Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5FB71

Protein Details
Accession A0A5J5FB71    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MTKRKKSKQQQQQQQQQQQNKRARFDHydrophilic
87-108LSSKAPPPPKARRPPPPPPADDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-101PPPKARRPP
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 10, nucl 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MTKRKKSKQQQQQQQQQQQNKRARFDDDGGGPKFDASRGYLDPATGQRGAFPGLERDQEEFFGPPMDGLDYLRMVRSEAKGVPDLLLSSKAPPPPKARRPPPPPPADDVVLDYDEPSREPTEEAKEEDEEEKDYIFSESTYISLHRSAPSAPIPPYHAPILARFRQLHKKLHSTPPKKSPHNPHPRWSDLKQWRKFVGTTMPRPQWVWGMQQWEVMRLLKQFRGWMEWRAKVRNAAGRGVPKAWPVWIWALLVRCECVMGAEEVAVVRELGKAALMLLAGMGSGELEDTAETDELGETEAGIKADAEHGEEDGEVPEKDHQEKEEEEEGEVPDPNNNKNTTPKPAAEEEGDFRSVEETLADTYRYVLRCIPTGMYLYHAILFTEVIGSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.92
3 0.91
4 0.89
5 0.88
6 0.86
7 0.82
8 0.78
9 0.71
10 0.68
11 0.64
12 0.58
13 0.56
14 0.53
15 0.54
16 0.49
17 0.47
18 0.41
19 0.35
20 0.32
21 0.25
22 0.21
23 0.15
24 0.18
25 0.19
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.25
30 0.26
31 0.28
32 0.25
33 0.23
34 0.19
35 0.21
36 0.22
37 0.2
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.24
42 0.24
43 0.25
44 0.24
45 0.24
46 0.24
47 0.19
48 0.17
49 0.15
50 0.13
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.16
63 0.17
64 0.19
65 0.2
66 0.23
67 0.24
68 0.24
69 0.23
70 0.2
71 0.19
72 0.16
73 0.16
74 0.13
75 0.14
76 0.18
77 0.21
78 0.24
79 0.29
80 0.37
81 0.45
82 0.55
83 0.63
84 0.68
85 0.74
86 0.8
87 0.85
88 0.86
89 0.83
90 0.77
91 0.72
92 0.67
93 0.58
94 0.5
95 0.41
96 0.33
97 0.26
98 0.22
99 0.17
100 0.14
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.12
107 0.15
108 0.2
109 0.22
110 0.23
111 0.23
112 0.22
113 0.24
114 0.24
115 0.22
116 0.17
117 0.15
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.16
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.22
141 0.22
142 0.24
143 0.22
144 0.21
145 0.18
146 0.22
147 0.27
148 0.25
149 0.28
150 0.27
151 0.32
152 0.4
153 0.45
154 0.48
155 0.46
156 0.52
157 0.53
158 0.62
159 0.67
160 0.64
161 0.65
162 0.68
163 0.71
164 0.68
165 0.7
166 0.71
167 0.71
168 0.76
169 0.74
170 0.72
171 0.69
172 0.69
173 0.67
174 0.59
175 0.59
176 0.57
177 0.63
178 0.6
179 0.58
180 0.54
181 0.5
182 0.48
183 0.4
184 0.39
185 0.36
186 0.36
187 0.39
188 0.39
189 0.38
190 0.38
191 0.37
192 0.31
193 0.26
194 0.23
195 0.19
196 0.21
197 0.21
198 0.24
199 0.23
200 0.21
201 0.2
202 0.17
203 0.15
204 0.14
205 0.17
206 0.15
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.21
211 0.22
212 0.27
213 0.3
214 0.34
215 0.37
216 0.38
217 0.39
218 0.37
219 0.39
220 0.37
221 0.34
222 0.31
223 0.3
224 0.31
225 0.31
226 0.29
227 0.26
228 0.22
229 0.2
230 0.18
231 0.15
232 0.13
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.03
275 0.03
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.04
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.08
300 0.1
301 0.08
302 0.09
303 0.13
304 0.16
305 0.19
306 0.2
307 0.21
308 0.23
309 0.25
310 0.3
311 0.32
312 0.3
313 0.28
314 0.28
315 0.28
316 0.25
317 0.25
318 0.19
319 0.17
320 0.18
321 0.21
322 0.24
323 0.25
324 0.27
325 0.34
326 0.4
327 0.44
328 0.48
329 0.47
330 0.47
331 0.49
332 0.5
333 0.44
334 0.42
335 0.37
336 0.35
337 0.33
338 0.28
339 0.24
340 0.22
341 0.19
342 0.15
343 0.12
344 0.09
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.13
350 0.18
351 0.19
352 0.19
353 0.21
354 0.22
355 0.25
356 0.27
357 0.27
358 0.24
359 0.25
360 0.24
361 0.23
362 0.23
363 0.22
364 0.21
365 0.2
366 0.17
367 0.15
368 0.15
369 0.11