Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VLP4

Protein Details
Accession H1VLP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-231APAPAKEEKQERKSRKKKAAAAAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-226PAKEEKQERKSRKKKAA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045152  EDC4-like  
Gene Ontology GO:0031087  P:deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Amino Acid Sequences MYHPPTGMLVIGHPTRNSIYFAHLSAPKYNLKSVSQVEYIQRLVAQDTTIPQPDSTAVISGVREYSFANRGILRSLDILCNPAMAQETDEPTLFELYAMHSKGVACLLIKQAELGWTKDNKVLSPVDAVDAGVVTISKLKPPASQPVEANHQNTDTSHPPTRNIAKDSLLQTTPSQDENTPRRGPESVTPVKIAKAEPKEEETPVAAPAPAKEEKQERKSRKKKAAAAAAAAAAAAAGNDAQTNGSPRVGGSNNNTRDSGKSSANNSNSHANSITQESVETAISSMETRLQNGFNNLLNTSFKTLHSRIDDGLRAREADFDERQLKLLNMVSEVLNENTQKVLEALIQEQFSNAVIPTIASVAGKAVSDQFTKSMNNQVSQSVQKEIHKALPSATQHALQNGDFVKAISDRVGATVAANVQQEVVNTLTSRLGPSFTNMAVQACQRVAGELQKQHRTEMESLNAQRLAESNKVDQLSAIVTRLTGTISSMAASQEQFQNEFLKFQQQMIRVQAQAQQQQQQQQQQQPPQPQQLSHHHAAPSYNAPSVASQAPSQVPSQIQSQAYSNVQSPDRASQHSMSYGHSQALTVAKANNNEHDADLQARIAVINQSMREGRAEEAVVRWMQSGREQEVFEKYMSKYSPEFVRNLPHLVLLTVTATVSLNLESYTRERIAWLEMVVHSLQVSLGNMDEDARAVTPKIMGMLVARVEGLFVRISSTSGNDPVLKNLSQIIVNAKRVIDACQDEAQYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.26
4 0.27
5 0.22
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.29
10 0.32
11 0.33
12 0.34
13 0.37
14 0.38
15 0.38
16 0.41
17 0.39
18 0.37
19 0.41
20 0.41
21 0.43
22 0.39
23 0.4
24 0.4
25 0.4
26 0.38
27 0.32
28 0.29
29 0.24
30 0.22
31 0.19
32 0.16
33 0.14
34 0.16
35 0.2
36 0.23
37 0.23
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.22
42 0.19
43 0.16
44 0.13
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.16
53 0.19
54 0.2
55 0.21
56 0.21
57 0.22
58 0.24
59 0.24
60 0.21
61 0.2
62 0.21
63 0.21
64 0.2
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.16
69 0.14
70 0.14
71 0.11
72 0.14
73 0.15
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.19
80 0.16
81 0.12
82 0.09
83 0.11
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.1
93 0.13
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.2
100 0.22
101 0.21
102 0.23
103 0.24
104 0.26
105 0.29
106 0.3
107 0.25
108 0.27
109 0.26
110 0.22
111 0.22
112 0.21
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.19
128 0.23
129 0.34
130 0.34
131 0.38
132 0.38
133 0.41
134 0.48
135 0.47
136 0.46
137 0.37
138 0.33
139 0.29
140 0.28
141 0.28
142 0.24
143 0.26
144 0.3
145 0.3
146 0.31
147 0.38
148 0.45
149 0.45
150 0.45
151 0.42
152 0.38
153 0.43
154 0.43
155 0.4
156 0.33
157 0.29
158 0.26
159 0.27
160 0.26
161 0.22
162 0.22
163 0.19
164 0.27
165 0.31
166 0.38
167 0.37
168 0.35
169 0.36
170 0.35
171 0.36
172 0.33
173 0.38
174 0.37
175 0.36
176 0.38
177 0.36
178 0.36
179 0.36
180 0.31
181 0.3
182 0.29
183 0.31
184 0.31
185 0.36
186 0.37
187 0.36
188 0.35
189 0.28
190 0.24
191 0.21
192 0.18
193 0.14
194 0.11
195 0.11
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.18
200 0.27
201 0.35
202 0.44
203 0.54
204 0.59
205 0.68
206 0.78
207 0.84
208 0.85
209 0.86
210 0.85
211 0.84
212 0.84
213 0.75
214 0.67
215 0.58
216 0.48
217 0.38
218 0.29
219 0.2
220 0.1
221 0.06
222 0.04
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.13
236 0.14
237 0.17
238 0.2
239 0.29
240 0.32
241 0.34
242 0.35
243 0.31
244 0.32
245 0.34
246 0.31
247 0.26
248 0.26
249 0.29
250 0.36
251 0.39
252 0.39
253 0.37
254 0.4
255 0.36
256 0.34
257 0.3
258 0.23
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.12
263 0.12
264 0.1
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.19
281 0.15
282 0.16
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.19
291 0.2
292 0.23
293 0.25
294 0.26
295 0.23
296 0.26
297 0.28
298 0.23
299 0.25
300 0.2
301 0.19
302 0.17
303 0.18
304 0.16
305 0.18
306 0.16
307 0.18
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.18
312 0.16
313 0.14
314 0.15
315 0.12
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.18
366 0.19
367 0.21
368 0.21
369 0.17
370 0.18
371 0.18
372 0.2
373 0.2
374 0.23
375 0.22
376 0.22
377 0.2
378 0.23
379 0.23
380 0.24
381 0.24
382 0.21
383 0.19
384 0.2
385 0.21
386 0.14
387 0.16
388 0.13
389 0.13
390 0.11
391 0.1
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.11
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.12
436 0.16
437 0.2
438 0.26
439 0.32
440 0.32
441 0.32
442 0.33
443 0.33
444 0.32
445 0.3
446 0.27
447 0.26
448 0.27
449 0.29
450 0.28
451 0.24
452 0.2
453 0.19
454 0.19
455 0.16
456 0.18
457 0.16
458 0.19
459 0.2
460 0.19
461 0.18
462 0.15
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.11
482 0.12
483 0.12
484 0.13
485 0.16
486 0.15
487 0.16
488 0.15
489 0.19
490 0.18
491 0.2
492 0.25
493 0.24
494 0.28
495 0.31
496 0.33
497 0.27
498 0.28
499 0.3
500 0.3
501 0.33
502 0.33
503 0.35
504 0.35
505 0.41
506 0.45
507 0.47
508 0.48
509 0.5
510 0.54
511 0.55
512 0.59
513 0.59
514 0.6
515 0.61
516 0.57
517 0.51
518 0.5
519 0.52
520 0.54
521 0.48
522 0.46
523 0.39
524 0.38
525 0.36
526 0.33
527 0.29
528 0.23
529 0.22
530 0.18
531 0.18
532 0.17
533 0.19
534 0.18
535 0.15
536 0.13
537 0.15
538 0.16
539 0.17
540 0.17
541 0.16
542 0.15
543 0.15
544 0.18
545 0.2
546 0.2
547 0.2
548 0.21
549 0.22
550 0.22
551 0.22
552 0.22
553 0.2
554 0.2
555 0.2
556 0.21
557 0.24
558 0.26
559 0.27
560 0.29
561 0.27
562 0.28
563 0.31
564 0.3
565 0.26
566 0.28
567 0.26
568 0.24
569 0.22
570 0.19
571 0.18
572 0.19
573 0.17
574 0.14
575 0.16
576 0.17
577 0.22
578 0.24
579 0.25
580 0.25
581 0.25
582 0.24
583 0.22
584 0.21
585 0.18
586 0.17
587 0.13
588 0.11
589 0.1
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.11
595 0.12
596 0.15
597 0.16
598 0.16
599 0.17
600 0.17
601 0.16
602 0.16
603 0.16
604 0.14
605 0.14
606 0.17
607 0.17
608 0.16
609 0.16
610 0.14
611 0.15
612 0.19
613 0.23
614 0.23
615 0.26
616 0.27
617 0.28
618 0.32
619 0.33
620 0.28
621 0.28
622 0.24
623 0.27
624 0.26
625 0.27
626 0.24
627 0.26
628 0.34
629 0.32
630 0.35
631 0.32
632 0.39
633 0.38
634 0.4
635 0.36
636 0.29
637 0.27
638 0.24
639 0.21
640 0.14
641 0.12
642 0.09
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.1
653 0.12
654 0.17
655 0.17
656 0.17
657 0.17
658 0.19
659 0.22
660 0.21
661 0.19
662 0.18
663 0.17
664 0.2
665 0.19
666 0.17
667 0.13
668 0.12
669 0.11
670 0.09
671 0.1
672 0.07
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.11
684 0.11
685 0.11
686 0.12
687 0.11
688 0.11
689 0.11
690 0.13
691 0.13
692 0.12
693 0.12
694 0.1
695 0.11
696 0.11
697 0.11
698 0.08
699 0.07
700 0.1
701 0.1
702 0.11
703 0.12
704 0.15
705 0.17
706 0.18
707 0.21
708 0.23
709 0.24
710 0.28
711 0.31
712 0.28
713 0.26
714 0.26
715 0.25
716 0.22
717 0.23
718 0.28
719 0.3
720 0.33
721 0.35
722 0.32
723 0.33
724 0.33
725 0.35
726 0.33
727 0.3
728 0.31
729 0.33