 0.28
619 0.25
620 0.24
621 0.22
622 0.26
623 0.23
624 0.21
625 0.19
626 0.18
627 0.18
628 0.23
629 0.21
630 0.18
631 0.2
632 0.21
633 0.28
634 0.32
635 0.35
636 0.36
637 0.39
638 0.48
639 0.52
640 0.58
641 0.6
642 0.62
643 0.64
644 0.66
645 0.65
646 0.57
647 0.52
648 0.46
649 0.37
650 0.31
651 0.25
652 0.16
653 0.14
654 0.13
655 0.1
656 0.1
657 0.09
658 0.08
659 0.13
660 0.15
661 0.17
662 0.19
663 0.2
664 0.2
665 0.2
666 0.19
667 0.16
668 0.15
669 0.14
670 0.12
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.07
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.07
680 0.08
681 0.09
682 0.1
683 0.1
684 0.1
685 0.11
686 0.16
687 0.17
688 0.16
689 0.2
690 0.18
691 0.2
692 0.21
693 0.2
694 0.18
695 0.15
696 0.15
697 0.16
698 0.17
699 0.15
700 0.14
701 0.13
702 0.12
703 0.12
704 0.11
705 0.07
706 0.05
707 0.07
708 0.08
709 0.08
710 0.12
711 0.14
712 0.15
713 0.18
714 0.19
715 0.18
716 0.19
717 0.2
718 0.18
719 0.19
720 0.21
721 0.21
722 0.24
723 0.31
724 0.32
725 0.34
726 0.32
727 0.29
728 0.27
729 0.24
730 0.2
731 0.12
732 0.1
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.09
739 0.09
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.1
744 0.11
745 0.12
746 0.09
747 0.11
748 0.12
749 0.14
750 0.16
751 0.17
752 0.25
753 0.3
754 0.37
755 0.44
756 0.54
757 0.62
758 0.7
759 0.76
760 0.76
761 0.8
762 0.81
763 0.81
764 0.76
765 0.73
766 0.69
767 0.61
768 0.55
769 0.46
770 0.36
771 0.27
772 0.21
773 0.15
774 0.1
775 0.1
776 0.06
777 0.07
778 0.07
779 0.1
780 0.14
781 0.17
782 0.19
783 0.23
784 0.26
785 0.27
786 0.3
787 0.3
788 0.29
789 0.28
790 0.32
791 0.29
792 0.3
793 0.28
794 0.27
795 0.24
796 0.21
797 0.19
798 0.13
799 0.13
800 0.11
801 0.11
802 0.09
803 0.09
804 0.09
805 0.11
806 0.11
807 0.13
808 0.16
809 0.22
810 0.26
811 0.29
812 0.36
813 0.39
814 0.45
815 0.51
816 0.52
817 0.51
818 0.53
819 0.56
820 0.57
821 0.62
822 0.56
823 0.48
824 0.46
825 0.45
826 0.42
827 0.37
828 0.31
829 0.22
830 0.23
831 0.26
832 0.24
833 0.2
834 0.17
835 0.16
836 0.18
837 0.19
838 0.18
839 0.18
840 0.21
841 0.26
842 0.29
843 0.29
844 0.33
845 0.4
846 0.47
847 0.5
848 0.52
849 0.48
850 0.5
851 0.52
852 0.52
853 0.51
854 0.43
855 0.41
856 0.36
857 0.38
858 0.34
859 0.32
860 0.28
861 0.29
862 0.35
863 0.36
864 0.4
865 0.43
866 0.44
867 0.49
868 0.48
869 0.44
870 0.42
871 0.41
872 0.43
873 0.48
874 0.55
875 0.55
876 0.62
877 0.69
878 0.71
879 0.74
880 0.77
881 0.77
882 0.78
883 0.82
884 0.82
885 0.81
886 0.83
887 0.81
888 0.8
889 0.76
890 0.67
891 0.65
892 0.64
893 0.56
894 0.49
895 0.45
896 0.4
897 0.38
898 0.36
899 0.3
900 0.24
901 0.27
902 0.27
903 0.25
904 0.22
905 0.22
906 0.24
907 0.21
908 0.19
909 0.14
910 0.12
911 0.11
912 0.12
913 0.09
914 0.1
915 0.12
916 0.13
917 0.17
918 0.19
919 0.19
920 0.23
921 0.29
922 0.3
923 0.35
924 0.41
925 0.44
926 0.45
927 0.48
928 0.45
929 0.41
930 0.39
931 0.33
932 0.29
933 0.23
934 0.24
935 0.22
936 0.21
937 0.19
938 0.19
939 0.19
940 0.16
941 0.19
942 0.15
943 0.16
944 0.18
945 0.2
946 0.21
947 0.22
948 0.25
949 0.25
950 0.26
951 0.26
952 0.25
953 0.27
954 0.29
955 0.28
956 0.28
957 0.33
958 0.39
959 0.41
960 0.42
961 0.43
962 0.46
963 0.51
964 0.51
965 0.52
966 0.52
967 0.56
968 0.56
969 0.55
970 0.47
971 0.42
972 0.43
973 0.37
974 0.3
975 0.24
976 0.22
977 0.19
978 0.22
979 0.24
980 0.22
981 0.26
982 0.26
983 0.28
984 0.33
985 0.38
986 0.41
987 0.43
988 0.45
989 0.46
990 0.54
991 0.58
992 0.58
993 0.55
994 0.5
995 0.45
996 0.43
997 0.37
998 0.3
999 0.29
1000 0.27