FuNGI

A0A5J5F029

Protein Details

Accession

A0A5J5F029

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MGNRRRPWRGANHNEHRHASD	Basic
26-53	FPVPAPTDPRNPRRHRYRPRNNNATMAT	Hydrophilic
462-490	PQQPPDSPSRRPRERPSRRERRAAKLERE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
299-324	PESGRLKRSERRAREKAARLKGKEKE
385-394	EKSKGRERRR
470-486	SRRPRERPSRRERRAAK
581-591	GPRGGRGKHRG
631-660	GGRGGRGGRGGRVLPFAPRGRGGGGGSPRG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MGNRRRPWRGANHNEHRHASDATTDFPVPAPTDPRNPRRHRYRPRNNNATMATAVAPQPAAARTRTRGGRSKEQNAAVGGGGGGSMANGQQPAVRLKAVIRHLPSLLKESEFREEMGNYINDQTTDSFVWEQGKIPEDRNKASKPSRCYVKMKDPTHIAALNAALKAHGPFTDSKGNSSMPQMEFSPFQKVPKKTQRIDPRSGTIEVDPDFQAFLALLNPAAASTVAEGAEGAATPPPLDPNAPAPIPANDPLSIPLPTNEPIEKPKTTPLIEFIRSQKSVPADKSIAPKAKVLDRSTPESGRLKRSERRAREKAARLKGKEKESEALKIEPTALLKRSDTGGTPRLARQGSSNVASLSSSAVPKTPNSPASAPAKSEEAGKEVEKSKGRERRRGQVSGVAAILQRDLGLGGGRRTRGKAAATADSAPPTPTTPAPTAPTIPDQPTAGSTAASMAPTSKSAPQQPPDSPSRRPRERPSRRERRAAKLEREESAASNASTGSAAPTRVAIFKSQTSAGPGPVAMLMKRESTLTEPSSGDSTANNSHPTDAPPSVNTNVAAPSSLAVETTPTTPTGPRGGVGGPRGGRGKHRGGTMPVGNGPPHSPGASNGPPTGPAAGTPPHGPAFGAGGFGGRGGRGGRGGRVLPFAPRGRGGGGGSPRGGMGPHGPSAGAPAAQAVPANNNNGNAVA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.81
3	0.73
4	0.65
5	0.56
6	0.46
7	0.42
8	0.34
9	0.3
10	0.3
11	0.28
12	0.25
13	0.24
14	0.25
15	0.19
16	0.21
17	0.24
18	0.24
19	0.35
20	0.44
21	0.53
22	0.61
23	0.68
24	0.75
25	0.8
26	0.87
27	0.88
28	0.9
29	0.92
30	0.92
31	0.95
32	0.95
33	0.88
34	0.85
35	0.76
36	0.69
37	0.58
38	0.48
39	0.38
40	0.3
41	0.27
42	0.19
43	0.17
44	0.12
45	0.14
46	0.14
47	0.16
48	0.16
49	0.21
50	0.24
51	0.32
52	0.39
53	0.44
54	0.5
55	0.56
56	0.63
57	0.67
58	0.72
59	0.72
60	0.68
61	0.65
62	0.57
63	0.5
64	0.4
65	0.3
66	0.22
67	0.13
68	0.1
69	0.06
70	0.05
71	0.03
72	0.04
73	0.04
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.07
78	0.1
79	0.13
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.17
84	0.24
85	0.28
86	0.32
87	0.33
88	0.34
89	0.35
90	0.38
91	0.38
92	0.36
93	0.32
94	0.28
95	0.27
96	0.27
97	0.31
98	0.28
99	0.28
100	0.25
101	0.23
102	0.22
103	0.24
104	0.21
105	0.17
106	0.18
107	0.18
108	0.15
109	0.16
110	0.16
111	0.14
112	0.14
113	0.15
114	0.14
115	0.15
116	0.17
117	0.17
118	0.18
119	0.18
120	0.22
121	0.22
122	0.26
123	0.32
124	0.35
125	0.39
126	0.44
127	0.44
128	0.49
129	0.56
130	0.58
131	0.57
132	0.6
133	0.65
134	0.65
135	0.68
136	0.68
137	0.7
138	0.73
139	0.69
140	0.66
141	0.61
142	0.57
143	0.54
144	0.47
145	0.36
146	0.27
147	0.27
148	0.23
149	0.19
150	0.16
151	0.12
152	0.11
153	0.11
154	0.11
155	0.09
156	0.09
157	0.1
158	0.15
159	0.24
160	0.24
161	0.25
162	0.27
163	0.28
164	0.27
165	0.29
166	0.3
167	0.22
168	0.23
169	0.23
170	0.22
171	0.23
172	0.23
173	0.28
174	0.23
175	0.28
176	0.34
177	0.37
178	0.45
179	0.54
180	0.62
181	0.58
182	0.67
183	0.72
184	0.72
185	0.76
186	0.7
187	0.65
188	0.59
189	0.56
190	0.48
191	0.37
192	0.33
193	0.26
194	0.24
195	0.19
196	0.15
197	0.14
198	0.12
199	0.11
200	0.07
201	0.07
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.08
228	0.11
229	0.14
230	0.14
231	0.15
232	0.15
233	0.16
234	0.18
235	0.19
236	0.17
237	0.14
238	0.14
239	0.15
240	0.16
241	0.15
242	0.13
243	0.12
244	0.12
245	0.13
246	0.15
247	0.14
248	0.14
249	0.18
250	0.23
251	0.23
252	0.22
253	0.26
254	0.28
255	0.28
256	0.27
257	0.28
258	0.29
259	0.3
260	0.32
261	0.31
262	0.32
263	0.32
264	0.31
265	0.29
266	0.27
267	0.3
268	0.28
269	0.29
270	0.25
271	0.28
272	0.32
273	0.36
274	0.36
275	0.32
276	0.33
277	0.3
278	0.34
279	0.36
280	0.34
281	0.35
282	0.34
283	0.38
284	0.39
285	0.38
