Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5F9N7

Protein Details
Accession A0A5J5F9N7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-267AHPALKPKKKRGPPENGVPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-202KKGRGGFRGGRGRGRGGRGGAKRGNR
252-259KPKKKRGP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, cyto 12.5, nucl 11, mito_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSANAAETVVAAENTAQTAASNTVEAITEAVKNTSISPKSGEEKDTSETDAAHIVSAAEGRRLYIGNLAYSTTDEQLKEFFSGYSVESTSIPTNPRTGRAVGYAFVDLTTKEEADRAIEELSGKEVQERKVSVQLARKPGSAGTGNGSKKADKPTTEEGAAPATEGEQPQQQQGGQKKGRGGFRGGRGRGRGGRGGAKRGNREPATSGEEEKAAAVPGQVLPLVESTNVKADAAAQAAPAASQNEGAHPALKPKKKRGPPENGVPSSTKIMVANLPYELSEEKLKELFQDYQPESAKIALRPIPRYMVRKLQQRGEPRKGRGFGFVNLASEEMQKKAVEEMNGKVVDGREIAVKVAIDSQAEGEDKENSGDEKKAEASKEGQNGVATEPQAVNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.07
4 0.06
5 0.08
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.15
21 0.22
22 0.22
23 0.22
24 0.25
25 0.29
26 0.35
27 0.38
28 0.38
29 0.33
30 0.35
31 0.37
32 0.35
33 0.33
34 0.28
35 0.24
36 0.22
37 0.21
38 0.18
39 0.14
40 0.12
41 0.09
42 0.09
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.14
60 0.16
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.14
76 0.15
77 0.17
78 0.18
79 0.17
80 0.22
81 0.23
82 0.26
83 0.26
84 0.26
85 0.25
86 0.27
87 0.27
88 0.22
89 0.22
90 0.19
91 0.16
92 0.14
93 0.13
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.14
112 0.17
113 0.19
114 0.23
115 0.24
116 0.23
117 0.28
118 0.3
119 0.3
120 0.35
121 0.39
122 0.43
123 0.43
124 0.41
125 0.36
126 0.34
127 0.33
128 0.26
129 0.21
130 0.17
131 0.23
132 0.23
133 0.25
134 0.26
135 0.23
136 0.25
137 0.32
138 0.32
139 0.26
140 0.32
141 0.35
142 0.37
143 0.37
144 0.34
145 0.27
146 0.25
147 0.23
148 0.17
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.16
160 0.21
161 0.3
162 0.3
163 0.32
164 0.35
165 0.39
166 0.42
167 0.38
168 0.38
169 0.33
170 0.39
171 0.46
172 0.44
173 0.43
174 0.4
175 0.42
176 0.4
177 0.38
178 0.31
179 0.25
180 0.3
181 0.29
182 0.34
183 0.34
184 0.35
185 0.37
186 0.37
187 0.43
188 0.36
189 0.36
190 0.31
191 0.3
192 0.31
193 0.28
194 0.27
195 0.2
196 0.19
197 0.18
198 0.16
199 0.12
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.19
237 0.25
238 0.32
239 0.37
240 0.45
241 0.55
242 0.61
243 0.71
244 0.73
245 0.76
246 0.76
247 0.81
248 0.81
249 0.73
250 0.67
251 0.58
252 0.5
253 0.42
254 0.36
255 0.26
256 0.17
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.18
274 0.2
275 0.2
276 0.28
277 0.28
278 0.33
279 0.35
280 0.34
281 0.31
282 0.3
283 0.29
284 0.22
285 0.26
286 0.25
287 0.28
288 0.31
289 0.32
290 0.35
291 0.38
292 0.42
293 0.42
294 0.46
295 0.49
296 0.55
297 0.58
298 0.6
299 0.61
300 0.68
301 0.73
302 0.73
303 0.75
304 0.72
305 0.75
306 0.71
307 0.65
308 0.62
309 0.56
310 0.47
311 0.46
312 0.4
313 0.33
314 0.3
315 0.29
316 0.22
317 0.22
318 0.21
319 0.15
320 0.16
321 0.15
322 0.15
323 0.19
324 0.21
325 0.22
326 0.24
327 0.25
328 0.31
329 0.31
330 0.3
331 0.28
332 0.25
333 0.23
334 0.2
335 0.18
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.12
342 0.15
343 0.15
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.17
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.24
361 0.27
362 0.28
363 0.29
364 0.31
365 0.36
366 0.41
367 0.4
368 0.37
369 0.34
370 0.33
371 0.32
372 0.32
373 0.25
374 0.22