Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5EFC8

Protein Details
Accession A0A5J5EFC8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-123DGVNGVSKKRRKKSSNGHDGDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-114KKRRKK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_mito 10.333, cyto_nucl 9.166, mito 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR045183  Ebi-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MQESFRARVKPNLLIYLIQRGLQYEELASQIDRDGTIREPARPFQFLPSSPTAALEEDEGVGSDGHHMEEDDEENDSITLQSKSPTVTSTTSANAKKHGMEDGVNGVSKKRRKKSSNGHDGDVQMTDAVPSPPLTEELPFTNGRSVGTQIEEPVEILKADTLVVEDWDQMVSENGDEKTMSCAWNPVVSTLLATSVRIWNVPEDATSSEVLEHVALSREPSRTGTDKAKVTAIRWSPEGNKLASGSFEGQTRIWSADGKLEYNMFLHSAPISSLKWNKSASILLTLSCDGKMIAWDAATGETHQVFDLEETVTDIEWFSESRFMACGESGNIHQLDIGVAKPLHSLLAHAGEVTCIAWDESTATVATGGCDASVSIWHKPNETSKPDALCKLQGHTLPVVSIAWQPGVEFIPASPKRLLASASDDCTIRLWDVVSQTCLRVLQRHADPIECICFSPDGSKLASGAYGGVLVWKVESGALTHVYDRARPHRKNGAEDSVETSGLSWDEGSQRLAIGEGATKCTVVRVCGPIAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.45
4 0.41
5 0.35
6 0.3
7 0.26
8 0.27
9 0.26
10 0.24
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.21
24 0.23
25 0.27
26 0.31
27 0.36
28 0.41
29 0.42
30 0.41
31 0.41
32 0.45
33 0.41
34 0.44
35 0.43
36 0.41
37 0.38
38 0.38
39 0.32
40 0.26
41 0.25
42 0.19
43 0.15
44 0.12
45 0.12
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.14
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.2
77 0.23
78 0.29
79 0.33
80 0.33
81 0.33
82 0.33
83 0.33
84 0.32
85 0.31
86 0.26
87 0.22
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.21
93 0.21
94 0.26
95 0.32
96 0.4
97 0.44
98 0.53
99 0.58
100 0.69
101 0.77
102 0.81
103 0.86
104 0.8
105 0.74
106 0.68
107 0.62
108 0.53
109 0.42
110 0.31
111 0.19
112 0.15
113 0.12
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.17
126 0.16
127 0.17
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.14
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.11
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.16
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.07
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.13
208 0.16
209 0.18
210 0.22
211 0.25
212 0.28
213 0.29
214 0.29
215 0.32
216 0.29
217 0.27
218 0.31
219 0.28
220 0.24
221 0.23
222 0.24
223 0.23
224 0.27
225 0.28
226 0.22
227 0.2
228 0.19
229 0.18
230 0.16
231 0.15
232 0.12
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.1
260 0.15
261 0.16
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.2
266 0.21
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.08
341 0.06
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.08
361 0.11
362 0.14
363 0.2
364 0.21
365 0.22
366 0.25
367 0.32
368 0.36
369 0.39
370 0.4
371 0.39
372 0.43
373 0.45
374 0.45
375 0.4
376 0.38
377 0.35
378 0.32
379 0.32
380 0.29
381 0.29
382 0.27
383 0.25
384 0.19
385 0.18
386 0.15
387 0.12
388 0.12
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.1
396 0.08
397 0.07
398 0.18
399 0.18
400 0.22
401 0.21
402 0.21
403 0.22
404 0.23
405 0.24
406 0.16
407 0.23
408 0.23
409 0.25
410 0.26
411 0.25
412 0.24
413 0.24
414 0.22
415 0.15
416 0.12
417 0.1
418 0.11
419 0.15
420 0.16
421 0.19
422 0.19
423 0.19
424 0.2
425 0.21
426 0.2
427 0.21
428 0.22
429 0.27
430 0.3
431 0.36
432 0.36
433 0.36
434 0.36
435 0.34
436 0.35
437 0.28
438 0.24
439 0.18
440 0.18
441 0.17
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.16
446 0.16
447 0.15
448 0.15
449 0.15
450 0.12
451 0.1
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.09
465 0.12
466 0.13
467 0.14
468 0.17
469 0.18
470 0.21
471 0.27
472 0.35
473 0.42
474 0.45
475 0.52
476 0.59
477 0.64
478 0.69
479 0.7
480 0.69
481 0.62
482 0.61
483 0.58
484 0.5
485 0.44
486 0.36
487 0.28
488 0.2
489 0.16
490 0.15
491 0.09
492 0.09
493 0.12
494 0.14
495 0.15
496 0.14
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.11
502 0.15
503 0.15
504 0.19
505 0.19
506 0.19
507 0.18
508 0.22
509 0.23
510 0.2
511 0.24
512 0.25