Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VZN2

Protein Details
Accession H1VZN2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MFPTKRRKLTNGNGKRQSSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008806  RNA_pol_III_Rpc82_C  
IPR039748  RPC3  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF05645  RNA_pol_Rpc82  
Amino Acid Sequences MFPTKRRKLTNGNGKRQSSDWDDDVPELESHIVLRVNTEKCLVELRNQRLAQYAADAFGEVTGQVYHTALRLLTQQIPRCQLDPRIDSDINDGDGPGSNVRQVTVTSMEILENLDESVDVSHGVGKASADQIDLRSAEKIRATPAQPMYDSDDSFDDSPPLQRASARPQENGAGGRGSGDSEDDEPRTASGSREARVKFEDGPAPGASRMDHVRQHLLLLAESRQGFLRHCGGQGRGQWTVDFKPLIDGFKQTEVDAVIEQSFGRHGLRLTRILREKGKLDEKMLPSLALMKKGEVQGKMLAMQMAGFVDVQEVPRDASRTATRTMFFWFFDIERTEAQLVDDFYKTMLRCLQNLEVHRYRERNILSFVERNDVKGKEEEVMTAEHYNKYSRYLELQSKLLGHVMRLDDLVAVFRDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.76
3 0.67
4 0.62
5 0.58
6 0.53
7 0.45
8 0.4
9 0.39
10 0.36
11 0.36
12 0.32
13 0.24
14 0.19
15 0.17
16 0.12
17 0.11
18 0.13
19 0.13
20 0.11
21 0.15
22 0.21
23 0.22
24 0.23
25 0.26
26 0.23
27 0.23
28 0.29
29 0.27
30 0.29
31 0.37
32 0.42
33 0.49
34 0.49
35 0.48
36 0.46
37 0.46
38 0.38
39 0.33
40 0.27
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.11
59 0.14
60 0.21
61 0.27
62 0.32
63 0.37
64 0.42
65 0.43
66 0.41
67 0.42
68 0.41
69 0.43
70 0.4
71 0.4
72 0.42
73 0.41
74 0.4
75 0.4
76 0.35
77 0.29
78 0.26
79 0.21
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.09
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.04
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.21
129 0.22
130 0.26
131 0.29
132 0.29
133 0.28
134 0.29
135 0.32
136 0.29
137 0.28
138 0.22
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.17
143 0.12
144 0.1
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.11
149 0.12
150 0.15
151 0.22
152 0.3
153 0.31
154 0.3
155 0.3
156 0.31
157 0.31
158 0.3
159 0.22
160 0.14
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.14
178 0.16
179 0.17
180 0.23
181 0.24
182 0.24
183 0.25
184 0.27
185 0.21
186 0.21
187 0.23
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.15
193 0.14
194 0.11
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.15
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.15
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.16
216 0.14
217 0.15
218 0.17
219 0.17
220 0.21
221 0.24
222 0.25
223 0.23
224 0.22
225 0.21
226 0.22
227 0.22
228 0.2
229 0.16
230 0.13
231 0.15
232 0.16
233 0.17
234 0.15
235 0.16
236 0.15
237 0.18
238 0.19
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.12
255 0.15
256 0.22
257 0.24
258 0.3
259 0.35
260 0.39
261 0.43
262 0.41
263 0.41
264 0.41
265 0.47
266 0.41
267 0.4
268 0.42
269 0.4
270 0.4
271 0.38
272 0.31
273 0.24
274 0.29
275 0.27
276 0.24
277 0.22
278 0.19
279 0.22
280 0.26
281 0.3
282 0.23
283 0.24
284 0.22
285 0.22
286 0.23
287 0.2
288 0.16
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.12
304 0.11
305 0.16
306 0.2
307 0.22
308 0.25
309 0.27
310 0.26
311 0.25
312 0.3
313 0.27
314 0.23
315 0.21
316 0.2
317 0.17
318 0.2
319 0.21
320 0.18
321 0.16
322 0.19
323 0.18
324 0.16
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.13
331 0.13
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.22
336 0.22
337 0.23
338 0.28
339 0.35
340 0.36
341 0.4
342 0.47
343 0.46
344 0.48
345 0.53
346 0.51
347 0.47
348 0.49
349 0.48
350 0.43
351 0.42
352 0.42
353 0.41
354 0.43
355 0.41
356 0.42
357 0.38
358 0.37
359 0.39
360 0.35
361 0.33
362 0.31
363 0.31
364 0.26
365 0.27
366 0.25
367 0.21
368 0.21
369 0.21
370 0.22
371 0.22
372 0.21
373 0.22
374 0.24
375 0.23
376 0.27
377 0.27
378 0.26
379 0.29
380 0.34
381 0.41
382 0.43
383 0.44
384 0.42
385 0.41
386 0.39
387 0.37
388 0.31
389 0.23
390 0.24
391 0.24
392 0.22
393 0.21
394 0.2
395 0.17
396 0.16
397 0.18