Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5FAT7

Protein Details
Accession A0A5J5FAT7    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-402DPEDAKPKKVAKKSEKELELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
386-396DAKPKKVAKKS
Subcellular Location(s) cyto 9, pero 9, cyto_pero 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF08271  TF_Zn_Ribbon  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51134  ZF_TFIIB  
Amino Acid Sequences MGHLEGKNPLEQDLRCPECLEDPPNVVEDFKSGDILCRSCGLVTQSGLVDMRAEWRTFEGDAETGRVDPTRAGKGYNELLKGEQLSTLIGGGGKNKALSSEGVSLSRLQTKVSVDSINLRLQEGFARIEALCATAGVSQIVQEAAKHVLSQTKQAGMGGGLDAGWCLACIYHGAKRVGMEIDKRTITRIGGNVPMKAWTRHIFDMNRLNWQEGEKQRQKLIEQGKTEEQAARLTNTLSGAARVTPRSLMVRFCQAVGVPIWVESIAAQICDTIDDTLLLGGRAASNIATVGIYIASHVVGLPMQFDAVFPLSGLSKATMRNATKKCFDSRVEMLKNHYWPKDPRVKDELFEQIMDKKYFASPLKPSPPPDPVLSTGVKRKASDPEDAKPKKVAKKSEKELELSEGKEKFVGIGLHRLPQTPTIKIGNLIFPAAVKNEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.38
4 0.37
5 0.36
6 0.41
7 0.37
8 0.31
9 0.3
10 0.3
11 0.31
12 0.3
13 0.25
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.16
18 0.17
19 0.14
20 0.19
21 0.23
22 0.24
23 0.23
24 0.21
25 0.21
26 0.19
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.2
31 0.21
32 0.19
33 0.21
34 0.21
35 0.18
36 0.15
37 0.11
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.15
42 0.17
43 0.19
44 0.19
45 0.2
46 0.16
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.13
56 0.17
57 0.21
58 0.21
59 0.23
60 0.23
61 0.28
62 0.34
63 0.36
64 0.33
65 0.28
66 0.28
67 0.29
68 0.29
69 0.24
70 0.18
71 0.13
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.25
94 0.21
95 0.16
96 0.18
97 0.19
98 0.21
99 0.23
100 0.21
101 0.17
102 0.23
103 0.25
104 0.25
105 0.24
106 0.22
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.17
111 0.14
112 0.11
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.13
136 0.14
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.19
143 0.14
144 0.14
145 0.09
146 0.07
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.02
154 0.02
155 0.03
156 0.04
157 0.07
158 0.1
159 0.16
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.21
167 0.17
168 0.2
169 0.21
170 0.2
171 0.2
172 0.2
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.15
177 0.21
178 0.22
179 0.21
180 0.2
181 0.23
182 0.21
183 0.21
184 0.22
185 0.18
186 0.21
187 0.22
188 0.27
189 0.25
190 0.28
191 0.36
192 0.33
193 0.36
194 0.32
195 0.31
196 0.27
197 0.27
198 0.3
199 0.26
200 0.35
201 0.34
202 0.36
203 0.37
204 0.38
205 0.37
206 0.37
207 0.41
208 0.37
209 0.33
210 0.34
211 0.34
212 0.33
213 0.34
214 0.28
215 0.21
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.2
238 0.19
239 0.19
240 0.18
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.14
305 0.21
306 0.24
307 0.33
308 0.38
309 0.42
310 0.46
311 0.48
312 0.5
313 0.49
314 0.48
315 0.45
316 0.47
317 0.52
318 0.51
319 0.49
320 0.5
321 0.49
322 0.53
323 0.52
324 0.48
325 0.45
326 0.44
327 0.51
328 0.56
329 0.53
330 0.54
331 0.56
332 0.55
333 0.5
334 0.5
335 0.48
336 0.4
337 0.38
338 0.32
339 0.3
340 0.34
341 0.33
342 0.28
343 0.22
344 0.22
345 0.28
346 0.28
347 0.29
348 0.29
349 0.38
350 0.46
351 0.49
352 0.52
353 0.51
354 0.54
355 0.51
356 0.48
357 0.43
358 0.39
359 0.39
360 0.38
361 0.37
362 0.39
363 0.43
364 0.43
365 0.4
366 0.4
367 0.45
368 0.45
369 0.5
370 0.48
371 0.49
372 0.57
373 0.59
374 0.59
375 0.57
376 0.61
377 0.61
378 0.63
379 0.65
380 0.65
381 0.73
382 0.79
383 0.82
384 0.79
385 0.73
386 0.68
387 0.64
388 0.57
389 0.49
390 0.47
391 0.38
392 0.33
393 0.3
394 0.28
395 0.21
396 0.21
397 0.22
398 0.18
399 0.26
400 0.27
401 0.32
402 0.33
403 0.35
404 0.32
405 0.37
406 0.39
407 0.32
408 0.35
409 0.34
410 0.35
411 0.36
412 0.37
413 0.34
414 0.31
415 0.3
416 0.25
417 0.21
418 0.22