Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5EUB2

Protein Details
Accession A0A5J5EUB2    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-126AAPAKQKKPAVKKAPEPEPEHydrophilic
335-355WIKKVDKENRRRRKISTRLKABasic
436-462EEKPAKATKGGKKGKKAEKPAKPDAELBasic
500-519TEKKEPVKKTVAKKAEKPAAHydrophilic
529-550EQKVKGPSKKTVEKKAPAAKSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-41GSKRKAAPAASSQAKKPKKETTSVKTAVPSKPAASSKK
91-120KDAKGKKAKKPAAAAAAAPAKQKKPAVKKA
193-208KARIPIDKNFKKKLEK
309-356ANKRYKPAPHAKRARAELEKKKPEEVWIKKVDKENRRRRKISTRLKAR
399-457KTTAKGKRGKKMAEPKKVEEKPEEKAEEKPEETVPAVEEKPAKATKGGKKGKKAEKPAK
480-564AKKASKGKKADKAAADKESVTEKKEPVKKTVAKKAEKPAATKKTEKPAAEQKVKGPSKKTVEKKAPAAKSTTVKNRISTKKAGKA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10.5, cyto_mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MARGSKRKAAPAASSQAKKPKKETTSVKTAVPSKPAASSKKAAAAPAVVPAVVPAAGARKSQRKKAADFYSDKEESGDESEDGGWDQLAGKDAKGKKAKKPAAAAAAAPAKQKKPAVKKAPEPEPESAVESDAEEDAKISLNVDGPDSESESSDSELDDQTATLLQGFESSDEEEVVDAEASAEGIDPKKLTKARIPIDKNFKKKLEKLSGKEKTTPGVIYIGRIPHGFYEVEMKSYFSQFGTVTRLRLSRNKKTGQSKHYAFLEFADEDVAKIAAETMDRYLLFGHILRCKLVPRDNIEYIESIFKGANKRYKPAPHAKRARAELEKKKPEEVWIKKVDKENRRRRKISTRLKARGIDYKFEAPDAKKADPVIETAPETPAIEEKLVEEPVTEKPEAKTTAKGKRGKKMAEPKKVEEKPEEKAEEKPEETVPAVEEKPAKATKGGKKGKKAEKPAKPDAELEPIVETPAVEEKTAEDPAKKASKGKKADKAAADKESVTEKKEPVKKTVAKKAEKPAATKKTEKPAAEQKVKGPSKKTVEKKAPAAKSTTVKNRISTKKAGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.64
4 0.66
5 0.65
6 0.65
7 0.66
8 0.63
9 0.7
10 0.73
11 0.72
12 0.75
13 0.72
14 0.68
15 0.65
16 0.65
17 0.59
18 0.54
19 0.48
20 0.39
21 0.44
22 0.47
23 0.46
24 0.46
25 0.46
26 0.44
27 0.49
28 0.49
29 0.42
30 0.37
31 0.34
32 0.29
33 0.28
34 0.25
35 0.17
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.1
40 0.09
41 0.06
42 0.1
43 0.11
44 0.14
45 0.2
46 0.3
47 0.36
48 0.45
49 0.54
50 0.57
51 0.61
52 0.69
53 0.73
54 0.71
55 0.7
56 0.66
57 0.65
58 0.6
59 0.54
60 0.44
61 0.35
62 0.28
63 0.26
64 0.23
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.07
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.19
79 0.22
80 0.31
81 0.39
82 0.44
83 0.49
84 0.6
85 0.67
86 0.66
87 0.7
88 0.67
89 0.66
90 0.61
91 0.53
92 0.48
93 0.46
94 0.4
95 0.37
96 0.34
97 0.28
98 0.31
99 0.36
100 0.39
101 0.44
102 0.53
103 0.6
104 0.64
105 0.72
106 0.77
107 0.81
108 0.79
109 0.74
110 0.66
111 0.59
112 0.52
113 0.45
114 0.37
115 0.28
116 0.21
117 0.17
118 0.15
119 0.12
120 0.11
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.13
177 0.16
178 0.19
179 0.23
180 0.32
181 0.38
182 0.47
183 0.52
184 0.54
185 0.63
186 0.68
187 0.7
188 0.68
189 0.68
190 0.65
191 0.65
192 0.67
193 0.67
194 0.68
195 0.66
196 0.7
197 0.72
198 0.68
199 0.67
200 0.58
201 0.48
202 0.42
203 0.37
204 0.26
205 0.23
206 0.19
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.1
214 0.12
215 0.11
216 0.08
217 0.14
218 0.13
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.09
226 0.11
227 0.09
228 0.11
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.17
233 0.2
234 0.21
235 0.28
236 0.35
237 0.38
238 0.45
239 0.5
240 0.55
241 0.63
242 0.69
243 0.68
244 0.68
245 0.61
246 0.58
247 0.55
248 0.49
249 0.38
250 0.31
251 0.27
252 0.18
253 0.15
254 0.12
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.1
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.19
280 0.23
281 0.24
282 0.26
283 0.32
284 0.33
285 0.33
286 0.33
287 0.29
288 0.24
289 0.22
290 0.17
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.14
295 0.17
296 0.24
297 0.24
298 0.27
299 0.32
300 0.38
301 0.43
302 0.51
303 0.55
304 0.58
305 0.67
306 0.69
307 0.69
308 0.67
309 0.66
310 0.63
311 0.64
312 0.63
313 0.64
314 0.67
315 0.62
316 0.61
317 0.55
318 0.53
319 0.54
320 0.5
321 0.48
322 0.49
323 0.5
324 0.52
325 0.59
326 0.61
327 0.6
328 0.66
329 0.69
330 0.71
331 0.77
332 0.77
333 0.77
334 0.79
335 0.8
336 0.8
337 0.8
338 0.8
339 0.77
340 0.79
341 0.76
342 0.68
343 0.66
344 0.57
345 0.5
346 0.42
347 0.4
348 0.34
349 0.31
350 0.32
351 0.24
352 0.28
353 0.29
354 0.26
355 0.23
356 0.23
357 0.24
358 0.21
359 0.22
360 0.17
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.15
365 0.13
366 0.13
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.14
379 0.18
380 0.17
381 0.16
382 0.16
383 0.22
384 0.26
385 0.26
386 0.3
387 0.34
388 0.43
389 0.5
390 0.57
391 0.58
392 0.62
393 0.69
394 0.66
395 0.68
396 0.7
397 0.71
398 0.74
399 0.74
400 0.72
401 0.74
402 0.74
403 0.68
404 0.65
405 0.59
406 0.54
407 0.56
408 0.54
409 0.45
410 0.46
411 0.48
412 0.45
413 0.42
414 0.39
415 0.32
416 0.3
417 0.29
418 0.25
419 0.19
420 0.18
421 0.17
422 0.18
423 0.19
424 0.17
425 0.23
426 0.23
427 0.23
428 0.24
429 0.32
430 0.38
431 0.47
432 0.56
433 0.57
434 0.65
435 0.74
436 0.8
437 0.81
438 0.83
439 0.83
440 0.83
441 0.84
442 0.84
443 0.81
444 0.73
445 0.67
446 0.59
447 0.56
448 0.47
449 0.39
450 0.31
451 0.24
452 0.23
453 0.19
454 0.15
455 0.09
456 0.14
457 0.14
458 0.12
459 0.12
460 0.14
461 0.18
462 0.22
463 0.22
464 0.18
465 0.19
466 0.26
467 0.33
468 0.32
469 0.36
470 0.41
471 0.5
472 0.58
473 0.67
474 0.69
475 0.7
476 0.77
477 0.77
478 0.77
479 0.74
480 0.68
481 0.6
482 0.51
483 0.45
484 0.45
485 0.39
486 0.34
487 0.33
488 0.33
489 0.4
490 0.47
491 0.49
492 0.47
493 0.56
494 0.6
495 0.64
496 0.71
497 0.72
498 0.72
499 0.77
500 0.8
501 0.79
502 0.76
503 0.73
504 0.73
505 0.73
506 0.72
507 0.72
508 0.69
509 0.7
510 0.74
511 0.68
512 0.66
513 0.67
514 0.7
515 0.71
516 0.67
517 0.62
518 0.65
519 0.7
520 0.68
521 0.63
522 0.61
523 0.63
524 0.69
525 0.72
526 0.73
527 0.76
528 0.78
529 0.83
530 0.84
531 0.81
532 0.75
533 0.71
534 0.67
535 0.63
536 0.64
537 0.65
538 0.64
539 0.6
540 0.63
541 0.68
542 0.7
543 0.71
544 0.72