FuNGI

A0A5J5F7T3

Protein Details

Accession

A0A5J5F7T3

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	MPPKAPKAKPKPIARRGAAKPSL	Hydrophilic
88-108	GPKMKFKPKVVVRKSKEERET	Basic
343-367	KRKGSISRRRRSSSRKKKPVITTTE	Basic
594-619	IKPSSGSKRSTVKREKKEQPQKILID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-20	KAPKAKPKPIARRGAAK
86-101	AGGPKMKFKPKVVVRK
132-154	RGRGSTRGARGGRGRGRGRGGER
340-361	QEAKRKGSISRRRRSSSRKKKP

Subcellular Location(s)

mito 17, mito_nucl 12.666, cyto_mito 10.666, nucl 7, cyto_nucl 5.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAPKAKPKPIARRGAAKPSLDEALAALTSAPAQPSEGASTVPAVVQPEEGEYDLPPPLPLPVETKPIAPPKGRLDSLASTRGAGGPKMKFKPKVVVRKSKEERETLDAKFQEQQQAAAAAAAADAEAGRGRGSTRGARGGRGRGRGRGGERGGSDPLPGASGPFALGSVVTANRQKVFAERHAGGFGAGRRSGRMFNFKTKVKAEGAGTDAGAGAGAADGDIKEDYSSSDESDGQRMDVEYIYVLDTPSDDENERDLDREWGAGAPIRIPRIEHVDRQAMVNTESSTASAKKNKAVKDKEMTFETEIKIKEEPEDEPMLPPSSPELQKRRVKITESQEAKRKGSISRRRRSSSRKKKPVITTTEEKEEYERLEADRLDALKQLGGAFEALDVKGKGKEKQEDADGDIQMEEDVTETRRNAETENQVFFFQFPPLLPHLVPATAPPAAKPEPTDADGNGEIKPQEAEEVKPEPSTTAKKPTTAAKARQQLKAQLALLSGPPPSGKVGKLRVHRSGRITMLYGNPDENGDGVIEMEVSRGAPCWFLEDVVVMKEDSPYGDEDKDEKGRGMGIAYSLGSIKGKYVVSPDFSGLIKPSSGSKRSTVKREKKEQPQKILID

