Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VFY4

Protein Details
Accession H1VFY4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
591-617GLQAGHRLRRPRPARRVHQRPRLALGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
588-617RRPRPRGPGLQAGHRLRRPRPARRVHQRPR
Subcellular Location(s) extr 19, mito 3, pero 3, cyto 1.5, cyto_nucl 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
IPR039279  QRT3-like  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MRVATAFWLAAATLAKAAYWMEDIDHQGISAYHPDPNYKVFRNVKDFGAKGDGVTDDTAAINEAISSGQRCEPGKCKGETTSPATVYFPPGTYLISGSIIDFFYTQIIGDPTDRPVIKAAANFPTNTTLGLLDGNQYGANGLAWGATNVFFRQVRNLIFDTTDIPASASALAIHWPSSQATSITNCVFRLAEGADSKHVGLFIEEGSGGLLNDLDFYGGQYGANFGNQQYTLRGARFFNAQVAINQLWDWGWTYKSIYVENCGTGIRMQDNSTTSITLIDSQFVNVKTAIRTSRDPGAKVPSTAGTLVLENVAFSNVGAALIGPKNNTIIPGTSGTILNHGFAMGHVYTPTGPTDYTGGDASYFPVYPALLASSSTNGTKYYERSKPHYEDVPASCFISARSFGAKGDGTTDDTVALNNLFNYVTADPSAYLVAFVDAGTYYVSDTVFIPPGARIVGEALASIIMGGGARFQDITRPHPVVKVAIPGQCGSIEWSDMIVSTRGAAPGAKVIEYNLNTLGGEPSGMWDVHVRVGGFAGTQQQLAQCPTTPNATXTAETVDGNCVAAWMSMHLTRASSXXWMDXXLALDRRPRPRGPGLQAGHRLRRPRPARRVHQRPRLALGLGQRAPHGLTVPAPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.13
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.17
18 0.16
19 0.17
20 0.19
21 0.22
22 0.24
23 0.3
24 0.36
25 0.34
26 0.43
27 0.47
28 0.54
29 0.59
30 0.6
31 0.59
32 0.59
33 0.56
34 0.5
35 0.48
36 0.4
37 0.32
38 0.31
39 0.26
40 0.2
41 0.2
42 0.16
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.09
54 0.1
55 0.13
56 0.18
57 0.19
58 0.24
59 0.3
60 0.38
61 0.43
62 0.43
63 0.44
64 0.44
65 0.49
66 0.5
67 0.5
68 0.49
69 0.44
70 0.43
71 0.42
72 0.38
73 0.36
74 0.32
75 0.25
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.16
80 0.16
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.11
97 0.12
98 0.14
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.21
103 0.22
104 0.22
105 0.24
106 0.26
107 0.27
108 0.29
109 0.28
110 0.27
111 0.28
112 0.26
113 0.23
114 0.2
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.08
135 0.08
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.18
140 0.22
141 0.22
142 0.26
143 0.27
144 0.24
145 0.24
146 0.24
147 0.21
148 0.18
149 0.17
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.16
170 0.17
171 0.18
172 0.16
173 0.17
174 0.16
175 0.14
176 0.14
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.12
218 0.14
219 0.14
220 0.17
221 0.15
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.14
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.12
242 0.13
243 0.15
244 0.13
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.13
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.12
270 0.11
271 0.12
272 0.1
273 0.11
274 0.1
275 0.13
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.18
280 0.25
281 0.26
282 0.26
283 0.26
284 0.3
285 0.28
286 0.27
287 0.25
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.15
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.09
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.1
366 0.12
367 0.15
368 0.21
369 0.26
370 0.3
371 0.36
372 0.42
373 0.44
374 0.47
375 0.48
376 0.43
377 0.43
378 0.42
379 0.39
380 0.33
381 0.29
382 0.25
383 0.2
384 0.18
385 0.15
386 0.13
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.1
403 0.09
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.1
437 0.09
438 0.1
439 0.09
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.1
460 0.13
461 0.18
462 0.23
463 0.26
464 0.27
465 0.29
466 0.3
467 0.28
468 0.27
469 0.29
470 0.27
471 0.27
472 0.27
473 0.25
474 0.25
475 0.22
476 0.21
477 0.17
478 0.13
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.08
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.12
494 0.13
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.19
499 0.2
500 0.21
501 0.17
502 0.17
503 0.16
504 0.17
505 0.17
506 0.1
507 0.09
508 0.07
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.11
514 0.12
515 0.14
516 0.16
517 0.14
518 0.12
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.1
523 0.13
524 0.12
525 0.12
526 0.13
527 0.14
528 0.16
529 0.18
530 0.19
531 0.16
532 0.18
533 0.2
534 0.24
535 0.23
536 0.22
537 0.23
538 0.24
539 0.22
540 0.21
541 0.23
542 0.19
543 0.19
544 0.19
545 0.16
546 0.14
547 0.13
548 0.12
549 0.08
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.1
554 0.11
555 0.13
556 0.13
557 0.13
558 0.14
559 0.17
560 0.17
561 0.15
562 0.14
563 0.14
564 0.14
565 0.15
566 0.17
567 0.22
568 0.28
569 0.32
570 0.38
571 0.43
572 0.45
573 0.51
574 0.58
575 0.6
576 0.59
577 0.65
578 0.63
579 0.66
580 0.73
581 0.74
582 0.73
583 0.68
584 0.69
585 0.63
586 0.7
587 0.7
588 0.71
589 0.74
590 0.76
591 0.82
592 0.86
593 0.92
594 0.92
595 0.93
596 0.92
597 0.86
598 0.82
599 0.75
600 0.66
601 0.58
602 0.55
603 0.54
604 0.47
605 0.42
606 0.36
607 0.33
608 0.32
609 0.3
610 0.24
611 0.15