FuNGI

A0A5N6JVA5

Protein Details

Accession

A0A5N6JVA5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
535-571	AIKAAQKEEKRASKKQRKEEERQRKKEEKQNESDKAA	Basic
585-608	EQEERKKKKISTTGGKAKKDKPFD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
537-562	KAAQKEEKRASKKQRKEEERQRKKEE
589-606	RKKKKISTTGGKAKKDKP

Subcellular Location(s)

mito 15, cyto_mito 12.333, mito_nucl 10.499, cyto 6.5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF00570 HRDC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC

Amino Acid Sequences

MRIHRLGYLFSNLGYSLLKTKPHAKVSLEDSLGMITNEFDQKQYKHPYETEILQLQYPKAMYEKSEPIKYLPFESTSATFVDTYEGVLEMLEELKSATEIAVDLEHHDTRSYVGLVSLMQISTREKDWIVDTLKPWRQQLQVLNEVFADPSIIKVFHGAFMDIIWLQTGGLGLGLAGGSLAFLLKKYIDFDADKKYQLADWRIRPLPEEMFFYARSDTHFLLYIFDNLRNELINAPHTEIGETALEAVLQKSKETSLFRYERQVYNAESGKGPGGWFGLIYKTPALLNSEQFAVFKAVHAWRDQIARKDDDSVNFVMLNAVVVNLAKFMPMDMIALLGIIRPISHNVKSRTGELLEIIKSAKANGKDGPKSIDILRKSPDVVGTPKSNTGAKSTSQKISEFDVTPVDKTELTTETSSFWGGAFGSSLWEPSIATPDQDSMRLAIPLPQLSEEVFASSSTLLTDRSRLAIPEAQTPTATPTPNKVKDEAFVLKRGSKRKSDVMTNTAEDQEVAGKYDITLDWDPDADIERRQGSAAIKAAQKEEKRASKKQRKEEERQRKKEEKQNESDKAAEEVEEAESESESEEQEERKKKKISTTGGKAKKDKPFDPYQKSMDAAKGMRRVQTGERGGRSATFKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.16
3	0.16
4	0.19
5	0.22
6	0.25
7	0.34
8	0.41
9	0.47
10	0.52
11	0.49
12	0.52
13	0.55
14	0.59
15	0.51
16	0.43
17	0.37
18	0.32
19	0.29
20	0.23
21	0.17
22	0.09
23	0.11
24	0.15
25	0.15
26	0.16
27	0.2
28	0.23
29	0.31
30	0.41
31	0.42
32	0.44
33	0.46
34	0.5
35	0.5
36	0.5
37	0.48
38	0.43
39	0.39
40	0.36
41	0.37
42	0.31
43	0.29
44	0.26
45	0.2
46	0.18
47	0.19
48	0.2
49	0.23
50	0.33
51	0.36
52	0.4
53	0.4
54	0.41
55	0.46
56	0.44
57	0.41
58	0.35
59	0.31
60	0.28
61	0.3
62	0.29
63	0.24
64	0.22
65	0.2
66	0.17
67	0.15
68	0.16
69	0.12
70	0.11
71	0.1
72	0.1
73	0.08
74	0.08
75	0.07
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.05
80	0.05
81	0.05
82	0.06
83	0.06
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.06
88	0.07
89	0.07
90	0.09
91	0.13
92	0.14
93	0.14
94	0.14
95	0.14
96	0.14
97	0.16
98	0.14
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.1
103	0.11
104	0.11
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.11
109	0.12
110	0.14
111	0.14
112	0.13
113	0.15
114	0.17
115	0.22
116	0.23
117	0.25
118	0.26
119	0.34
120	0.39
121	0.41
122	0.42
123	0.41
124	0.4
125	0.42
126	0.48
127	0.46
128	0.48
129	0.45
130	0.44
131	0.38
132	0.36
133	0.3
134	0.22
135	0.15
136	0.06
137	0.07
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.1
142	0.11
143	0.12
144	0.13
145	0.12
146	0.1
147	0.1
148	0.12
149	0.1
150	0.09
151	0.07
152	0.06
153	0.05
154	0.06
155	0.06
156	0.04
157	0.04
158	0.03
159	0.03
160	0.03
161	0.03
162	0.02
163	0.02
164	0.02
165	0.02
166	0.02
167	0.02
168	0.02
169	0.03
170	0.04
171	0.05
172	0.05
173	0.08
174	0.09
175	0.12
176	0.14
177	0.17
178	0.24
179	0.26
180	0.27
181	0.25
182	0.25
183	0.24
184	0.27
185	0.31
186	0.31
187	0.33
188	0.39
189	0.41
190	0.41
191	0.41
192	0.38
193	0.35
194	0.3
195	0.29
196	0.24
197	0.24
198	0.24
199	0.23
200	0.21
201	0.17
202	0.18
203	0.17
204	0.16
205	0.14
206	0.16
207	0.15
208	0.16
209	0.16
210	0.18
211	0.16
212	0.17
213	0.16
214	0.15
215	0.15
216	0.13
217	0.13
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.13
226	0.12
227	0.12
228	0.1
229	0.08
230	0.07
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.13
241	0.15
242	0.18
243	0.24
244	0.27
245	0.28
246	0.35
247	0.39
248	0.37
249	0.37
250	0.36
251	0.29
252	0.31
253	0.32
254	0.25
255	0.21
256	0.2
257	0.17
258	0.15
259	0.14
260	0.09
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.11
273	0.11
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.1
281	0.09
282	0.08
283	0.11
284	0.12
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.14
289	0.2
290	0.22
291	0.24
292	0.26
293	0.27
294	0.26
295	0.3
296	0.3
297	0.25
298	0.26
299	0.2
300	0.17
301	0.15
302	0.15
303	0.1
304	0.08
305	0.07
306	0.04
307	0.04
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.04
321	0.03
322	0.04
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.06
330	0.09
331	0.13
332	0.2
333	0.23
334	0.29
335	0.31
336	0.32
337	0.32
338	0.29
339	0.26
340	0.21
341	0.2
342	0.14
343	0.13
344	0.12
345	0.1
346	0.1
347	0.1
348	0.13
349	0.11
350	0.13
351	0.17
352	0.24
353	0.25
354	0.26
355	0.29
356	0.26
357	0.26
358	0.27
359	0.29
360	0.24
361	0.25
362	0.26
363	0.24
364	0.24
365	0.22
366	0.21
367	0.18
368	0.19
369	0.2
370	0.2
371	0.2
372	0.21
373	0.22
374	0.22
375	0.2
376	0.21
377	0.19
378	0.19
379	0.24
380	0.27
381	0.29
382	0.29
383	0.3
384	0.28
385	0.29
386	0.31
387	0.25
388	0.22
389	0.23
390	0.21
391	0.21
392	0.2
393	0.17
394	0.14
395	0.13
396	0.14
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.13
401	0.13
402	0.14
403	0.14
404	0.11
405	0.1
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.11
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.13
424	0.14
425	0.14
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.11
430	0.13
431	0.15
432	0.15
433	0.15
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.15
438	0.11
439	0.1
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.06
446	0.07
447	0.08
448	0.08
449	0.1
450	0.1
451	0.13
452	0.13
453	0.13
454	0.17
455	0.19
456	0.2
457	0.26
458	0.28
459	0.26
460	0.26
461	0.25
462	0.27
463	0.27
464	0.27
465	0.19
466	0.25
467	0.34
468	0.41
469	0.43
470	0.4
471	0.38
472	0.38
473	0.43
474	0.43
475	0.36
476	0.34
477	0.34
478	0.37
479	0.41
480	0.48
481	0.47
482	0.46
483	0.49
484	0.53
485	0.55
486	0.59
487	0.6
488	0.57
489	0.56
490	0.52
491	0.48
492	0.41
493	0.35
494	0.26
495	0.2
496	0.18
497	0.14
498	0.13
499	0.12
500	0.11
501	0.11
502	0.13
503	0.12
504	0.15
505	0.15
506	0.14
507	0.14
508	0.15
509	0.15
510	0.13
511	0.17
512	0.12
513	0.13
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.17
518	0.2
519	0.18
520	0.22
521	0.24
522	0.25
523	0.27
524	0.28
525	0.32
526	0.36
527	0.37
528	0.39
529	0.45
530	0.5
531	0.55
532	0.63
533	0.7
534	0.74
535	0.81
536	0.84
537	0.86
538	0.86
539	0.9
540	0.91
541	0.91
542	0.92
543	0.92
544	0.92
545	0.9
546	0.9
547	0.88
548	0.87
549	0.86
550	0.84
551	0.85
552	0.81
553	0.75
554	0.68
555	0.61
556	0.53
557	0.43
558	0.33
559	0.23
560	0.18
561	0.15
562	0.13
563	0.12
564	0.1
565	0.09
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.08
570	0.1
571	0.11
572	0.15
573	0.23
574	0.33
575	0.36
576	0.44
577	0.5
578	0.53
579	0.6
580	0.67
581	0.69
582	0.7
583	0.77
584	0.8
585	0.82
586	0.86
587	0.84
588	0.83
589	0.81
590	0.79
591	0.72
592	0.69
593	0.71
594	0.73
595	0.74
596	0.73
597	0.69
598	0.64
599	0.62
600	0.58
601	0.51
602	0.47
603	0.42
604	0.41
605	0.44
606	0.44
607	0.46
608	0.45
609	0.45
610	0.44
611	0.5
612	0.52
613	0.52
614	0.53
615	0.5
616	0.49
617	0.5

A0A5N6JVA5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer