Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VAD6

Protein Details
Accession H1VAD6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
614-641TVPNVHRPPKTKERPVRRRRGDTSARLMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
620-633RPPKTKERPVRRRR
Subcellular Location(s) plas 22, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004841  AA-permease/SLC12A_dom  
IPR018491  SLC12_C  
IPR004842  SLC12A_fam  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015377  F:chloride:monoatomic cation symporter activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00324  AA_permease  
PF03522  SLC12  
Amino Acid Sequences MGGDDRRASLSSMEQTGKKSKLGAVSGVYIPVCLNIFSILMFLRFGWILGQVGLLGMLGLLVTAYLVDFLTTLSLSAIASNGEVKGGGAYYVISRSLGPEFGGSIGVLFYLAQVLNTALNVVGLIDCIKLNVGESFPQGYWTVYLLQTLALLLCAGLCLAGSGTFAKASNALLVILTLAIVSIPISAAFKSPFHDSELGVRFTGFSVETLVDNFAPHTRSESYKGFETFREVFAILFPATSGIFAGASMSGDLHNPSKDIPKGTLWAMMTTFIAYLVVVFSMAATTTHASFLNNTNIISVTSLSMPLILAGECAVTFFSAVMGLIGAAKLMQALARDKLLPGLLPFSRGTKRADEPVQAILLTYALAQVAMFANLNQIATLISMGYQQMTFFVMNLACFLLKIGSAPNFRPAFKFFSWETAFAGSIMSAAAMFFIDQTYAATAVCLLVSLFCLIHYLSPPKRWGDVSQNLIYHQVRKYLLRLRPEHIKFWRPQIILLINNPRSQTRLIQFCNSVKKGGLYILGHVIVTDDFNSGVHEARLQQAAWTKYISEFSRIKAFVQLTMSPTITWGIRNLILSAGLGGMRPNIAVMGFYNMDELRSSRPSVQVPKPPSPTVPNVHRPPKTKERPVRRRRGDTSARLMDGFLPTDVIKTEGMMSVTSYMTMLEDLALRYKLNVAIGKGFEELETPRKDNANIKRHIDLWPIQMSAEVLSDGKSVLTTNFDTYTLILQLGYILYSVPTWHKVYNVRVMVFVEYESEVEEERARVKALLDKLRIEAEVIVFWLASGNLNTYELIINGQSNDIESQIMVHDILKEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.36
3 0.43
4 0.43
5 0.39
6 0.37
7 0.36
8 0.39
9 0.39
10 0.38
11 0.33
12 0.34
13 0.33
14 0.33
15 0.29
16 0.22
17 0.19
18 0.17
19 0.15
20 0.11
21 0.11
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.06
42 0.04
43 0.03
44 0.03
45 0.02
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.02
50 0.02
51 0.02
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.04
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.04
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.12
122 0.15
123 0.15
124 0.17
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.12
131 0.13
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.12
178 0.16
179 0.16
180 0.2
181 0.21
182 0.2
183 0.27
184 0.31
185 0.3
186 0.26
187 0.25
188 0.21
189 0.2
190 0.2
191 0.12
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.1
204 0.14
205 0.15
206 0.18
207 0.23
208 0.26
209 0.27
210 0.3
211 0.32
212 0.3
213 0.28
214 0.32
215 0.28
216 0.26
217 0.24
218 0.2
219 0.18
220 0.17
221 0.18
222 0.12
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.16
245 0.18
246 0.19
247 0.2
248 0.2
249 0.22
250 0.22
251 0.25
252 0.2
253 0.19
254 0.17
255 0.15
256 0.14
257 0.12
258 0.11
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.13
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.11
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.03
319 0.05
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.07
329 0.1
330 0.09
331 0.12
332 0.12
333 0.15
334 0.17
335 0.19
336 0.21
337 0.22
338 0.24
339 0.27
340 0.29
341 0.27
342 0.27
343 0.26
344 0.24
345 0.2
346 0.18
347 0.12
348 0.09
349 0.07
350 0.05
351 0.04
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.09
392 0.11
393 0.12
394 0.19
395 0.2
396 0.21
397 0.22
398 0.23
399 0.25
400 0.24
401 0.27
402 0.2
403 0.26
404 0.27
405 0.26
406 0.24
407 0.19
408 0.19
409 0.15
410 0.14
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.03
416 0.02
417 0.02
418 0.02
419 0.02
420 0.02
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.07
443 0.13
444 0.15
445 0.18
446 0.21
447 0.21
448 0.23
449 0.24
450 0.26
451 0.28
452 0.33
453 0.35
454 0.36
455 0.35
456 0.33
457 0.36
458 0.33
459 0.29
460 0.23
461 0.22
462 0.2
463 0.21
464 0.25
465 0.29
466 0.33
467 0.37
468 0.39
469 0.38
470 0.47
471 0.48
472 0.51
473 0.48
474 0.5
475 0.44
476 0.48
477 0.53
478 0.43
479 0.41
480 0.39
481 0.37
482 0.33
483 0.35
484 0.36
485 0.31
486 0.33
487 0.33
488 0.28
489 0.26
490 0.26
491 0.27
492 0.24
493 0.29
494 0.3
495 0.32
496 0.35
497 0.38
498 0.44
499 0.4
500 0.36
501 0.29
502 0.27
503 0.24
504 0.22
505 0.22
506 0.14
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.12
512 0.12
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.12
529 0.17
530 0.19
531 0.19
532 0.18
533 0.16
534 0.16
535 0.21
536 0.2
537 0.2
538 0.21
539 0.22
540 0.28
541 0.28
542 0.28
543 0.29
544 0.28
545 0.25
546 0.26
547 0.26
548 0.21
549 0.23
550 0.23
551 0.17
552 0.17
553 0.16
554 0.13
555 0.12
556 0.1
557 0.11
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.11
562 0.11
563 0.1
564 0.09
565 0.07
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.05
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.15
587 0.17
588 0.17
589 0.21
590 0.26
591 0.34
592 0.4
593 0.44
594 0.49
595 0.55
596 0.58
597 0.55
598 0.54
599 0.51
600 0.5
601 0.49
602 0.5
603 0.52
604 0.55
605 0.62
606 0.65
607 0.65
608 0.67
609 0.71
610 0.73
611 0.74
612 0.76
613 0.78
614 0.84
615 0.89
616 0.92
617 0.91
618 0.9
619 0.86
620 0.86
621 0.84
622 0.8
623 0.79
624 0.73
625 0.64
626 0.54
627 0.49
628 0.4
629 0.32
630 0.25
631 0.16
632 0.12
633 0.11
634 0.11
635 0.11
636 0.11
637 0.09
638 0.08
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.1
643 0.1
644 0.1
645 0.11
646 0.1
647 0.09
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.06
652 0.05
653 0.06
654 0.07
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.1
659 0.12
660 0.13
661 0.16
662 0.18
663 0.17
664 0.21
665 0.21
666 0.22
667 0.21
668 0.2
669 0.16
670 0.15
671 0.16
672 0.2
673 0.23
674 0.24
675 0.26
676 0.28
677 0.31
678 0.38
679 0.46
680 0.48
681 0.5
682 0.52
683 0.52
684 0.52
685 0.53
686 0.5
687 0.44
688 0.4
689 0.37
690 0.33
691 0.3
692 0.29
693 0.25
694 0.2
695 0.16
696 0.11
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.08
701 0.08
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.12
706 0.12
707 0.15
708 0.16
709 0.16
710 0.17
711 0.17
712 0.18
713 0.15
714 0.13
715 0.1
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.08
720 0.06
721 0.05
722 0.05
723 0.06
724 0.08
725 0.1
726 0.14
727 0.17
728 0.18
729 0.23
730 0.29
731 0.35
732 0.43
733 0.45
734 0.41
735 0.4
736 0.41
737 0.37
738 0.31
739 0.26
740 0.18
741 0.14
742 0.13
743 0.12
744 0.12
745 0.11
746 0.11
747 0.13
748 0.12
749 0.14
750 0.15
751 0.15
752 0.15
753 0.16
754 0.22
755 0.29
756 0.37
757 0.38
758 0.39
759 0.4
760 0.42
761 0.4
762 0.34
763 0.28
764 0.2
765 0.17
766 0.15
767 0.13
768 0.11
769 0.1
770 0.1
771 0.08
772 0.08
773 0.08
774 0.1
775 0.11
776 0.12
777 0.12
778 0.13
779 0.13
780 0.12
781 0.13
782 0.12
783 0.12
784 0.12
785 0.13
786 0.11
787 0.12
788 0.13
789 0.12
790 0.11
791 0.09
792 0.1
793 0.09
794 0.11
795 0.09
796 0.1
797 0.11