Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5EX20

Protein Details
Accession A0A5J5EX20    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-148VDMPKPQPKYVEKNKKKQDTGLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR006640  SprT-like_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0051716  P:cellular response to stimulus  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PF10263  SprT-like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MARTPPPRRRVEYEGGSGNSDDEFQSVKSGEGREEQKKTARLVMSYELSSDEEKAEKQSILNSDEDEEVVEKQSTTDTNEPKRLFIFSCNEEEEAQEKPSVRMSSTKPAKTGPKKLAIFTSDEESDVDMPKPQPKYVEKNKKKQDTGLEDLFSRTTLSETPAKKQPVRTPARRSKYDPVFDSTDDGADSDSDVPWETLKTPAKPVRKIPESSIFEDIIARHSVVEAEDDGRRKSTRPGPSNLPRVPHTVEPETPRKGASFKSPEKKLVRIPPTPYRETHDEFWDQETTIRWNEQHGTEKKPLPGSSRAAAIAILSSDPESESDDDWIVHDDDRYRTPRRSKAMIPAKTPATSRVDKKEWEARKHDMALQFIQEMDRKIENGAVGKYYACQGGLRLEWNQSLRTTAGRARMTRGIIELSPKIITGEERLYDTLAHEFCHLCVWAISRDKKDVHGPIFKSWARVIVREFPHINKITTTHNYKIDYKFEFTCQTTGCLYVWGRQSKPPHELSRYRCPKCAVGHLTQIKPKPRATESAYNRFTKENMARIKQENPGSPMKEVMRLVGQEWRAHKLKTAQPPLREMSDPNSDIPAEASSSSSCGLEHLIFDFKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.61
3 0.55
4 0.48
5 0.4
6 0.3
7 0.24
8 0.18
9 0.12
10 0.12
11 0.1
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.17
16 0.19
17 0.2
18 0.26
19 0.33
20 0.39
21 0.43
22 0.47
23 0.51
24 0.54
25 0.55
26 0.55
27 0.5
28 0.44
29 0.43
30 0.44
31 0.4
32 0.35
33 0.33
34 0.26
35 0.25
36 0.24
37 0.21
38 0.17
39 0.15
40 0.16
41 0.19
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.23
46 0.26
47 0.27
48 0.28
49 0.25
50 0.24
51 0.24
52 0.23
53 0.19
54 0.15
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.14
62 0.18
63 0.26
64 0.32
65 0.39
66 0.48
67 0.48
68 0.48
69 0.48
70 0.45
71 0.39
72 0.37
73 0.36
74 0.31
75 0.36
76 0.36
77 0.36
78 0.33
79 0.33
80 0.28
81 0.23
82 0.21
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.23
87 0.22
88 0.22
89 0.26
90 0.3
91 0.38
92 0.46
93 0.48
94 0.44
95 0.49
96 0.58
97 0.61
98 0.65
99 0.62
100 0.63
101 0.62
102 0.62
103 0.62
104 0.53
105 0.48
106 0.41
107 0.38
108 0.28
109 0.27
110 0.25
111 0.21
112 0.2
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.16
117 0.21
118 0.23
119 0.23
120 0.29
121 0.34
122 0.43
123 0.51
124 0.61
125 0.65
126 0.73
127 0.82
128 0.85
129 0.81
130 0.77
131 0.76
132 0.73
133 0.7
134 0.64
135 0.55
136 0.46
137 0.44
138 0.38
139 0.28
140 0.2
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.12
145 0.19
146 0.2
147 0.25
148 0.32
149 0.38
150 0.4
151 0.46
152 0.5
153 0.54
154 0.61
155 0.65
156 0.68
157 0.73
158 0.78
159 0.77
160 0.76
161 0.75
162 0.75
163 0.72
164 0.64
165 0.59
166 0.54
167 0.49
168 0.46
169 0.36
170 0.27
171 0.2
172 0.17
173 0.12
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.14
185 0.18
186 0.19
187 0.27
188 0.34
189 0.41
190 0.45
191 0.52
192 0.54
193 0.56
194 0.57
195 0.54
196 0.57
197 0.54
198 0.52
199 0.48
200 0.39
201 0.33
202 0.32
203 0.27
204 0.19
205 0.15
206 0.12
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.22
221 0.28
222 0.35
223 0.39
224 0.44
225 0.51
226 0.59
227 0.67
228 0.62
229 0.57
230 0.49
231 0.47
232 0.45
233 0.39
234 0.35
235 0.29
236 0.3
237 0.32
238 0.36
239 0.35
240 0.33
241 0.3
242 0.26
243 0.25
244 0.23
245 0.27
246 0.3
247 0.35
248 0.43
249 0.46
250 0.53
251 0.54
252 0.56
253 0.54
254 0.54
255 0.53
256 0.49
257 0.52
258 0.53
259 0.56
260 0.55
261 0.5
262 0.45
263 0.44
264 0.43
265 0.39
266 0.34
267 0.3
268 0.28
269 0.3
270 0.25
271 0.2
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.14
276 0.14
277 0.11
278 0.12
279 0.14
280 0.16
281 0.24
282 0.24
283 0.29
284 0.33
285 0.36
286 0.36
287 0.37
288 0.36
289 0.31
290 0.33
291 0.31
292 0.27
293 0.25
294 0.23
295 0.2
296 0.18
297 0.14
298 0.09
299 0.06
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.15
320 0.2
321 0.22
322 0.27
323 0.33
324 0.39
325 0.43
326 0.46
327 0.45
328 0.51
329 0.57
330 0.56
331 0.52
332 0.49
333 0.46
334 0.43
335 0.4
336 0.34
337 0.29
338 0.29
339 0.3
340 0.33
341 0.35
342 0.34
343 0.38
344 0.43
345 0.45
346 0.48
347 0.49
348 0.46
349 0.47
350 0.48
351 0.47
352 0.41
353 0.36
354 0.31
355 0.26
356 0.22
357 0.18
358 0.17
359 0.15
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.13
382 0.14
383 0.16
384 0.18
385 0.18
386 0.16
387 0.16
388 0.15
389 0.15
390 0.16
391 0.17
392 0.23
393 0.26
394 0.27
395 0.29
396 0.33
397 0.33
398 0.31
399 0.28
400 0.23
401 0.19
402 0.22
403 0.18
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.13
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.13
412 0.12
413 0.14
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.16
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.15
425 0.14
426 0.1
427 0.1
428 0.12
429 0.16
430 0.23
431 0.29
432 0.29
433 0.34
434 0.35
435 0.37
436 0.42
437 0.43
438 0.42
439 0.44
440 0.44
441 0.42
442 0.49
443 0.47
444 0.43
445 0.36
446 0.37
447 0.31
448 0.31
449 0.32
450 0.33
451 0.35
452 0.37
453 0.39
454 0.34
455 0.41
456 0.41
457 0.38
458 0.3
459 0.3
460 0.31
461 0.36
462 0.4
463 0.37
464 0.39
465 0.42
466 0.47
467 0.49
468 0.48
469 0.45
470 0.43
471 0.4
472 0.38
473 0.39
474 0.35
475 0.34
476 0.29
477 0.28
478 0.24
479 0.24
480 0.21
481 0.21
482 0.2
483 0.22
484 0.28
485 0.31
486 0.32
487 0.37
488 0.44
489 0.45
490 0.51
491 0.54
492 0.54
493 0.57
494 0.63
495 0.65
496 0.69
497 0.74
498 0.7
499 0.67
500 0.63
501 0.61
502 0.58
503 0.61
504 0.56
505 0.5
506 0.57
507 0.59
508 0.61
509 0.61
510 0.62
511 0.6
512 0.59
513 0.58
514 0.55
515 0.51
516 0.53
517 0.54
518 0.58
519 0.59
520 0.64
521 0.67
522 0.62
523 0.6
524 0.55
525 0.48
526 0.46
527 0.44
528 0.42
529 0.45
530 0.48
531 0.52
532 0.54
533 0.59
534 0.57
535 0.57
536 0.54
537 0.5
538 0.53
539 0.49
540 0.46
541 0.47
542 0.41
543 0.41
544 0.36
545 0.33
546 0.29
547 0.27
548 0.28
549 0.29
550 0.3
551 0.29
552 0.32
553 0.36
554 0.36
555 0.35
556 0.39
557 0.41
558 0.47
559 0.53
560 0.61
561 0.61
562 0.62
563 0.67
564 0.66
565 0.62
566 0.55
567 0.47
568 0.42
569 0.44
570 0.41
571 0.37
572 0.35
573 0.3
574 0.29
575 0.27
576 0.23
577 0.15
578 0.14
579 0.14
580 0.12
581 0.14
582 0.14
583 0.13
584 0.12
585 0.11
586 0.14
587 0.13
588 0.13
589 0.14