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.85
3	0.81
4	0.82
5	0.78
6	0.69
7	0.62
8	0.55
9	0.51
10	0.41
11	0.34
12	0.23
13	0.19
14	0.16
15	0.13
16	0.09
17	0.07
18	0.08
19	0.09
20	0.09
21	0.07
22	0.08
23	0.09
24	0.11
25	0.14
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.14
30	0.13
31	0.13
32	0.12
33	0.11
34	0.11
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.13
39	0.13
40	0.13
41	0.11
42	0.13
43	0.13
44	0.13
45	0.11
46	0.1
47	0.11
48	0.12
49	0.13
50	0.17
51	0.19
52	0.25
53	0.25
54	0.27
55	0.32
56	0.39
57	0.43
58	0.4
59	0.43
60	0.45
61	0.52
62	0.51
63	0.46
64	0.44
65	0.45
66	0.47
67	0.46
68	0.38
69	0.31
70	0.31
71	0.32
72	0.28
73	0.23
74	0.25
75	0.25
76	0.34
77	0.4
78	0.47
79	0.5
80	0.52
81	0.6
82	0.63
83	0.69
84	0.7
85	0.74
86	0.73
87	0.78
88	0.83
89	0.82
90	0.78
91	0.72
92	0.67
93	0.63
94	0.62
95	0.53
96	0.53
97	0.44
98	0.4
99	0.39
100	0.37
101	0.38
102	0.32
103	0.31
104	0.24
105	0.25
106	0.23
107	0.18
108	0.15
109	0.08
110	0.07
111	0.06
112	0.04
113	0.03
114	0.03
115	0.03
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.05
120	0.06
121	0.08
122	0.12
123	0.17
124	0.2
125	0.28
126	0.29
127	0.34
128	0.39
129	0.45
130	0.48
131	0.52
132	0.52
133	0.48
134	0.52
135	0.53
136	0.52
137	0.51
138	0.47
139	0.42
140	0.41
141	0.39
142	0.37
143	0.31
144	0.27
145	0.19
146	0.17
147	0.14
148	0.12
149	0.09
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.04
158	0.06
159	0.06
160	0.09
161	0.12
162	0.13
163	0.14
164	0.15
165	0.15
166	0.19
167	0.24
168	0.26
169	0.3
170	0.29
171	0.3
172	0.29
173	0.29
174	0.24
175	0.21
176	0.19
177	0.16
178	0.16
179	0.15
180	0.16
181	0.18
182	0.21
183	0.22
184	0.29
185	0.29
186	0.37
187	0.44
188	0.45
189	0.49
190	0.47
191	0.48
192	0.4
193	0.39
194	0.31
195	0.28
196	0.27
197	0.22
198	0.2
199	0.16
200	0.14
201	0.1
202	0.09
203	0.06
204	0.03
205	0.02
206	0.02
207	0.02
208	0.02
209	0.02
210	0.03
211	0.03
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.12
221	0.13
222	0.15
223	0.15
224	0.12
225	0.12
226	0.12
227	0.11
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.09
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.1
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.08
255	0.09
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.12
261	0.19
262	0.22
263	0.21
264	0.24
265	0.26
266	0.26
267	0.27
268	0.27
269	0.19
270	0.18
271	0.16
272	0.13
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.13
279	0.18
280	0.19
281	0.23
282	0.29
283	0.33
284	0.42
285	0.45
286	0.48
287	0.5
288	0.52
289	0.49
290	0.46
291	0.43
292	0.35
293	0.33
294	0.27
295	0.23
296	0.2
297	0.19
298	0.18
299	0.16
300	0.15
301	0.14
302	0.14
303	0.13
304	0.16
305	0.14
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.13
310	0.12
311	0.11
312	0.13
313	0.16
314	0.21
315	0.26
316	0.34
317	0.39
318	0.42
319	0.47
320	0.46
321	0.46
322	0.48
323	0.49
324	0.49
325	0.5
326	0.51
327	0.52
328	0.52
329	0.49
330	0.44
331	0.39
332	0.35
333	0.41
334	0.47
335	0.5
336	0.56
337	0.63
338	0.66
339	0.72
340	0.77
341	0.78
342	0.79
343	0.8
344	0.82
345	0.8
346	0.83
347	0.84
348	0.83
349	0.78
350	0.74
351	0.69
352	0.61
353	0.61
354	0.53
355	0.44
356	0.37
357	0.31
358	0.25
359	0.19
360	0.17
361	0.12
362	0.13
363	0.13
364	0.12
365	0.14
366	0.13
367	0.12
368	0.13
369	0.12
370	0.1
371	0.11
372	0.1
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.05
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.12
384	0.14
385	0.18
386	0.23
387	0.29
388	0.31
389	0.33
390	0.36
391	0.34
392	0.35
393	0.35
394	0.29
395	0.24
396	0.21
397	0.18
398	0.14
399	0.12
400	0.08
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.08
405	0.08
406	0.11
407	0.13
408	0.13
409	0.15
410	0.2
411	0.27
412	0.29
413	0.32
414	0.31
415	0.29
416	0.29
417	0.28
418	0.23
419	0.15
420	0.12
421	0.09
422	0.12
423	0.14
424	0.16
425	0.15
426	0.15
427	0.15
428	0.15
429	0.15
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.12
435	0.16
436	0.17
437	0.18
438	0.19
439	0.2
440	0.21
441	0.24
442	0.25
443	0.2
444	0.23
445	0.24
446	0.23
447	0.19
448	0.17
449	0.15
450	0.14
451	0.14
452	0.1
453	0.12
454	0.12
455	0.13
456	0.16
457	0.19
458	0.19
459	0.19
460	0.19
461	0.17
462	0.21
463	0.26
464	0.26
465	0.33
466	0.34
467	0.36
468	0.38
469	0.44
470	0.49
471	0.52
472	0.55
473	0.54
474	0.62
475	0.65
476	0.69
477	0.66
478	0.63
479	0.58
480	0.56
481	0.48
482	0.4
483	0.34
484	0.29
485	0.26
486	0.2
487	0.16
488	0.11
489	0.1
490	0.1
491	0.12
492	0.14
493	0.15
494	0.21
495	0.29
496	0.36
497	0.45
498	0.51
499	0.57
500	0.62
501	0.65
502	0.64
503	0.61
504	0.57
505	0.51
506	0.46
507	0.39
508	0.37
509	0.35
510	0.31
511	0.25
512	0.22
513	0.2
514	0.19
515	0.16
516	0.12
517	0.08
518	0.07
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.12
532	0.12
533	0.12
534	0.13
535	0.13
536	0.14
537	0.14
538	0.15
539	0.11
540	0.1
541	0.11
542	0.11
543	0.1
544	0.1
545	0.12
546	0.14
547	0.15
548	0.17
549	0.18
550	0.24
551	0.28
552	0.28
553	0.26
554	0.23
555	0.24
556	0.23
557	0.22
558	0.17
559	0.13
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.11
567	0.11
568	0.14
569	0.14
570	0.14
571	0.2
572	0.22
573	0.26
574	0.28
575	0.28
576	0.26
577	0.26
578	0.27
579	0.23
580	0.21
581	0.17
582	0.16
583	0.22
584	0.28
585	0.31
586	0.33
587	0.38
588	0.46
589	0.54
590	0.65
591	0.68
592	0.71
593	0.77
594	0.85
595	0.88
596	0.89
597	0.93
598	0.92
599	0.91

A0A5J5F7T3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer