Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5EMD1

Protein Details
Accession A0A5J5EMD1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-198SGPRVLYPCQRKRPGGRKARELRLTRHydrophilic
716-736GHPGREIKWKWIPRIRCHDCPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-191KRPGGRKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MPDTSLAHQQQQQQQHSPSAPAPPSDHIPRKGTPQHHPASSSSSSTSPSNSHPPDVAGSPSTTHPSNANHHSHSNASSRPSTPKSKGKEKEAASPLKELPTTARLHYEQYTQRDLLHAAALVKQTESAHELIRDTRREVEFLDGLRHSRPRIAGMLFGNGYGGYGNGSTETVSGPRVLYPCQRKRPGGRKARELRLTRQQLAEQAERAEMLVPVRLDIDFDKIKLRDTFTWNLHDNTVPLDLFVEQLVEDFHLPLNPALQHNVAHNIREQLTDFHPHVFLSDEPLDPVLPYTAYKNDDMRVLIKLNITIGQHTLVDQFEWDINNPMNSPEEFAMLLTREMSLSGEFTTAIAHSIREQCQLFTKALYVTNHPFDGRPIEDEDVRGAMLQSPITSVFRPYILAKEFSPLLYELSENELDRAEKSQSREQRRIKRFRTVNRRGGPTIPDLKDMPKTHRTQIVSSILPGAVQKVTDLEKTMVVKQVRDGESDEEDSESEAEDLPPEKTIPGFNNMTRRQRMAALNAQKANSQQRSQTPEVRSDRAERYAERMRHDTPLQQTPLQQTQTMSPPKLALPRRPGVPLHQESALLRLKISSNKLRELLEQRDQKAQQQQQQMANMLPPQTQQTSQKTPTTASEPALAATAAPSPLPPTPTPAPGPRSNPLGPGEEAPPPPEWLTQALSRLRENYINDKFEATMRRQAFDAETGSLMPAAVMQQGHPGREIKWKWIPRIRCHDCPGKLYTPGPDQTVESFLVHVKNRGHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.57
4 0.53
5 0.48
6 0.47
7 0.43
8 0.38
9 0.38
10 0.35
11 0.4
12 0.46
13 0.51
14 0.49
15 0.52
16 0.51
17 0.57
18 0.62
19 0.63
20 0.62
21 0.64
22 0.65
23 0.63
24 0.64
25 0.57
26 0.55
27 0.51
28 0.45
29 0.37
30 0.32
31 0.31
32 0.29
33 0.3
34 0.25
35 0.27
36 0.35
37 0.35
38 0.36
39 0.35
40 0.35
41 0.35
42 0.34
43 0.32
44 0.24
45 0.22
46 0.21
47 0.22
48 0.25
49 0.22
50 0.22
51 0.23
52 0.26
53 0.33
54 0.39
55 0.43
56 0.43
57 0.45
58 0.46
59 0.45
60 0.44
61 0.42
62 0.38
63 0.37
64 0.37
65 0.37
66 0.42
67 0.45
68 0.5
69 0.52
70 0.57
71 0.61
72 0.67
73 0.72
74 0.72
75 0.75
76 0.7
77 0.72
78 0.72
79 0.71
80 0.63
81 0.6
82 0.53
83 0.48
84 0.45
85 0.36
86 0.31
87 0.29
88 0.3
89 0.27
90 0.31
91 0.28
92 0.32
93 0.33
94 0.37
95 0.38
96 0.4
97 0.44
98 0.39
99 0.38
100 0.36
101 0.35
102 0.28
103 0.22
104 0.18
105 0.14
106 0.16
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.18
118 0.22
119 0.28
120 0.29
121 0.29
122 0.34
123 0.33
124 0.33
125 0.33
126 0.32
127 0.28
128 0.27
129 0.29
130 0.23
131 0.24
132 0.26
133 0.28
134 0.24
135 0.25
136 0.26
137 0.24
138 0.27
139 0.27
140 0.28
141 0.26
142 0.3
143 0.26
144 0.24
145 0.21
146 0.16
147 0.15
148 0.1
149 0.08
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.23
166 0.33
167 0.42
168 0.51
169 0.57
170 0.62
171 0.71
172 0.78
173 0.8
174 0.8
175 0.78
176 0.79
177 0.81
178 0.83
179 0.82
180 0.77
181 0.73
182 0.73
183 0.73
184 0.65
185 0.59
186 0.51
187 0.47
188 0.48
189 0.43
190 0.34
191 0.28
192 0.25
193 0.22
194 0.21
195 0.16
196 0.11
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.18
209 0.18
210 0.22
211 0.23
212 0.26
213 0.26
214 0.32
215 0.37
216 0.35
217 0.41
218 0.4
219 0.39
220 0.36
221 0.31
222 0.26
223 0.21
224 0.2
225 0.14
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.21
250 0.19
251 0.19
252 0.19
253 0.21
254 0.2
255 0.2
256 0.2
257 0.16
258 0.17
259 0.21
260 0.2
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.08
279 0.11
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.16
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.12
293 0.14
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.09
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.08
340 0.11
341 0.12
