FuNGI

A0A5N6JP73

Protein Details

Accession

A0A5N6JP73

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-46	QIYFSSLSLRPQKRKRRDSDSDQNDDY	Hydrophilic
140-170	FEEESAKTRRERERRKREERKTGRSNLKIQH	Basic
367-396	FLAHQRRQTRLLKRRREKRWEAKDEVRRTA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
146-163	KTRRERERRKREERKTGR
376-386	RLLKRRREKRW
472-487	VRRGAERREDERRRAR

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 9.5, cyto_mito 6.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MPLFTLPIADLSQTSTTNPQIYFSSLSLRPQKRKRRDSDSDQNDDYNNDYTANTNINSGKGKEIENTGPSQPSAEITNPLSLTPAEVMQYRLAGLGLDKELPSKIGVKHWPHRGLPSTSCIESRDRDSSAKFSNTEEEDFEEESAKTRRERERRKREERKTGRSNLKIQHLSVLVAIMMRNLEEGDMERAGRAWGLLLRMQVAGKGVELRRTGFWGIGAELLMRGVANKQRKEWWEEGAEEGSSDEGNVDVGGGPKEGDGGKKEDKEGEEKRYGTAEGLLKAKDYYERLILQYPYKRQFHGSVTALDFWPAMLGCEIYGIQFEHKDQLRKIAKQAEKDEDGRDISDSDISDEDEDLENGDYEEDKVFLAHQRRQTRLLKRRREKRWEAKDEVRRTALVATELVAQRMDELMTTPPYSDSKVLLRLRGMTALYIGDLCVPEKWEGDEEWLGKIRGGAMEADKRFLGRQRDAEVRRGAERREDERRRARGLFGKIGVEWDDGDEALDLDLTLEGYEGDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.2
3	0.23
4	0.26
5	0.26
6	0.25
7	0.24
8	0.26
9	0.27
10	0.24
11	0.27
12	0.25
13	0.32
14	0.41
15	0.48
16	0.55
17	0.62
18	0.72
19	0.77
20	0.85
21	0.87
22	0.88
23	0.89
24	0.89
25	0.89
26	0.88
27	0.85
28	0.77
29	0.69
30	0.6
31	0.51
32	0.44
33	0.35
34	0.26
35	0.19
36	0.17
37	0.16
38	0.17
39	0.19
40	0.16
41	0.18
42	0.19
43	0.21
44	0.24
45	0.24
46	0.26
47	0.25
48	0.27
49	0.26
50	0.3
51	0.31
52	0.31
53	0.33
54	0.31
55	0.3
56	0.29
57	0.27
58	0.22
59	0.19
60	0.19
61	0.17
62	0.18
63	0.18
64	0.22
65	0.21
66	0.2
67	0.2
68	0.17
69	0.17
70	0.14
71	0.13
72	0.1
73	0.11
74	0.13
75	0.13
76	0.13
77	0.12
78	0.11
79	0.1
80	0.09
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.15
91	0.16
92	0.22
93	0.3
94	0.37
95	0.45
96	0.54
97	0.59
98	0.56
99	0.6
100	0.59
101	0.56
102	0.51
103	0.48
104	0.43
105	0.38
106	0.37
107	0.33
108	0.3
109	0.28
110	0.3
111	0.29
112	0.28
113	0.29
114	0.3
115	0.33
116	0.35
117	0.36
118	0.32
119	0.29
120	0.32
121	0.31
122	0.31
123	0.27
124	0.24
125	0.23
126	0.23
127	0.21
128	0.17
129	0.15
130	0.17
131	0.18
132	0.18
133	0.18
134	0.25
135	0.34
136	0.44
137	0.55
138	0.63
139	0.72
140	0.81
141	0.89
142	0.93
143	0.93
144	0.94
145	0.93
146	0.92
147	0.9
148	0.89
149	0.87
150	0.83
151	0.8
152	0.75
153	0.73
154	0.65
155	0.56
156	0.5
157	0.41
158	0.35
159	0.28
160	0.22
161	0.13
162	0.1
163	0.1
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.05
172	0.07
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.06
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.1
187	0.11
188	0.1
189	0.1
190	0.08
191	0.07
192	0.11
193	0.11
194	0.15
195	0.16
196	0.17
197	0.16
198	0.19
199	0.19
200	0.14
201	0.14
202	0.11
203	0.1
204	0.09
205	0.09
206	0.06
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.11
214	0.18
215	0.19
216	0.21
217	0.27
218	0.3
219	0.36
220	0.35
221	0.34
222	0.3
223	0.29
224	0.29
225	0.24
226	0.22
227	0.15
228	0.13
229	0.09
230	0.06
231	0.05
232	0.04
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.12
248	0.16
249	0.17
250	0.18
251	0.19
252	0.2
253	0.26
254	0.29
255	0.3
256	0.31
257	0.3
258	0.3
259	0.29
260	0.28
261	0.21
262	0.21
263	0.17
264	0.15
265	0.16
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.12
272	0.11
273	0.13
274	0.14
275	0.15
276	0.19
277	0.2
278	0.22
279	0.26
280	0.31
281	0.34
282	0.35
283	0.34
284	0.34
285	0.36
286	0.34
287	0.36
288	0.31
289	0.28
290	0.28
291	0.28
292	0.25
293	0.22
294	0.18
295	0.11
296	0.1
297	0.07
298	0.06
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.13
311	0.16
312	0.2
313	0.2
314	0.29
315	0.35
316	0.36
317	0.41
318	0.45
319	0.45
320	0.48
321	0.53
322	0.49
323	0.47
324	0.47
325	0.43
326	0.36
327	0.33
328	0.27
329	0.22
330	0.16
331	0.13
332	0.13
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.12
355	0.18
356	0.23
357	0.31
358	0.37
359	0.4
360	0.48
361	0.55
362	0.61
363	0.65
364	0.7
365	0.73
366	0.77
367	0.84
368	0.87
369	0.89
370	0.89
371	0.9
372	0.91
373	0.89
374	0.87
375	0.86
376	0.86
377	0.82
378	0.76
379	0.67
380	0.56
381	0.47
382	0.41
383	0.32
384	0.24
385	0.17
386	0.13
387	0.17
388	0.17
389	0.17
390	0.15
391	0.13
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.06
396	0.07
397	0.09
398	0.11
399	0.12
400	0.12
401	0.13
402	0.15
403	0.17
404	0.17
405	0.17
406	0.18
407	0.27
408	0.29
409	0.3
410	0.3
411	0.31
412	0.31
413	0.31
414	0.28
415	0.19
416	0.18
417	0.15
418	0.14
419	0.11
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.09
425	0.11
426	0.11
427	0.12
428	0.14
429	0.15
430	0.15
431	0.19
432	0.23
433	0.21
434	0.23
435	0.26
436	0.24
437	0.22
438	0.22
439	0.19
440	0.16
441	0.16
442	0.15
443	0.17
444	0.25
445	0.25
446	0.27
447	0.26
448	0.26
449	0.28
450	0.32
451	0.35
452	0.33
453	0.38
454	0.42
455	0.52
456	0.54
457	0.59
458	0.59
459	0.54
460	0.55
461	0.54
462	0.5
463	0.49
464	0.53
465	0.53
466	0.58
467	0.63
468	0.65
469	0.71
470	0.75
471	0.73
472	0.69
473	0.68
474	0.66
475	0.65
476	0.63
477	0.56
478	0.51
479	0.45
480	0.45
481	0.4
482	0.32
483	0.25
484	0.19
485	0.16
486	0.14
487	0.14
488	0.11
489	0.09
490	0.08
491	0.08
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.05

A0A5N6JP73

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer