Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VDM1

Protein Details
Accession H1VDM1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-49PPKSPSKTSDIRSRNRRREYIERNPKYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, mito 2, extr 1, pero 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040233  CCD97-like_C  
IPR018613  Ccdc97-like  
KEGG chig:CH63R_10021  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09747  CCD97-like_C  
Amino Acid Sequences MPSCSEPEPGLQGLHFDKPIPRPPKSPSKTSDIRSRNRRREYIERNPKYFNNAEHELADTLLYDSLIRKFQTPAEREADGKAKGYSGVLESSLLRGEARLADLKSSTEAASAPGHAKDFTTEADLSQTETKEDGLQRWQEFLTERFVRGHDEDFDYSLVDHNEDYDTMERRDAEEAWFDEEDPNWASDADKQVETKQGETGVQDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.19
4 0.23
5 0.29
6 0.39
7 0.42
8 0.43
9 0.45
10 0.51
11 0.61
12 0.61
13 0.63
14 0.58
15 0.59
16 0.63
17 0.63
18 0.67
19 0.64
20 0.69
21 0.72
22 0.78
23 0.8
24 0.81
25 0.82
26 0.79
27 0.81
28 0.81
29 0.81
30 0.82
31 0.79
32 0.74
33 0.73
34 0.66
35 0.62
36 0.56
37 0.48
38 0.44
39 0.4
40 0.38
41 0.33
42 0.34
43 0.27
44 0.24
45 0.2
46 0.12
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.18
58 0.26
59 0.27
60 0.3
61 0.31
62 0.31
63 0.31
64 0.32
65 0.31
66 0.24
67 0.23
68 0.18
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.11
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.06
95 0.06
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.17
122 0.21
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.2
127 0.21
128 0.21
129 0.23
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.21
134 0.24
135 0.24
136 0.25
137 0.2
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.21
142 0.18
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.11
152 0.13
153 0.16
154 0.16
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.21
159 0.19
160 0.17
161 0.19
162 0.2
163 0.22
164 0.22
165 0.21
166 0.2
167 0.19
168 0.2
169 0.16
170 0.16
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.15
175 0.22
176 0.22
177 0.23
178 0.24
179 0.26
180 0.34
181 0.35
182 0.32
183 0.28
184 0.27
185 0.26