Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VAV0

Protein Details
Accession H1VAV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29YVSPHRRKKGTPQPEASTRPQHydrophilic
241-260LAPKPKPKPRPAAARPRPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-264PKPKPKPRPAAARPRPAAAPAK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Amino Acid Sequences MADDNAASYVSPHRRKKGTPQPEASTRPQQDEPDLLFSSQTQAPKQAQSLPQRPAQPSQPSSRPAQSAQRPSPPAPKPAPRPARQIPSISPAAIQQSTKHRLDGTAHFKRGDYGAAHSSYSASLAAVPSSHPLAIVILTNRALTALKTGEPKQAVEDADAALKIIGPAGGQGEHVAVLSDNGGEERREMRDLYGKALSRKAEALEQMERWGDAHAVWSTCVKDGVGGPSAISGRQRCQSALAPKPKPKPRPAAARPRPAAAPAKSSDAVERLRKQNQAAAQEDDEKFALSEKVDAKIAAWRDGKRENLRALIGSLDQVLWEGSGWKKVGLHELVMANKVKIHYMKAIAKCHPDKLPQDASTEVRLIAATVFATLNESWDKFKAENGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.73
4 0.76
5 0.77
6 0.77
7 0.78
8 0.78
9 0.8
10 0.81
11 0.78
12 0.77
13 0.69
14 0.65
15 0.6
16 0.55
17 0.5
18 0.49
19 0.45
20 0.4
21 0.38
22 0.32
23 0.29
24 0.26
25 0.27
26 0.24
27 0.24
28 0.2
29 0.25
30 0.28
31 0.31
32 0.33
33 0.36
34 0.4
35 0.47
36 0.54
37 0.52
38 0.54
39 0.57
40 0.58
41 0.55
42 0.55
43 0.55
44 0.52
45 0.55
46 0.56
47 0.53
48 0.55
49 0.55
50 0.51
51 0.46
52 0.51
53 0.52
54 0.55
55 0.58
56 0.61
57 0.61
58 0.61
59 0.66
60 0.61
61 0.6
62 0.57
63 0.6
64 0.6
65 0.66
66 0.72
67 0.67
68 0.72
69 0.72
70 0.73
71 0.68
72 0.64
73 0.56
74 0.52
75 0.49
76 0.41
77 0.33
78 0.26
79 0.26
80 0.24
81 0.21
82 0.19
83 0.26
84 0.33
85 0.33
86 0.33
87 0.29
88 0.3
89 0.34
90 0.39
91 0.4
92 0.42
93 0.43
94 0.43
95 0.42
96 0.41
97 0.37
98 0.31
99 0.23
100 0.18
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.19
105 0.18
106 0.15
107 0.15
108 0.11
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.14
135 0.16
136 0.2
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.22
141 0.21
142 0.18
143 0.17
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.17
178 0.18
179 0.19
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.26
184 0.25
185 0.19
186 0.2
187 0.18
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.08
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.2
225 0.25
226 0.3
227 0.38
228 0.45
229 0.48
230 0.54
231 0.64
232 0.69
233 0.71
234 0.7
235 0.71
236 0.7
237 0.74
238 0.76
239 0.78
240 0.78
241 0.8
242 0.74
243 0.67
244 0.6
245 0.53
246 0.51
247 0.41
248 0.37
249 0.28
250 0.32
251 0.3
252 0.3
253 0.27
254 0.24
255 0.27
256 0.29
257 0.33
258 0.35
259 0.4
260 0.42
261 0.42
262 0.43
263 0.43
264 0.43
265 0.4
266 0.37
267 0.34
268 0.37
269 0.36
270 0.33
271 0.28
272 0.22
273 0.19
274 0.16
275 0.15
276 0.09
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.19
284 0.2
285 0.23
286 0.26
287 0.26
288 0.31
289 0.36
290 0.43
291 0.45
292 0.5
293 0.46
294 0.45
295 0.44
296 0.4
297 0.36
298 0.29
299 0.23
300 0.17
301 0.14
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.05
308 0.08
309 0.08
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.16
314 0.18
315 0.25
316 0.24
317 0.24
318 0.24
319 0.27
320 0.28
321 0.3
322 0.3
323 0.22
324 0.23
325 0.22
326 0.23
327 0.21
328 0.23
329 0.24
330 0.31
331 0.39
332 0.43
333 0.5
334 0.5
335 0.58
336 0.58
337 0.58
338 0.56
339 0.56
340 0.53
341 0.55
342 0.58
343 0.5
344 0.51
345 0.49
346 0.46
347 0.42
348 0.39
349 0.3
350 0.22
351 0.2
352 0.17
353 0.14
354 0.11
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.11
360 0.1
361 0.13
362 0.16
363 0.17
364 0.19
365 0.21
366 0.25
367 0.22