Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V5K2

Protein Details
Accession H1V5K2    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-166VPRGMRRRTASHNAKRVPKRLRRRALKEMAEDNTPIVVSKRRKPKTTRARIRAETAKRHydrophilic
196-241PEKSKITISTRPPRPKIRRNQLNDPPQRKSKFRKRQINKTWLPTHLHydrophilic
633-656ELEQRAKRKQEWERRPKSKRVAWEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-136RGMRRRTASHNAKRVPKRLRRRALKE
147-231SKRRKPKTTRARIRAETAKRLGILAEKKRRNQLKAAKANAKGGGEQQEVPEKSKITISTRPPRPKIRRNQLNDPPQRKSKFRKRQ
638-652AKRKQEWERRPKSKR
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG chig:CH63R_07387  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSAAGPNQKSLKSAFANKRKQGPSGDNGSRLGNGRDVGNGGGGGGGWAQKRVKIRNDREIATQASDAALKDGELDLQAFLNAREFEIRALEESMRHTKSEATSRAFQQVPRGMRRRTASHNAKRVPKRLRRRALKEMAEDNTPIVVSKRRKPKTTRARIRAETAKRLGILAEKKRRNQLKAAKANAKGGGEQQEVPEKSKITISTRPPRPKIRRNQLNDPPQRKSKFRKRQINKTWLPTHLWHAKRARMTEPNSPLWRFAIPLTPNEKTYRATHRSQGEKGVVVWDTSYVSTIGLYGEAKGVEQVLRRLGVTQDSCWNDKGAKWRAGTRHWTGFLSREVKGTRRDVCPATIVWNPKAATEQVESDGGVQTDKIQRQVYVRVHPSAFLEVFNELLRLVKMQNPRLYIEDLRFEIGSIELTGPASTETLLGILHPYHTKEGSKEQHAEIFGGLAGVTNPASLPMNATLGFSVMDPRLRYPPRKVNQPNPDDEAEQIKSIELLASWPADVDLKPSGLFHRDVRASVTRLPSQKSVDKRKGARTPGTLLDVSEADPPIPVILLASRSNGPQAQGNWTVLAPWRCIQPLWHSLVHFPLSSGGNPRFSGLNEMRQVAFERNLPCFPFDFLGTDAGAEWELEQRAKRKQEWERRPKSKRVAWESLDLGAGRKGEVGSGWACDIEILFRQKTTESQDVRSPDEMDMDAPSSPEQEATSGPAPNTGDFLKTLHQLRKDAFRAHTSSPASNPLPPRSVINVRIAVLNRGVATSCARIYRLPSRPAPVHPASSAEVPATVPPPPTSVRRLPADLRNQWLATLPDQAQSPKNSGRPKQQGQTRLPANADMRTRKQMLAKTLITAPAAEYPPPKPNQTDMNGHPLVPDEADLIGFVTTGAYSLSEGRATAVGCLSGEKAAEALRDGGKGREGTLCVVRNAGESIGWIARWEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.57
3 0.66
4 0.71
5 0.79
6 0.75
7 0.73
8 0.71
9 0.68
10 0.65
11 0.65
12 0.64
13 0.57
14 0.55
15 0.52
16 0.46
17 0.41
18 0.36
19 0.29
20 0.24
21 0.22
22 0.21
23 0.21
24 0.19
25 0.17
26 0.14
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.09
33 0.09
34 0.14
35 0.15
36 0.19
37 0.27
38 0.34
39 0.44
40 0.52
41 0.6
42 0.66
43 0.72
44 0.7
45 0.68
46 0.66
47 0.59
48 0.51
49 0.42
50 0.32
51 0.26
52 0.25
53 0.19
54 0.16
55 0.13
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.14
71 0.14
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.15
76 0.18
77 0.18
78 0.17
79 0.23
80 0.3
81 0.28
82 0.28
83 0.27
84 0.29
85 0.33
86 0.41
87 0.42
88 0.4
89 0.44
90 0.46
91 0.53
92 0.51
93 0.46
94 0.46
95 0.47
96 0.48
97 0.52
98 0.57
99 0.53
100 0.57
101 0.62
102 0.59
103 0.6
104 0.64
105 0.66
106 0.68
107 0.75
108 0.76
109 0.8
110 0.82
111 0.83
112 0.83
113 0.82
114 0.83
115 0.84
116 0.88
117 0.88
118 0.89
119 0.9
120 0.9
121 0.87
122 0.82
123 0.78
124 0.69
125 0.61
126 0.52
127 0.42
128 0.32
129 0.25
130 0.18
131 0.14
132 0.2
133 0.23
134 0.31
135 0.42
136 0.49
137 0.58
138 0.65
139 0.74
140 0.77
141 0.83
142 0.85
143 0.84
144 0.86
145 0.82
146 0.82
147 0.81
148 0.76
149 0.74
150 0.66
151 0.59
152 0.5
153 0.46
154 0.39
155 0.36
156 0.38
157 0.39
158 0.45
159 0.5
160 0.54
161 0.64
162 0.71
163 0.68
164 0.69
165 0.69
166 0.7
167 0.73
168 0.77
169 0.75
170 0.7
171 0.7
172 0.63
173 0.54
174 0.44
175 0.39
176 0.36
177 0.3
178 0.28
179 0.26
180 0.31
181 0.31
182 0.33
183 0.32
184 0.26
185 0.25
186 0.27
187 0.29
188 0.26
189 0.33
190 0.39
191 0.47
192 0.56
193 0.65
194 0.69
195 0.76
196 0.81
197 0.83
198 0.85
199 0.86
200 0.86
201 0.84
202 0.88
203 0.87
204 0.88
205 0.88
206 0.83
207 0.79
208 0.78
209 0.75
210 0.72
211 0.73
212 0.73
213 0.74
214 0.78
215 0.83
216 0.83
217 0.89
218 0.92
219 0.92
220 0.88
221 0.86
222 0.81
223 0.73
224 0.68
225 0.58
226 0.56
227 0.54
228 0.48
229 0.47
230 0.47
231 0.49
232 0.49
233 0.5
234 0.49
235 0.48
236 0.51
237 0.52
238 0.53
239 0.55
240 0.55
241 0.53
242 0.47
243 0.41
244 0.37
245 0.29
246 0.24
247 0.24
248 0.2
249 0.25
250 0.3
251 0.3
252 0.32
253 0.33
254 0.34
255 0.29
256 0.33
257 0.37
258 0.36
259 0.38
260 0.42
261 0.47
262 0.52
263 0.51
264 0.51
265 0.44
266 0.39
267 0.36
268 0.32
269 0.25
270 0.19
271 0.17
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.1
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.22
301 0.24
302 0.26
303 0.25
304 0.26
305 0.21
306 0.22
307 0.3
308 0.3
309 0.33
310 0.33
311 0.38
312 0.42
313 0.47
314 0.51
315 0.47
316 0.46
317 0.42
318 0.41
319 0.36
320 0.35
321 0.35
322 0.32
323 0.27
324 0.25
325 0.25
326 0.28
327 0.32
328 0.34
329 0.33
330 0.32
331 0.36
332 0.34
333 0.33
334 0.31
335 0.27
336 0.25
337 0.24
338 0.25
339 0.21
340 0.24
341 0.23
342 0.22
343 0.23
344 0.19
345 0.18
346 0.16
347 0.17
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.13
353 0.1
354 0.08
355 0.07
356 0.09
357 0.14
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.19
362 0.21
363 0.29
364 0.3
365 0.32
366 0.34
367 0.33
368 0.33
369 0.32
370 0.31
371 0.26
372 0.22
373 0.15
374 0.13
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.11
385 0.16
386 0.22
387 0.25
388 0.26
389 0.28
390 0.29
391 0.32
392 0.28
393 0.25
394 0.22
395 0.19
396 0.18
397 0.17
398 0.14
399 0.11
400 0.1
401 0.08
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.06
420 0.07
421 0.08
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.2
426 0.23
427 0.26
428 0.28
429 0.27
430 0.29
431 0.28
432 0.27
433 0.19
434 0.14
435 0.1
436 0.08
437 0.07
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.06
456 0.07
457 0.06
458 0.08
459 0.08
460 0.1
461 0.17
462 0.2
463 0.24
464 0.29
465 0.38
466 0.41
467 0.52
468 0.56
469 0.59
470 0.65
471 0.66
472 0.62
473 0.56
474 0.53
475 0.43
476 0.38
477 0.32
478 0.23
479 0.19
480 0.15
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.08
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.04
491 0.05
492 0.06
493 0.05
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.12
502 0.11
503 0.16
504 0.16
505 0.17
506 0.2
507 0.22
508 0.22
509 0.24
510 0.27
511 0.26
512 0.28
513 0.3
514 0.29
515 0.3
516 0.34
517 0.38
518 0.45
519 0.48
520 0.53
521 0.55
522 0.61
523 0.64
524 0.65
525 0.61
526 0.55
527 0.5
528 0.45
529 0.44
530 0.35
531 0.28
532 0.23
533 0.18
534 0.16
535 0.13
536 0.11
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.06
541 0.06
542 0.04
543 0.03
544 0.04
545 0.06
546 0.07
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.12
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.13
555 0.17
556 0.18
557 0.19
558 0.18
559 0.17
560 0.17
561 0.18
562 0.18
563 0.15
564 0.14
565 0.15
566 0.15
567 0.15
568 0.16
569 0.19
570 0.23
571 0.26
572 0.27
573 0.26
574 0.26
575 0.28
576 0.28
577 0.22
578 0.16
579 0.14
580 0.13
581 0.14
582 0.18
583 0.17
584 0.18
585 0.18
586 0.19
587 0.17
588 0.17
589 0.23
590 0.2
591 0.25
592 0.25
593 0.26
594 0.25
595 0.25
596 0.27
597 0.21
598 0.21
599 0.18
600 0.19
601 0.2
602 0.22
603 0.22
604 0.21
605 0.2
606 0.19
607 0.16
608 0.14
609 0.13
610 0.13
611 0.13
612 0.12
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.08
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.09
622 0.11
623 0.15
624 0.22
625 0.27
626 0.31
627 0.38
628 0.48
629 0.57
630 0.66
631 0.74
632 0.78
633 0.83
634 0.87
635 0.87
636 0.86
637 0.8
638 0.79
639 0.77
640 0.74
641 0.66
642 0.64
643 0.56
644 0.47
645 0.43
646 0.33
647 0.25
648 0.18
649 0.15
650 0.1
651 0.1
652 0.09
653 0.07
654 0.07
655 0.09
656 0.08
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.07
663 0.06
664 0.1
665 0.13
666 0.13
667 0.13
668 0.14
669 0.15
670 0.19
671 0.24
672 0.29
673 0.28
674 0.31
675 0.36
676 0.38
677 0.41
678 0.39
679 0.34
680 0.25
681 0.24
682 0.22
683 0.17
684 0.15
685 0.13
686 0.11
687 0.1
688 0.1
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.12
696 0.15
697 0.15
698 0.15
699 0.17
700 0.18
701 0.17
702 0.19
703 0.15
704 0.14
705 0.13
706 0.14
707 0.14
708 0.18
709 0.23
710 0.26
711 0.3
712 0.32
713 0.34
714 0.42
715 0.44
716 0.45
717 0.43
718 0.43
719 0.44
720 0.43
721 0.48
722 0.42
723 0.39
724 0.35
725 0.39
726 0.35
727 0.35
728 0.38
729 0.35
730 0.34
731 0.32
732 0.34
733 0.34
734 0.38
735 0.37
736 0.38
737 0.37
738 0.35
739 0.38
740 0.36
741 0.31
742 0.26
743 0.24
744 0.17
745 0.15
746 0.15
747 0.12
748 0.13
749 0.14
750 0.15
751 0.15
752 0.16
753 0.17
754 0.22
755 0.31
756 0.36
757 0.4
758 0.42
759 0.48
760 0.51
761 0.53
762 0.56
763 0.49
764 0.45
765 0.39
766 0.39
767 0.34
768 0.32
769 0.29
770 0.21
771 0.18
772 0.15
773 0.16
774 0.14
775 0.13
776 0.13
777 0.13
778 0.16
779 0.18
780 0.22
781 0.28
782 0.33
783 0.37
784 0.4
785 0.44
786 0.47
787 0.52
788 0.58
789 0.56
790 0.55
791 0.54
792 0.49
793 0.45
794 0.42
795 0.36
796 0.27
797 0.28
798 0.24
799 0.22
800 0.23
801 0.26
802 0.28
803 0.28
804 0.32
805 0.32
806 0.39
807 0.45
808 0.5
809 0.58
810 0.63
811 0.68
812 0.71
813 0.73
814 0.75
815 0.73
816 0.76
817 0.7
818 0.64
819 0.57
820 0.54
821 0.49
822 0.46
823 0.47
824 0.44
825 0.45
826 0.47
827 0.49
828 0.47
829 0.5
830 0.5
831 0.5
832 0.51
833 0.47
834 0.43
835 0.43
836 0.42
837 0.36
838 0.3
839 0.25
840 0.23
841 0.23
842 0.22
843 0.22
844 0.23
845 0.31
846 0.34
847 0.36
848 0.33
849 0.37
850 0.43
851 0.45
852 0.5
853 0.45
854 0.51
855 0.49
856 0.46
857 0.41
858 0.35
859 0.31
860 0.23
861 0.2
862 0.11
863 0.11
864 0.11
865 0.1
866 0.09
867 0.07
868 0.06
869 0.06
870 0.05
871 0.04
872 0.05
873 0.05
874 0.05
875 0.06
876 0.08
877 0.09
878 0.1
879 0.1
880 0.11
881 0.13
882 0.13
883 0.13
884 0.12
885 0.11
886 0.11
887 0.12
888 0.12
889 0.11
890 0.11
891 0.1
892 0.1
893 0.11
894 0.11
895 0.12
896 0.14
897 0.15
898 0.17
899 0.19
900 0.2
901 0.23
902 0.23
903 0.23
904 0.24
905 0.24
906 0.26
907 0.32
908 0.33
909 0.29
910 0.3
911 0.29
912 0.26
913 0.26
914 0.22
915 0.15
916 0.12
917 0.16
918 0.15
919 0.15
920 0.13