286	0.37
287	0.38
288	0.38
289	0.37
290	0.39
291	0.39
292	0.41
293	0.51
294	0.57
295	0.59
296	0.66
297	0.66
298	0.69
299	0.72
300	0.76
301	0.74
302	0.74
303	0.72
304	0.66
305	0.67
306	0.66
307	0.63
308	0.57
309	0.5
310	0.45
311	0.39
312	0.4
313	0.35
314	0.3
315	0.24
316	0.21
317	0.19
318	0.15
319	0.15
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.12
328	0.14
329	0.16
330	0.16
331	0.18
332	0.18
333	0.21
334	0.21
335	0.2
336	0.18
337	0.18
338	0.19
339	0.19
340	0.19
341	0.14
342	0.14
343	0.14
344	0.12
345	0.1
346	0.09
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.09
352	0.12
353	0.15
354	0.15
355	0.18
356	0.19
357	0.22
358	0.26
359	0.27
360	0.24
361	0.22
362	0.21
363	0.19
364	0.2
365	0.16
366	0.13
367	0.13
368	0.13
369	0.15
370	0.16
371	0.21
372	0.22
373	0.25
374	0.32
375	0.39
376	0.45
377	0.51
378	0.54
379	0.59
380	0.62
381	0.62
382	0.55
383	0.52
384	0.48
385	0.4
386	0.35
387	0.26
388	0.19
389	0.15
390	0.14
391	0.07
392	0.06
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.06
398	0.08
399	0.1
400	0.12
401	0.13
402	0.15
403	0.16
404	0.18
405	0.18
406	0.2
407	0.22
408	0.23
409	0.24
410	0.24
411	0.23
412	0.21
413	0.21
414	0.17
415	0.14
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.14
420	0.14
421	0.16
422	0.19
423	0.2
424	0.2
425	0.2
426	0.23
427	0.21
428	0.22
429	0.21
430	0.18
431	0.17
432	0.17
433	0.17
434	0.14
435	0.11
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.1
445	0.12
446	0.15
447	0.22
448	0.28
449	0.32
450	0.36
451	0.38
452	0.41
453	0.46
454	0.47
455	0.48
456	0.52
457	0.58
458	0.61
459	0.66
460	0.71
461	0.74
462	0.81
463	0.84
464	0.86
465	0.88
466	0.86
467	0.89
468	0.85
469	0.84
470	0.84
471	0.82
472	0.8
473	0.78
474	0.75
475	0.66
476	0.63
477	0.53
478	0.43
479	0.37
480	0.3
481	0.19
482	0.16
483	0.15
484	0.11
485	0.1
486	0.09
487	0.08
488	0.08
489	0.09
490	0.08
491	0.1
492	0.11
493	0.12
494	0.14
495	0.14
496	0.15
497	0.16
498	0.19
499	0.19
500	0.19
501	0.23
502	0.23
503	0.21
504	0.19
505	0.17
506	0.15
507	0.15
508	0.16
509	0.1
510	0.11
511	0.12
512	0.12
513	0.13
514	0.12
515	0.12
516	0.15
517	0.2
518	0.19
519	0.21
520	0.21
521	0.21
522	0.23
523	0.22
524	0.19
525	0.14
526	0.16
527	0.17
528	0.19
529	0.2
530	0.19
531	0.21
532	0.22
533	0.23
534	0.25
535	0.23
536	0.23
537	0.22
538	0.26
539	0.25
540	0.26
541	0.24
542	0.2
543	0.19
544	0.17
545	0.15
546	0.11
547	0.1
548	0.1
549	0.09
550	0.08
551	0.07
552	0.08
553	0.09
554	0.1
555	0.11
556	0.1
557	0.12
558	0.13
559	0.15
560	0.18
561	0.17
562	0.16
563	0.17
564	0.19
565	0.21
566	0.22
567	0.26
568	0.22
569	0.25
570	0.28
571	0.28
572	0.32
573	0.35
574	0.41
575	0.39
576	0.43
577	0.44
578	0.45
579	0.51
580	0.48
581	0.44
582	0.4
583	0.38
584	0.34
585	0.31
586	0.28
587	0.24
588	0.22
589	0.19
590	0.17
591	0.16
592	0.24
593	0.27
594	0.29
595	0.27
596	0.26
597	0.26
598	0.27
599	0.26
600	0.18
601	0.14
602	0.15
603	0.15
604	0.17
605	0.18
606	0.2
607	0.19
608	0.19
609	0.19
610	0.16
611	0.17
612	0.15
613	0.15
614	0.11
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.1
619	0.07
620	0.08
621	0.08
622	0.1
623	0.14
624	0.16
625	0.18
626	0.22
627	0.24
628	0.24
629	0.28
630	0.28
631	0.27
632	0.33
633	0.35
634	0.34
635	0.34
636	0.33
637	0.3
638	0.32
639	0.3
640	0.3
641	0.31
642	0.32
643	0.3
644	0.29
645	0.27
646	0.24
647	0.23
648	0.17
649	0.17
650	0.17
651	0.18
652	0.19
653	0.18
654	0.18
655	0.22
656	0.21
657	0.16
658	0.12
659	0.13
660	0.13
661	0.14
662	0.15
663	0.12
664	0.17
665	0.2
666	0.25
667	0.25
668	0.25

A0A5J5F029

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer