Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VS49

Protein Details
Accession H1VS49    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-45QPLPPTQQQQQQQHQQQNQPQHPHydrophilic
85-114ASNTSRKSRATGRPRGRPRKQPRAESQGNTHydrophilic
899-937KTPTRPTPSHRPITRQHRFQWFLGPRCQRWRRCSQPIQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-107TSRKSRATGRPRGRPRKQPR
667-694EKDGARLGQQRRARGTGRAPRPPKTKKS
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042403  Spt21/Ams2  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MHPDLQHHQYFQRSNSFTYSAPQPLPPTQQQQQQQHQQQNQPQHPQPQPQPPMQNSDGPNRVAPTPVDTATETQVNPPSRPSSRASNTSRKSRATGRPRGRPRKQPRAESQGNTSGYEDGTDGDDGPAKKKRATVMTQVTSNINAPFGGGPESLRVTASTAGSLRTLRPMGISVEAPMGSHMQDVPRAPTPVPERGPMMPQTGKPTNSSKLRRQSTLSQAATPPGQPQYPEPPFALSPSQQDGRSPDSDAVSPAYSDDSPAAIGSSPPVPRNTRFVRSSPPASSPILPPMPMPQPDSGFMSGGVDDVFEADGARLQLPKPVALPSARRSNSNTTKQRSAQPPQIPVYTFHLATQPSSEMDSAPNNNNKQQVTPRPPITTLPLESSLPLQHAASDSAVTLPPPPQPAEKEPSPQQQEHVVAANPDVQTDSQIAPKVEAGLPGECLDMGLEKLAQAVRNMSPETVLPDPRMDPAVSATFARPSAPPSLSRSNSSGFSLALPSVPASDPIGPVALPAPALPQATSFSEAPCPPSDALQPPRSPPQPSKSNKNYVKKQAIREKLLQAIASGQTPMYCSNCGAIETPTWRKIWSQEHEGVPEFTEFSDKPGRITAILVLDRDADEKPIRYQIIKKTLSPHEDKADWKDHMLCNPCGIWLTKWKSHRPQDKWEKDGARLGQQRRARGTGRAPRPPKTKKSGSANPLNPTSEAYFTTDPIGPDDRGASPMDESRSRGVSQFSNVNDASQRSMSQFSASQPPEYYGSQPTSPGNVSNPGSTHSRGSGTAKSPITIDTTDVQGMGATRRLLFPSPRKGGVSKALGELAVNVVQTVLEPNPSVVAAQNKELTIKEHGEGATSSGGSGANKENLAVPEEDALEDLFRSPGLARPSTPPPRERAANNGPFKTPTRPTPSHRPITRQHRFQWFLGPRCQRWRRCSQPIQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.48
3 0.46
4 0.39
5 0.39
6 0.4
7 0.36
8 0.35
9 0.36
10 0.36
11 0.38
12 0.45
13 0.47
14 0.49
15 0.5
16 0.56
17 0.62
18 0.66
19 0.71
20 0.74
21 0.77
22 0.79
23 0.8
24 0.81
25 0.79
26 0.8
27 0.78
28 0.77
29 0.74
30 0.74
31 0.73
32 0.73
33 0.74
34 0.74
35 0.72
36 0.71
37 0.74
38 0.67
39 0.68
40 0.62
41 0.61
42 0.54
43 0.57
44 0.54
45 0.47
46 0.46
47 0.41
48 0.38
49 0.33
50 0.31
51 0.27
52 0.26
53 0.24
54 0.25
55 0.24
56 0.25
57 0.26
58 0.29
59 0.24
60 0.24
61 0.3
62 0.31
63 0.3
64 0.32
65 0.36
66 0.36
67 0.39
68 0.39
69 0.42
70 0.46
71 0.55
72 0.59
73 0.62
74 0.67
75 0.73
76 0.75
77 0.68
78 0.66
79 0.66
80 0.69
81 0.69
82 0.72
83 0.72
84 0.76
85 0.84
86 0.9
87 0.9
88 0.9
89 0.91
90 0.91
91 0.91
92 0.9
93 0.88
94 0.88
95 0.87
96 0.8
97 0.76
98 0.73
99 0.65
100 0.56
101 0.48
102 0.39
103 0.3
104 0.26
105 0.19
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.14
112 0.15
113 0.2
114 0.26
115 0.27
116 0.29
117 0.32
118 0.37
119 0.41
120 0.46
121 0.51
122 0.54
123 0.56
124 0.56
125 0.54
126 0.49
127 0.42
128 0.39
129 0.29
130 0.19
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.13
171 0.14
172 0.17
173 0.2
174 0.22
175 0.21
176 0.27
177 0.31
178 0.36
179 0.37
180 0.35
181 0.34
182 0.34
183 0.38
184 0.34
185 0.35
186 0.3
187 0.29
188 0.35
189 0.37
190 0.37
191 0.37
192 0.39
193 0.41
194 0.48
195 0.53
196 0.54
197 0.59
198 0.63
199 0.62
200 0.63
201 0.63
202 0.63
203 0.66
204 0.58
205 0.51
206 0.47
207 0.46
208 0.42
209 0.34
210 0.28
211 0.2
212 0.2
213 0.17
214 0.2
215 0.28
216 0.3
217 0.31
218 0.29
219 0.29
220 0.28
221 0.3
222 0.3
223 0.21
224 0.22
225 0.24
226 0.27
227 0.24
228 0.26
229 0.27
230 0.28
231 0.28
232 0.26
233 0.24
234 0.22
235 0.22
236 0.21
237 0.2
238 0.15
239 0.14
240 0.12
241 0.13
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.18
256 0.22
257 0.24
258 0.32
259 0.36
260 0.39
261 0.41
262 0.42
263 0.46
264 0.48
265 0.51
266 0.46
267 0.43
268 0.4
269 0.38
270 0.38
271 0.31
272 0.31
273 0.27
274 0.24
275 0.21
276 0.22
277 0.25
278 0.25
279 0.26
280 0.22
281 0.22
282 0.24
283 0.27
284 0.23
285 0.18
286 0.17
287 0.15
288 0.12
289 0.11
290 0.09
291 0.06
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.14
309 0.16
310 0.21
311 0.22
312 0.32
313 0.32
314 0.33
315 0.36
316 0.44
317 0.5
318 0.56
319 0.59
320 0.55
321 0.61
322 0.62
323 0.65
324 0.63
325 0.6
326 0.59
327 0.56
328 0.56
329 0.52
330 0.51
331 0.44
332 0.38
333 0.39
334 0.32
335 0.27
336 0.22
337 0.22
338 0.2
339 0.19
340 0.18
341 0.13
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.09
346 0.1
347 0.13
348 0.14
349 0.18
350 0.24
351 0.24
352 0.27
353 0.31
354 0.3
355 0.3
356 0.34
357 0.39
358 0.41
359 0.46
360 0.47
361 0.45
362 0.45
363 0.44
364 0.41
365 0.35
366 0.28
367 0.24
368 0.23
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.16
373 0.13
374 0.12
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.09
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.17
392 0.21
393 0.26
394 0.26
395 0.3
396 0.33
397 0.39
398 0.42
399 0.39
400 0.36
401 0.34
402 0.34
403 0.3
404 0.27
405 0.19
406 0.15
407 0.15
408 0.17
409 0.12
410 0.11
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.13
422 0.11
423 0.12
424 0.11
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.04
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.08
442 0.09
443 0.11
444 0.11
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.11
453 0.12
454 0.12
455 0.14
456 0.1
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.1
466 0.09
467 0.1
468 0.13
469 0.13
470 0.15
471 0.19
472 0.26
473 0.27
474 0.29
475 0.29
476 0.27
477 0.27
478 0.26
479 0.21
480 0.14
481 0.13
482 0.12
483 0.1
484 0.08
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.09
508 0.12
509 0.11
510 0.1
511 0.13
512 0.14
513 0.16
514 0.14
515 0.16
516 0.13
517 0.15
518 0.17
519 0.2
520 0.25
521 0.28
522 0.29
523 0.29
524 0.35
525 0.37
526 0.38
527 0.37
528 0.38
529 0.43
530 0.47
531 0.54
532 0.55
533 0.63
534 0.68
535 0.73
536 0.73
537 0.73
538 0.78
539 0.74
540 0.75
541 0.75
542 0.73
543 0.68
544 0.65
545 0.58
546 0.52
547 0.47
548 0.38
549 0.29
550 0.23
551 0.19
552 0.15
553 0.12
554 0.08
555 0.07
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.15
568 0.19
569 0.21
570 0.21
571 0.21
572 0.21
573 0.26
574 0.32
575 0.33
576 0.35
577 0.39
578 0.4
579 0.42
580 0.42
581 0.36
582 0.28
583 0.24
584 0.17
585 0.11
586 0.13
587 0.1
588 0.13
589 0.19
590 0.18
591 0.19
592 0.2
593 0.21
594 0.18
595 0.19
596 0.17
597 0.16
598 0.17
599 0.16
600 0.14
601 0.14
602 0.14
603 0.15
604 0.13
605 0.11
606 0.11
607 0.13
608 0.14
609 0.18
610 0.19
611 0.2
612 0.25
613 0.31
614 0.39
615 0.4
616 0.41
617 0.43
618 0.48
619 0.52
620 0.51
621 0.47
622 0.41
623 0.42
624 0.42
625 0.41
626 0.41
627 0.35
628 0.32
629 0.34
630 0.31
631 0.34
632 0.37
633 0.32
634 0.28
635 0.27
636 0.25
637 0.22
638 0.21
639 0.17
640 0.21
641 0.27
642 0.31
643 0.37
644 0.45
645 0.53
646 0.61
647 0.7
648 0.67
649 0.72
650 0.78
651 0.8
652 0.76
653 0.74
654 0.67
655 0.6
656 0.59
657 0.51
658 0.48
659 0.48
660 0.47
661 0.47
662 0.47
663 0.5
664 0.47
665 0.5
666 0.43
667 0.41
668 0.48
669 0.5
670 0.55
671 0.59
672 0.6
673 0.64
674 0.71
675 0.75
676 0.74
677 0.73
678 0.73
679 0.71
680 0.76
681 0.77
682 0.75
683 0.76
684 0.73
685 0.69
686 0.64
687 0.57
688 0.47
689 0.41
690 0.35
691 0.26
692 0.21
693 0.21
694 0.19
695 0.18
696 0.2
697 0.2
698 0.18
699 0.2
700 0.22
701 0.17
702 0.17
703 0.19
704 0.17
705 0.16
706 0.17
707 0.14
708 0.13
709 0.16
710 0.2
711 0.19
712 0.21
713 0.22
714 0.24
715 0.24
716 0.24
717 0.24
718 0.22
719 0.24
720 0.27
721 0.25
722 0.28
723 0.27
724 0.27
725 0.26
726 0.25
727 0.24
728 0.2
729 0.2
730 0.16
731 0.19
732 0.18
733 0.18
734 0.19
735 0.19
736 0.27
737 0.28
738 0.28
739 0.26
740 0.27
741 0.28
742 0.28
743 0.28
744 0.23
745 0.25
746 0.23
747 0.25
748 0.24
749 0.24
750 0.24
751 0.23
752 0.21
753 0.23
754 0.24
755 0.24
756 0.23
757 0.23
758 0.25
759 0.25
760 0.25
761 0.21
762 0.21
763 0.22
764 0.25
765 0.29
766 0.28
767 0.34
768 0.33
769 0.31
770 0.3
771 0.29
772 0.28
773 0.23
774 0.22
775 0.16
776 0.17
777 0.17
778 0.16
779 0.15
780 0.12
781 0.12
782 0.12
783 0.13
784 0.12
785 0.12
786 0.14
787 0.16
788 0.2
789 0.27
790 0.34
791 0.41
792 0.45
793 0.48
794 0.49
795 0.49
796 0.5
797 0.5
798 0.47
799 0.39
800 0.36
801 0.33
802 0.3
803 0.29
804 0.24
805 0.18
806 0.14
807 0.11
808 0.09
809 0.08
810 0.08
811 0.08
812 0.1
813 0.08
814 0.09
815 0.09
816 0.09
817 0.1
818 0.11
819 0.11
820 0.11
821 0.18
822 0.18
823 0.22
824 0.24
825 0.24
826 0.25
827 0.26
828 0.26
829 0.24
830 0.25
831 0.22
832 0.24
833 0.23
834 0.24
835 0.23
836 0.22
837 0.19
838 0.16
839 0.15
840 0.12
841 0.13
842 0.11
843 0.14
844 0.15
845 0.16
846 0.16
847 0.17
848 0.2
849 0.2
850 0.23
851 0.21
852 0.18
853 0.17
854 0.18
855 0.17
856 0.14
857 0.13
858 0.11
859 0.1
860 0.1
861 0.08
862 0.07
863 0.08
864 0.08
865 0.13
866 0.19
867 0.21
868 0.22
869 0.27
870 0.38
871 0.47
872 0.53
873 0.52
874 0.51
875 0.57
876 0.61
877 0.58
878 0.58
879 0.58
880 0.62
881 0.65
882 0.63
883 0.58
884 0.56
885 0.57
886 0.55
887 0.5
888 0.49
889 0.51
890 0.55
891 0.6
892 0.67
893 0.73
894 0.76
895 0.76
896 0.75
897 0.75
898 0.8
899 0.82
900 0.8
901 0.78
902 0.79
903 0.78
904 0.72
905 0.73
906 0.71
907 0.67
908 0.68
909 0.69
910 0.65
911 0.71
912 0.79
913 0.77
914 0.77
915 0.81
916 0.81
917 0.83