Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5FAR9

Protein Details
Accession A0A5J5FAR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-47QRILLSKCGKLPKKKRKKKNIETPPPPAPAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-36GKLPKKKRKKKN
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002867  IBR_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PF00076  RRM_1  
PF00097  zf-C3HC4  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS51873  TRIAD  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22585  Rcat_RBR_DEAH12-like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MERNARFVAGRHRTAAQRILLSKCGKLPKKKRKKKNIETPPPPAPAIYNASSKNEAMAAQPPQPCIFFQQGRCRNGSRCKFSHQPSTGPGPSSSAFSESWRKPKESSGEGTAALLTATRAQEPWRIPAPAVTAEDLRRLKASTKSSKGPPSGLFVPCKFFQRGCCSHGSTCAFAHIEDNTQSPSSVATEARVKGKGPLIGETAKPEPDVDHVETVPQETEVRIMGSTLSVTFGPGLAIIDVGSASDTSIITIQNLQMNTSAEKVKELLSSLEPDLPEEAIRVISIEDATYATVKFQDASIAQEAVRQLDGTSYEDNRLSVKPYQFKGLANVSQSATRVSCTWFAPSRIASIGVATHSAAQRAMQICQGMRIKGRKAECKLQSSYDYGFHRPSRGEITVGNLTSETTEQDLRRIFRNAGVKVQSVYLHDPTYELSPSDALFNIVKLFEQQKSDIEGYDIVSLPGARKSKAIIRFRTAVAALDAVRNYNGKPQHFLAGSKIFLQPIYTANFKIAPEIQRAVSKELTSLAAEQPQGVQIRVFSGGGGSHTLATVRITGQDKKEVSVAKSMVGKIVRGQLVQKKTDEGEPLWDPFWATVDGIQKITEIGRDTKTFIFCDKRKSQLFLFGTTENQEKAMERLHESMASIGEKGHEIPMEGMAWKNFMRGGLRTLQEKYGADKVKVNVVKRCIIFVGPPKELEEALKSLENTAGEGSPGDVAEAYCPICFDTAENPTQFSSCQHAYCLSCLKDYIKSTTATRKFPITCVGEGTDSTVCGRALDIPILATILSPIEHDSIISSAFNDHVRCHPDEYSYCPTPNCNTVYRTSPSGDGKVFSCVDCLLEICTSCNVETHDGLSCADFRLSKHSDEKADRLFEQWKMQNGVHSCPACGTDIQKASGCNHITCGSCKAHICWKCLKVFAVAQEVYDHMNREHGGIGIDWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.53
3 0.47
4 0.45
5 0.47
6 0.48
7 0.5
8 0.48
9 0.46
10 0.46
11 0.52
12 0.54
13 0.6
14 0.67
15 0.71
16 0.8
17 0.88
18 0.92
19 0.93
20 0.96
21 0.96
22 0.96
23 0.96
24 0.96
25 0.95
26 0.92
27 0.88
28 0.81
29 0.7
30 0.6
31 0.5
32 0.44
33 0.41
34 0.36
35 0.34
36 0.32
37 0.36
38 0.38
39 0.36
40 0.32
41 0.27
42 0.24
43 0.2
44 0.24
45 0.23
46 0.27
47 0.29
48 0.31
49 0.31
50 0.31
51 0.3
52 0.29
53 0.34
54 0.34
55 0.39
56 0.48
57 0.55
58 0.59
59 0.62
60 0.62
61 0.62
62 0.66
63 0.68
64 0.66
65 0.62
66 0.65
67 0.7
68 0.71
69 0.74
70 0.67
71 0.62
72 0.58
73 0.63
74 0.58
75 0.52
76 0.46
77 0.39
78 0.36
79 0.33
80 0.29
81 0.23
82 0.2
83 0.22
84 0.31
85 0.33
86 0.43
87 0.45
88 0.46
89 0.45
90 0.52
91 0.56
92 0.52
93 0.52
94 0.48
95 0.45
96 0.43
97 0.41
98 0.34
99 0.26
100 0.19
101 0.14
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.14
108 0.2
109 0.22
110 0.28
111 0.29
112 0.29
113 0.29
114 0.31
115 0.33
116 0.31
117 0.31
118 0.26
119 0.25
120 0.25
121 0.32
122 0.3
123 0.28
124 0.25
125 0.24
126 0.27
127 0.31
128 0.39
129 0.41
130 0.47
131 0.53
132 0.59
133 0.65
134 0.64
135 0.61
136 0.54
137 0.51
138 0.5
139 0.48
140 0.46
141 0.4
142 0.42
143 0.39
144 0.42
145 0.38
146 0.33
147 0.36
148 0.4
149 0.43
150 0.42
151 0.46
152 0.46
153 0.44
154 0.5
155 0.46
156 0.39
157 0.34
158 0.34
159 0.28
160 0.24
161 0.25
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.18
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.18
176 0.2
177 0.24
178 0.25
179 0.23
180 0.25
181 0.29
182 0.29
183 0.25
184 0.25
185 0.25
186 0.27
187 0.27
188 0.27
189 0.25
190 0.23
191 0.22
192 0.19
193 0.16
194 0.17
195 0.22
196 0.2
197 0.2
198 0.19
199 0.21
200 0.2
201 0.21
202 0.18
203 0.13
204 0.11
205 0.09
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.1
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.15
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.16
257 0.16
258 0.18
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.08
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.13
292 0.13
293 0.1
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.1
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.15
305 0.16
306 0.19
307 0.24
308 0.29
309 0.29
310 0.34
311 0.34
312 0.33
313 0.35
314 0.34
315 0.31
316 0.26
317 0.27
318 0.23
319 0.22
320 0.22
321 0.19
322 0.14
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.14
327 0.13
328 0.17
329 0.19
330 0.2
331 0.22
332 0.21
333 0.21
334 0.19
335 0.19
336 0.14
337 0.12
338 0.11
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.19
354 0.2
355 0.18
356 0.21
357 0.25
358 0.26
359 0.3
360 0.35
361 0.37
362 0.4
363 0.48
364 0.49
365 0.51
366 0.5
367 0.48
368 0.45
369 0.4
370 0.37
371 0.33
372 0.3
373 0.26
374 0.29
375 0.26
376 0.26
377 0.24
378 0.24
379 0.23
380 0.22
381 0.2
382 0.16
383 0.2
384 0.21
385 0.21
386 0.19
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.08
392 0.07
393 0.1
394 0.1
395 0.13
396 0.16
397 0.17
398 0.19
399 0.21
400 0.2
401 0.22
402 0.29
403 0.27
404 0.29
405 0.3
406 0.27
407 0.26
408 0.26
409 0.22
410 0.18
411 0.19
412 0.16
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.13
418 0.11
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.1
433 0.1
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.16
438 0.17
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.11
443 0.12
444 0.11
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.1
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.12
454 0.18
455 0.27
456 0.34
457 0.33
458 0.36
459 0.38
460 0.38
461 0.38
462 0.32
463 0.23
464 0.16
465 0.14
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.12
474 0.15
475 0.14
476 0.17
477 0.18
478 0.22
479 0.22
480 0.22
481 0.22
482 0.21
483 0.21
484 0.2
485 0.19
486 0.15
487 0.14
488 0.14
489 0.11
490 0.11
491 0.13
492 0.12
493 0.11
494 0.12
495 0.14
496 0.13
497 0.14
498 0.15
499 0.14
500 0.16
501 0.17
502 0.18
503 0.19
504 0.2
505 0.22
506 0.2
507 0.18
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.12
512 0.12
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.12
519 0.12
520 0.11
521 0.1
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.09
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.09
540 0.12
541 0.16
542 0.17
543 0.23
544 0.23
545 0.23
546 0.27
547 0.25
548 0.23
549 0.25
550 0.24
551 0.2
552 0.23
553 0.22
554 0.22
555 0.2
556 0.19
557 0.15
558 0.2
559 0.19
560 0.17
561 0.21
562 0.24
563 0.29
564 0.31
565 0.29
566 0.26
567 0.26
568 0.28
569 0.27
570 0.2
571 0.21
572 0.2
573 0.21
574 0.19
575 0.18
576 0.15
