FuNGI

A0A5N6K3D2

Protein Details

Accession

A0A5N6K3D2

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
126-147	TGRARFKPKNIRRDQADRERLE	Basic
418-441	ISPQQSRVQRPSKKKNKIPVIQTE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-26	SRGRARGTGRGRGRGR
117-180	ASMRARGEATGRARFKPKNIRRDQADRERLEQEERDRKAANQEKADREARRAQRGRGHTGRGRG
428-432	PSKKK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAERGTTSRGRARGTGRGRGRGRGIAIEAVETPEPRGVLDQPSQSPAPVAPMLQSTGIITPKLEPNDDTFDPNTLPATVPTELPAETSTQTSATTLTDPSIKIESATTRGRGGASMRARGEATGRARFKPKNIRRDQADRERLEQEERDRKAANQEKADREARRAQRGRGHTGRGRGDAMGQNRGAGRGAPTSSATGIFSVAPAAMDRKGGMGGFAIASARGSGGGGGSGGFGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGSSGLGFGGINVLSAENSATFNPEYPDEGDGPAKKVNIEMINLIDDDDDEDMVGSSRGGKGFKSRSLAPIRIKREEHKERSNMMVSEPELAEIAKKQADEEDGNQAGEDTEMTTDGTTPAKIPDELRTKGEPGLESPTMSKFPEFKAPSSPEEKKSLKKELISPQQSRVQRPSKKKNKIPVIQTEEDKFEYERHLEDVEILAEELCLLRGNVDKTPKDKGKGKAVDADGDVGMDGEKEQDEFQPEANHADGRIYLFQFPPILPRLFNPQVENQEDVVVTQSSEQIDLTDDKDKVKKESEEVIIKSEPTITQENEALIGEQGYIGKLVVRKSGKVELDWGGTSMAVGRGVPASFLSQIVLAEDPKGEAPEGVATGLGKVMGKFIVTPDWDKIF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.58
3	0.59
4	0.58
5	0.59
6	0.59
7	0.64
8	0.64
9	0.65
10	0.64
11	0.59
12	0.55
13	0.49
14	0.45
15	0.38
16	0.35
17	0.3
18	0.26
19	0.24
20	0.22
21	0.18
22	0.17
23	0.15
24	0.15
25	0.14
26	0.16
27	0.15
28	0.2
29	0.25
30	0.29
31	0.29
32	0.34
33	0.34
34	0.31
35	0.3
36	0.24
37	0.24
38	0.2
39	0.18
40	0.15
41	0.16
42	0.18
43	0.17
44	0.17
45	0.13
46	0.15
47	0.16
48	0.15
49	0.14
50	0.16
51	0.22
52	0.24
53	0.25
54	0.23
55	0.26
56	0.33
57	0.34
58	0.34
59	0.29
60	0.29
61	0.28
62	0.27
63	0.23
64	0.17
65	0.16
66	0.13
67	0.17
68	0.15
69	0.15
70	0.16
71	0.16
72	0.15
73	0.16
74	0.15
75	0.13
76	0.13
77	0.14
78	0.13
79	0.12
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.11
84	0.12
85	0.11
86	0.12
87	0.14
88	0.14
89	0.16
90	0.18
91	0.16
92	0.15
93	0.17
94	0.18
95	0.21
96	0.25
97	0.24
98	0.22
99	0.23
100	0.23
101	0.22
102	0.22
103	0.25
104	0.26
105	0.3
106	0.29
107	0.3
108	0.3
109	0.29
110	0.29
111	0.27
112	0.29
113	0.31
114	0.34
115	0.36
116	0.43
117	0.45
118	0.52
119	0.56
120	0.6
121	0.62
122	0.68
123	0.72
124	0.73
125	0.8
126	0.81
127	0.8
128	0.81
129	0.72
130	0.68
131	0.63
132	0.57
133	0.52
134	0.46
135	0.44
136	0.44
137	0.43
138	0.43
139	0.41
140	0.41
141	0.47
142	0.51
143	0.48
144	0.48
145	0.53
146	0.54
147	0.59
148	0.64
149	0.55
150	0.52
151	0.55
152	0.53
153	0.56
154	0.56
155	0.56
156	0.58
157	0.62
158	0.66
159	0.62
160	0.63
161	0.56
162	0.59
163	0.58
164	0.52
165	0.47
166	0.38
167	0.37
168	0.34
169	0.32
170	0.29
171	0.25
172	0.24
173	0.23
174	0.24
175	0.19
176	0.15
177	0.14
178	0.12
179	0.13
180	0.12
181	0.13
182	0.14
183	0.14
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.07
195	0.06
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.05
207	0.04
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.02
223	0.02
224	0.02
225	0.02
226	0.02
227	0.02
228	0.02
229	0.02
230	0.02
231	0.01
232	0.01
233	0.01
234	0.01
235	0.01
236	0.01
237	0.01
238	0.01
239	0.01
240	0.01
241	0.01
242	0.01
243	0.01
244	0.01
245	0.01
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.02
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.12
270	0.11
271	0.12
272	0.14
273	0.14
274	0.15
275	0.15
276	0.14
277	0.12
278	0.12
279	0.14
280	0.13
281	0.13
282	0.12
283	0.11
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.08
288	0.06
289	0.06
290	0.05
291	0.04
292	0.03
293	0.04
294	0.03
295	0.04
296	0.04
297	0.03
298	0.04
299	0.05
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.13
304	0.16
305	0.2
306	0.22
307	0.23
308	0.29
309	0.33
310	0.39
311	0.4
312	0.44
313	0.46
314	0.48
315	0.49
316	0.46
317	0.52
318	0.56
319	0.56
320	0.55
321	0.54
322	0.51
323	0.53
324	0.51
325	0.41
326	0.32
327	0.27
328	0.2
329	0.18
330	0.16
331	0.12
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.07
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.11
342	0.12
343	0.13
344	0.17
345	0.16
346	0.16
347	0.16
348	0.15
349	0.12
350	0.11
351	0.09
352	0.04
353	0.03
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.1
366	0.17
367	0.23
368	0.25
369	0.28
370	0.28
371	0.28
372	0.29
373	0.3
374	0.22
375	0.18
376	0.21
377	0.18
378	0.17
379	0.17
380	0.17
381	0.17
382	0.17
383	0.16
384	0.13
385	0.14
386	0.23
387	0.24
388	0.23
389	0.3
390	0.33
391	0.35
392	0.41
393	0.44
394	0.38
395	0.44
396	0.46
397	0.45
398	0.48
399	0.52
400	0.48
401	0.47
402	0.51
403	0.53
404	0.6
405	0.61
406	0.57
407	0.54
408	0.57
409	0.58
410	0.54
411	0.53
412	0.53
413	0.53
414	0.62
415	0.68
416	0.72
417	0.79
418	0.82
419	0.84
420	0.84
421	0.83
422	0.8
423	0.79
424	0.77
425	0.7
426	0.65
427	0.57
428	0.49
429	0.43
430	0.37
431	0.27
432	0.2
433	0.19
434	0.17
435	0.16
436	0.15
437	0.15
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.11
442	0.09
443	0.08
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.05
452	0.09
453	0.11
454	0.15
455	0.22
456	0.24
457	0.27
458	0.36
459	0.4
460	0.43
461	0.48
462	0.51
463	0.55
464	0.58
465	0.58
466	0.57
467	0.53
468	0.5
469	0.43
470	0.38
471	0.27
472	0.21
473	0.18
474	0.1
475	0.09
476	0.06
477	0.05
478	0.04
479	0.05
480	0.06
481	0.07
482	0.08
483	0.12
484	0.13
485	0.15
486	0.16
487	0.17
488	0.18
489	0.18
490	0.17
491	0.13
492	0.14
493	0.13
494	0.13
495	0.16
496	0.15
497	0.16
498	0.16
499	0.17
500	0.18
501	0.17
502	0.19
503	0.2
504	0.2
505	0.18
506	0.2
507	0.28
508	0.31
509	0.34
510	0.33
511	0.35
512	0.4
513	0.42
514	0.44
515	0.35
516	0.31
517	0.29
518	0.25
519	0.21
520	0.14
521	0.12
522	0.1
523	0.11
524	0.1
525	0.11
526	0.11
527	0.09
528	0.11
529	0.12
530	0.14
531	0.18
532	0.18
533	0.22
534	0.27
535	0.29
536	0.31
537	0.36
538	0.37
539	0.35
540	0.42
541	0.45
542	0.48
543	0.47
544	0.48
545	0.42
546	0.39
547	0.35
548	0.3
549	0.23
550	0.2
551	0.23
552	0.19
553	0.21
554	0.22
555	0.22
556	0.21
557	0.21
558	0.17
559	0.13
560	0.12
561	0.09
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.07
566	0.06
567	0.09
568	0.11
569	0.13
570	0.21
571	0.23
572	0.25
573	0.3
574	0.38
575	0.37
576	0.36
577	0.39
578	0.34
579	0.35
580	0.33
581	0.29
582	0.21
583	0.18
584	0.17
585	0.14
586	0.12
587	0.09
588	0.08
589	0.08
590	0.1
591	0.1
592	0.11
593	0.1
594	0.11
595	0.12
596	0.12
597	0.12
598	0.11
599	0.11
600	0.12
601	0.13
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.12
606	0.12
607	0.13
608	0.12
609	0.1
610	0.11
611	0.13
612	0.13
613	0.12
614	0.11
615	0.1
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.09
620	0.08
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.12
626	0.17
627	0.2
628	0.23

A0A5N6K3D2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer