Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6JU21

Protein Details
Accession A0A5N6JU21    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-305TTTTNGGRRKKRKGALTNPSAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-296RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARGKWIDKKNATHFQLVHRPQNDPLIHDESVSSMVLNPTNVPNSNKVKKLDDLTAELGSGIARVRDNEGEAANYGVYYDDTEYDYMQHMRDLGRGGGDATFVEATGPKNKNKGKGKQSLEDALRNASLEEKAGALLDEEILPSKNLRKATYQAQQDIPDALAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDDDEIFGKLAQDGEELDDEEFEETWDDEDGWESDATAKPTQEFKDAPATTQDIEDDEREDHGDGDWMANFSKFKKDQKSSKAQVAPSQSDLQSSLFTTTTNGGRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLFRTEGLTTLDQRFEKIEEQYNEDFDDMASVSIASSTVSTVDGDVRQDFDSIMDDFLGSHSMSGKKNVKKMKYQTGMEQLDEVRKGLGPARFTSFSSRTTRTQRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.65
3 0.68
4 0.66
5 0.66
6 0.58
7 0.57
8 0.52
9 0.58
10 0.51
11 0.43
12 0.42
13 0.39
14 0.37
15 0.34
16 0.31
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.15
21 0.1
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.16
27 0.21
28 0.24
29 0.26
30 0.32
31 0.4
32 0.46
33 0.51
34 0.51
35 0.51
36 0.53
37 0.55
38 0.53
39 0.47
40 0.45
41 0.42
42 0.38
43 0.34
44 0.28
45 0.23
46 0.16
47 0.13
48 0.09
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.13
53 0.14
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.13
61 0.11
62 0.09
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.1
93 0.18
94 0.22
95 0.23
96 0.32
97 0.36
98 0.45
99 0.53
100 0.61
101 0.62
102 0.68
103 0.71
104 0.69
105 0.7
106 0.68
107 0.62
108 0.56
109 0.47
110 0.39
111 0.34
112 0.27
113 0.23
114 0.17
115 0.13
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.11
132 0.15
133 0.17
134 0.19
135 0.22
136 0.25
137 0.33
138 0.39
139 0.4
140 0.4
141 0.4
142 0.4
143 0.37
144 0.34
145 0.26
146 0.19
147 0.14
148 0.11
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.07
208 0.09
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.16
214 0.17
215 0.19
216 0.18
217 0.17
218 0.26
219 0.26
220 0.25
221 0.24
222 0.24
223 0.21
224 0.21
225 0.19
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.16
246 0.2
247 0.27
248 0.36
249 0.43
250 0.51
251 0.6
252 0.69
253 0.66
254 0.7
255 0.69
256 0.61
257 0.58
258 0.56
259 0.49
260 0.42
261 0.4
262 0.32
263 0.27
264 0.26
265 0.22
266 0.16
267 0.15
268 0.13
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.16
274 0.22
275 0.29
276 0.35
277 0.45
278 0.54
279 0.62
280 0.69
281 0.72
282 0.75
283 0.79
284 0.81
285 0.82
286 0.82
287 0.77
288 0.69
289 0.64
290 0.54
291 0.44
292 0.35
293 0.26
294 0.19
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.14
299 0.15
300 0.13
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.17
305 0.18
306 0.19
307 0.21
308 0.26
309 0.23
310 0.24
311 0.23
312 0.22
313 0.23
314 0.23
315 0.3
316 0.27
317 0.34
318 0.34
319 0.34
320 0.32
321 0.29
322 0.25
323 0.17
324 0.16
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.09
340 0.11
341 0.13
342 0.13
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.14
347 0.12
348 0.14
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.11
356 0.08
357 0.08
358 0.11
359 0.16
360 0.18
361 0.26
362 0.35
363 0.4
364 0.48
365 0.57
366 0.6
367 0.65
368 0.73
369 0.75
370 0.75
371 0.73
372 0.73
373 0.74
374 0.7
375 0.6
376 0.54
377 0.46
378 0.43
379 0.4
380 0.32
381 0.23
382 0.21
383 0.21
384 0.24
385 0.25
386 0.23
387 0.25
388 0.32
389 0.33
390 0.34
391 0.41
392 0.38
393 0.41
394 0.44
395 0.46
396 0.47