577 0.13
578 0.14
579 0.09
580 0.08
581 0.1
582 0.13
583 0.14
584 0.15
585 0.15
586 0.13
587 0.13
588 0.13
589 0.12
590 0.1
591 0.12
592 0.15
593 0.15
594 0.18
595 0.21
596 0.22
597 0.21
598 0.23
599 0.29
600 0.29
601 0.37
602 0.39
603 0.44
604 0.45
605 0.48
606 0.44
607 0.45
608 0.45
609 0.39
610 0.38
611 0.31
612 0.3
613 0.28
614 0.28
615 0.18
616 0.17
617 0.14
618 0.12
619 0.12
620 0.15
621 0.15
622 0.16
623 0.18
624 0.18
625 0.18
626 0.17
627 0.17
628 0.14
629 0.13
630 0.11
631 0.09
632 0.08
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.1
643 0.09
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.12
650 0.12
651 0.16
652 0.19
653 0.21
654 0.24
655 0.25
656 0.25
657 0.26
658 0.25
659 0.25
660 0.28
661 0.29
662 0.27
663 0.3
664 0.29
665 0.35
666 0.38
667 0.39
668 0.36
669 0.37
670 0.42
671 0.37
672 0.38
673 0.3
674 0.27
675 0.28
676 0.31
677 0.34
678 0.29
679 0.29
680 0.3
681 0.3
682 0.29
683 0.26
684 0.2
685 0.15
686 0.16
687 0.17
688 0.15
689 0.15
690 0.17
691 0.15
692 0.13
693 0.13
694 0.11
695 0.09
696 0.09
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.06
701 0.06
702 0.05
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.08
712 0.12
713 0.16
714 0.21
715 0.21
716 0.22
717 0.22
718 0.22
719 0.21
720 0.18
721 0.2
722 0.19
723 0.19
724 0.19
725 0.23
726 0.23
727 0.26
728 0.31
729 0.26
730 0.24
731 0.25
732 0.26
733 0.28
734 0.29
735 0.32
736 0.28
737 0.29
738 0.32
739 0.41
740 0.44
741 0.42
742 0.42
743 0.44
744 0.43
745 0.42
746 0.46
747 0.4
748 0.35
749 0.34
750 0.33
751 0.27
752 0.26
753 0.27
754 0.19
755 0.15
756 0.15
757 0.14
758 0.12
759 0.11
760 0.12
761 0.11
762 0.13
763 0.13
764 0.13
765 0.11
766 0.11
767 0.11
768 0.1
769 0.07
770 0.06
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.07
775 0.08
776 0.08
777 0.08
778 0.09
779 0.09
780 0.1
781 0.09
782 0.08
783 0.08
784 0.1
785 0.13
786 0.13
787 0.15
788 0.19
789 0.24
790 0.26
791 0.29
792 0.29
793 0.31
794 0.33
795 0.38
796 0.4
797 0.39
798 0.39
799 0.36
800 0.38
801 0.36
802 0.39
803 0.36
804 0.32
805 0.32
806 0.34
807 0.39
808 0.39
809 0.39
810 0.35
811 0.37
812 0.37
813 0.39
814 0.36
815 0.32
816 0.29
817 0.31
818 0.3
819 0.24
820 0.21
821 0.17
822 0.16
823 0.15
824 0.15
825 0.11
826 0.12
827 0.12
828 0.12
829 0.14
830 0.15
831 0.14
832 0.16
833 0.17
834 0.19
835 0.19
836 0.19
837 0.2
838 0.2
839 0.2
840 0.19
841 0.17
842 0.15
843 0.16
844 0.16
845 0.14
846 0.22
847 0.24
848 0.28
849 0.34
850 0.38
851 0.44
852 0.48
853 0.54
854 0.52
855 0.54
856 0.5
857 0.48
858 0.47
859 0.42
860 0.46
861 0.44
862 0.43
863 0.43
864 0.44
865 0.46
866 0.44
867 0.46
868 0.45
869 0.41
870 0.34
871 0.31
872 0.32
873 0.27
874 0.26
875 0.24
876 0.24
877 0.27
878 0.29
879 0.3
880 0.31
881 0.31
882 0.37
883 0.37
884 0.29
885 0.29
886 0.31
887 0.31
888 0.32
889 0.36
890 0.31
891 0.32
892 0.34
893 0.34
894 0.4
895 0.44
896 0.46
897 0.5
898 0.53
899 0.53
900 0.55
901 0.53
902 0.49
903 0.47
904 0.47
905 0.46
906 0.39
907 0.35
908 0.33
909 0.32
910 0.29
911 0.27
912 0.24
913 0.16
914 0.2
915 0.2
916 0.2
917 0.2
918 0.18
919 0.17