Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5J5F954

Protein Details
Accession A0A5J5F954    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-168KNPRAIDPFFRKRRIKKNGVEWKKAQKKLVKKEELEKNSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-161FRKRRIKKNGVEWKKAQKKLVKKE
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 7.5, cyto_nucl 5.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009083  TFIIA_a-hlx  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
IPR003194  TFIIA_gsu  
IPR015871  TFIIA_gsu_C  
IPR015872  TFIIA_gsu_N  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02751  TFIIA_gamma_C  
PF02268  TFIIA_gamma_N  
CDD cd10145  TFIIA_gamma_N  
Amino Acid Sequences MNTLSKPVKPLPLAISELYRGSSMGRTLIDAVDELVIAGKIPPALAAKVLQHFDEQMAKVLREQVGSHVNLKGTMKRFNNISDVWLWNVEDALISVDRQKPMRVDRLKIVAMASKVVGRPASPENDSEKNPRAIDPFFRKRRIKKNGVEWKKAQKKLVKKEELEKNSKLEAGMELEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.28
4 0.27
5 0.24
6 0.2
7 0.16
8 0.14
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.11
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.1
34 0.12
35 0.16
36 0.17
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.18
42 0.16
43 0.17
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.18
53 0.19
54 0.2
55 0.18
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.2
60 0.19
61 0.25
62 0.24
63 0.25
64 0.26
65 0.26
66 0.29
67 0.24
68 0.23
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.15
73 0.13
74 0.1
75 0.09
76 0.07
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.07
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.2
89 0.29
90 0.3
91 0.31
92 0.33
93 0.37
94 0.37
95 0.34
96 0.31
97 0.24
98 0.2
99 0.18
100 0.15
101 0.12
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.09
106 0.12
107 0.14
108 0.18
109 0.17
110 0.19
111 0.24
112 0.27
113 0.3
114 0.33
115 0.34
116 0.35
117 0.35
118 0.34
119 0.32
120 0.31
121 0.37
122 0.41
123 0.47
124 0.5
125 0.59
126 0.66
127 0.71
128 0.8
129 0.81
130 0.81
131 0.8
132 0.83
133 0.85
134 0.86
135 0.85
136 0.81
137 0.82
138 0.82
139 0.79
140 0.75
141 0.72
142 0.73
143 0.77
144 0.8
145 0.78
146 0.73
147 0.78
148 0.81
149 0.82
150 0.78
151 0.7
152 0.64
153 0.57
154 0.53
155 0.43
156 0.34
157 0.27