Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VAG5

Protein Details
Accession H1VAG5    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-256IGLFLFFRRRKQRQNENDKYDVPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 19, nucl 2, cyto 2, cyto_nucl 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002889  WSC_carb-bd  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF01822  WSC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51212  WSC  
Amino Acid Sequences MGILALALLPMAKTVQAVPEADFLLPRQLQQTLCSSQNTASMSANLSTWQTNGLCQDFCRDKNYAFAIVQWQSCWCSDVAPAPSTEAEISDKCNDICPGYDIERCGSRPNYFGYLTLAKTPVSTAGSGGGSGGATTSSKVPSSTAKPASSESETATTSSTTSTSSKPRTTVQTVTADGTVRTVTVTPTATGNDVATGASELAPSDQSTSNGPSTGAVVGIVVGVIGAVVALAGIGLFLFFRRRKQRQNENDKYDVPSHRGSSAGMSGSPRNPEMVVTVDGGRWDPDTTSEQRRSRLLAHDPRLDPLPRGLYVRNKSAESINTLRDDQDYSRKVHQPVLRATNPDPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.13
4 0.14
5 0.16
6 0.18
7 0.19
8 0.18
9 0.18
10 0.16
11 0.21
12 0.2
13 0.19
14 0.19
15 0.22
16 0.22
17 0.24
18 0.3
19 0.27
20 0.3
21 0.31
22 0.3
23 0.27
24 0.31
25 0.3
26 0.26
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.19
31 0.18
32 0.15
33 0.15
34 0.13
35 0.12
36 0.15
37 0.13
38 0.14
39 0.18
40 0.2
41 0.19
42 0.19
43 0.26
44 0.28
45 0.3
46 0.32
47 0.31
48 0.29
49 0.34
50 0.37
51 0.33
52 0.27
53 0.27
54 0.29
55 0.3
56 0.3
57 0.24
58 0.23
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.14
63 0.11
64 0.12
65 0.17
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.19
81 0.18
82 0.16
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.18
87 0.2
88 0.18
89 0.2
90 0.22
91 0.21
92 0.24
93 0.24
94 0.22
95 0.23
96 0.25
97 0.27
98 0.24
99 0.24
100 0.23
101 0.24
102 0.23
103 0.23
104 0.2
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.14
109 0.12
110 0.11
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.12
129 0.16
130 0.23
131 0.26
132 0.26
133 0.27
134 0.28
135 0.31
136 0.29
137 0.25
138 0.19
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.12
150 0.17
151 0.21
152 0.23
153 0.24
154 0.27
155 0.3
156 0.33
157 0.33
158 0.3
159 0.3
160 0.29
161 0.28
162 0.26
163 0.21
164 0.17
165 0.15
166 0.11
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.01
213 0.01
214 0.01
215 0.01
216 0.01
217 0.01
218 0.01
219 0.01
220 0.01
221 0.01
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.09
226 0.1
227 0.18
228 0.29
229 0.37
230 0.47
231 0.57
232 0.68
233 0.73
234 0.84
235 0.86
236 0.84
237 0.81
238 0.74
239 0.67
240 0.62
241 0.54
242 0.47
243 0.4
244 0.34
245 0.3
246 0.28
247 0.25
248 0.21
249 0.21
250 0.17
251 0.14
252 0.15
253 0.18
254 0.2
255 0.22
256 0.2
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.12
273 0.17
274 0.22
275 0.3
276 0.38
277 0.41
278 0.44
279 0.46
280 0.46
281 0.45
282 0.48
283 0.49
284 0.51
285 0.54
286 0.59
287 0.58
288 0.57
289 0.58
290 0.52
291 0.43
292 0.38
293 0.35
294 0.28
295 0.31
296 0.33
297 0.38
298 0.42
299 0.48
300 0.46
301 0.43
302 0.43
303 0.44
304 0.42
305 0.4
306 0.4
307 0.36
308 0.36
309 0.36
310 0.35
311 0.32
312 0.32
313 0.29
314 0.34
315 0.34
316 0.35
317 0.42
318 0.48
319 0.49
320 0.53
321 0.53
322 0.52
323 0.57
324 0.62
325 0.59
326 0.57