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.2
346 0.22
347 0.2
348 0.16
349 0.16
350 0.14
351 0.17
352 0.18
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.19
357 0.18
358 0.17
359 0.14
360 0.16
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.1
369 0.1
370 0.08
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.13
392 0.14
393 0.1
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.12
408 0.17
409 0.24
410 0.31
411 0.39
412 0.48
413 0.55
414 0.63
415 0.71
416 0.77
417 0.74
418 0.76
419 0.76
420 0.76
421 0.78
422 0.78
423 0.77
424 0.73
425 0.74
426 0.65
427 0.6
428 0.53
429 0.47
430 0.45
431 0.36
432 0.33
433 0.29
434 0.29
435 0.34
436 0.33
437 0.33
438 0.33
439 0.35
440 0.36
441 0.42
442 0.42
443 0.36
444 0.41
445 0.39
446 0.32
447 0.29
448 0.27
449 0.21
450 0.19
451 0.17
452 0.12
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.1
461 0.13
462 0.14
463 0.16
464 0.2
465 0.19
466 0.19
467 0.2
468 0.28
469 0.26
470 0.26
471 0.26
472 0.22
473 0.24
474 0.25
475 0.23
476 0.15
477 0.14
478 0.13
479 0.11
480 0.09
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.11
492 0.12
493 0.16
494 0.19
495 0.21
496 0.31
497 0.37
498 0.43
499 0.43
500 0.43
501 0.39
502 0.42
503 0.42
504 0.38
505 0.41
506 0.41
507 0.45
508 0.45
509 0.44
510 0.4
511 0.41
512 0.43
513 0.39
514 0.33
515 0.32
516 0.35
517 0.43
518 0.46
519 0.5
520 0.44
521 0.49
522 0.51
523 0.5
524 0.46
525 0.44
526 0.44
527 0.41
528 0.42
529 0.33
530 0.35
531 0.41
532 0.42
533 0.41
534 0.42
535 0.39
536 0.41
537 0.42
538 0.41
539 0.38
540 0.42
541 0.41
542 0.37
543 0.38
544 0.39
545 0.43
546 0.39
547 0.35
548 0.28
549 0.28
550 0.35
551 0.37
552 0.32
553 0.27
554 0.27
555 0.28
556 0.35
557 0.38
558 0.37
559 0.4
560 0.43
561 0.45
562 0.47
563 0.46
564 0.44
565 0.49
566 0.44
567 0.39
568 0.35
569 0.34
570 0.31
571 0.36
572 0.33
573 0.23
574 0.2
575 0.19
576 0.21
577 0.25
578 0.32
579 0.34
580 0.34
581 0.38
582 0.41
583 0.41
584 0.45
585 0.46
586 0.46
587 0.47
588 0.5
589 0.48
590 0.53
591 0.53
592 0.52
593 0.55
594 0.55
595 0.53
596 0.55
597 0.59
598 0.56
599 0.58
600 0.54
601 0.45
602 0.4
603 0.35
604 0.28
605 0.22
606 0.18
607 0.19
608 0.2
609 0.22
610 0.27
611 0.33
612 0.39
613 0.43
614 0.46
615 0.44
616 0.44
617 0.44
618 0.42
619 0.37
620 0.31
621 0.3
622 0.26
623 0.25
624 0.23
625 0.19
626 0.13
627 0.11
628 0.11
629 0.08
630 0.07
631 0.07
632 0.09
633 0.11
634 0.16
635 0.16
636 0.21
637 0.24
638 0.29
639 0.34
640 0.38
641 0.42
642 0.44
643 0.5
644 0.47
645 0.51
646 0.47
647 0.46
648 0.43
649 0.4
650 0.35
651 0.32
652 0.31
653 0.29
654 0.29
655 0.27
656 0.26
657 0.24
658 0.24
659 0.23
660 0.22
661 0.19
662 0.22
663 0.23
664 0.28
665 0.3
666 0.32
667 0.33
668 0.34
669 0.34
670 0.36
671 0.37
672 0.41
673 0.44
674 0.44
675 0.42
676 0.41
677 0.39
678 0.39
679 0.4
680 0.35
681 0.36
682 0.35
683 0.35
684 0.34
685 0.35
686 0.33
687 0.3
688 0.28
689 0.21
690 0.19
691 0.18
692 0.18
693 0.16
694 0.13
695 0.09
696 0.08
697 0.07
698 0.09
699 0.08
700 0.08
701 0.17
702 0.2
703 0.21
704 0.23
705 0.24
706 0.24
707 0.34
708 0.36
709 0.36
710 0.44
711 0.51
712 0.58
713 0.66
714 0.72
715 0.72
716 0.81
717 0.81
718 0.79
719 0.8
720 0.79
721 0.75
722 0.71
723 0.68
724 0.62
725 0.59
726 0.53
727 0.51
728 0.49
729 0.47
730 0.44
731 0.39
732 0.36
733 0.33
734 0.34
735 0.29
736 0.22
737 0.21
738 0.21
739 0.25
740 0.25
741 0.29