FuNGI

A0A5N6KIK6

Protein Details

Accession

A0A5N6KIK6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
149-180	QFLSIQKQLREKRKEKKRKGKGREGKGRENIH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-176	LREKRKEKKRKGKGREGKGR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5, mito 2, vacu 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR013238 RNA_pol_III_Rbc25 IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF08292 RNA_pol_Rbc25 PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04330 RNAP_III_Rpc25_N

Amino Acid Sequences

MMLTLLLDENLGEEEGEGEEEKEKEEEEEEKKRLLKKGFGKEQLQEVKISVKVEFFGGFVTVQVEVEVEVQVQVQVQVQVQVQVQHNTTLGKVNIINQSSKVGLEKKQSPWNLRIISNHVIRFSPEISGGYLEIWVSGRSDSECGRQKQFLSIQKQLREKRKEKKRKGKGREGKGRENIHITGSVSTQCSFSPKLQIWFKSHLKIWGKDASQAIEDNINLKYANKVIQKIGLCICFYDLLSASEGLIGHGDGLVNVNVEFRIVVFRPFKFEIMTGRISSSIESGIRVRTHFFDEIFVPARMLPEGSHFDHNEQVFVWKTEEGTELFFDNQEAVRFQVDSEQWNDQAPLGPEKQDDNEEARVIEAPYKVIASMENVGLGPCLCYGGYDNLYLWSWENSLGSGNQKEATLVTKTSLNSRVRSNFRGGIGISQVSHGGFSFKFLCMISVLTQNLITSLATTVEYVYKLYTMRNFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.08
4	0.08
5	0.08
6	0.11
7	0.12
8	0.13
9	0.13
10	0.13
11	0.13
12	0.15
13	0.22
14	0.26
15	0.34
16	0.35
17	0.4
18	0.45
19	0.5
20	0.55
21	0.53
22	0.55
23	0.57
24	0.65
25	0.7
26	0.73
27	0.72
28	0.68
29	0.72
30	0.71
31	0.62
32	0.52
33	0.43
34	0.39
35	0.37
36	0.34
37	0.25
38	0.18
39	0.17
40	0.18
41	0.17
42	0.13
43	0.11
44	0.11
45	0.1
46	0.09
47	0.1
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.07
52	0.06
53	0.07
54	0.07
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.12
65	0.12
66	0.15
67	0.16
68	0.21
69	0.22
70	0.24
71	0.25
72	0.23
73	0.24
74	0.22
75	0.21
76	0.21
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.22
81	0.27
82	0.28
83	0.28
84	0.24
85	0.26
86	0.23
87	0.23
88	0.22
89	0.2
90	0.23
91	0.29
92	0.35
93	0.39
94	0.46
95	0.52
96	0.53
97	0.53
98	0.57
99	0.53
100	0.49
101	0.47
102	0.45
103	0.46
104	0.46
105	0.43
106	0.36
107	0.32
108	0.31
109	0.3
110	0.25
111	0.19
112	0.14
113	0.14
114	0.13
115	0.13
116	0.12
117	0.1
118	0.09
119	0.08
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.06
125	0.07
126	0.08
127	0.1
128	0.11
129	0.18
130	0.25
131	0.28
132	0.32
133	0.34
134	0.34
135	0.38
136	0.44
137	0.45
138	0.44
139	0.49
140	0.51
141	0.55
142	0.63
143	0.64
144	0.67
145	0.69
146	0.71
147	0.73
148	0.78
149	0.83
150	0.86
151	0.89
152	0.9
153	0.91
154	0.93
155	0.94
156	0.92
157	0.92
158	0.91
159	0.87
160	0.86
161	0.83
162	0.76
163	0.67
164	0.61
165	0.51
166	0.41
167	0.35
168	0.27
169	0.19
170	0.17
171	0.16
172	0.13
173	0.13
174	0.12
175	0.1
176	0.12
177	0.13
178	0.14
179	0.18
180	0.19
181	0.25
182	0.3
183	0.34
184	0.35
185	0.4
186	0.42
187	0.4
188	0.39
189	0.41
190	0.41
191	0.39
192	0.39
193	0.37
194	0.35
195	0.35
196	0.35
197	0.28
198	0.24
199	0.22
200	0.18
201	0.13
202	0.13
203	0.1
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.14
211	0.15
212	0.17
213	0.17
214	0.22
215	0.22
216	0.23
217	0.24
218	0.2
219	0.17
220	0.16
221	0.16
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.03
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.06
249	0.06
250	0.11
251	0.14
252	0.14
253	0.19
254	0.21
255	0.21
256	0.19
257	0.2
258	0.19
259	0.21
260	0.23
261	0.18
262	0.17
263	0.17
264	0.17
265	0.16
266	0.13
267	0.1
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.12
272	0.13
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.18
277	0.18
278	0.17
279	0.16
280	0.16
281	0.18
282	0.19
283	0.18
284	0.14
285	0.13
286	0.13
287	0.12
288	0.11
289	0.08
290	0.1
291	0.14
292	0.16
293	0.19
294	0.2
295	0.21
296	0.25
297	0.25
298	0.21
299	0.17
300	0.17
301	0.15
302	0.15
303	0.16
304	0.11
305	0.12
306	0.12
307	0.14
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.09
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.14
324	0.14
325	0.15
326	0.18
327	0.2
328	0.19
329	0.2
330	0.21
331	0.15
332	0.18
333	0.18
334	0.19
335	0.18
336	0.19
337	0.19
338	0.21
339	0.22
340	0.21
341	0.22
342	0.21
343	0.22
344	0.21
345	0.2
346	0.19
347	0.18
348	0.16
349	0.17
350	0.14
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.12
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.11
359	0.1
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.06
370	0.09
371	0.13
372	0.15
373	0.15
374	0.15
375	0.17
376	0.17
377	0.17
378	0.16
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.1
384	0.12
385	0.13
386	0.17
387	0.17
388	0.18
389	0.18
390	0.18
391	0.18
392	0.17
393	0.19
394	0.16
395	0.15
396	0.15
397	0.18
398	0.19
399	0.24
400	0.32
401	0.33
402	0.34
403	0.41
404	0.48
405	0.51
406	0.54
407	0.55
408	0.51
409	0.48
410	0.49
411	0.42
412	0.36
413	0.33
414	0.3
415	0.24
416	0.2
417	0.19
418	0.16
419	0.15
420	0.12
421	0.12
422	0.1
423	0.14
424	0.15
425	0.14
426	0.16
427	0.16
428	0.17
429	0.15
430	0.17
431	0.16
432	0.19
433	0.19
434	0.18
435	0.19
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.13
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.12
447	0.12
448	0.12
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.18

A0A5N6KIK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer