Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6JM65

Protein Details
Accession A0A5N6JM65    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-242APQHLRHPPLHPKKSKRKRRYALEAQLENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-233PPLHPKKSKRKRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 10.499, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010378  TRAPPC13  
Pfam View protein in Pfam  
PF06159  DUF974  
Amino Acid Sequences MSHQRATSTLDGVKEPHSVSLKVLRLSRPSLSIQHPLPTPSLPPPPNLFLPAPSASLSYPSPEPSNFILSPLLTLPPAFGSAYVGETFSCTLCANNELPPPLSTPAQAYTSPDVAESPNTTKIISNITLNAEMKIPSTPTPISLSLSGPSPTPTSTTPSDDTPEIPTTSQSYLQKVLHFDLKEEGSHVLSVTDVSSCAPKPVLFPLPTPPPQTAPQHLRHPPLHPKKSKRKRRYALEAQLENTTEDNPITLTLVHLATTKGFSATSLNWEVVVSDLEGSEGGETELERPVLAPGDIRQVCFLVEEKDKDEDEEEEEVIDLGKGEDAEKEKRDREKDREIVDGRLIFGVLSIGWRGAMGNKGFLSTGNLGIRLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.26
4 0.27
5 0.26
6 0.28
7 0.34
8 0.37
9 0.37
10 0.42
11 0.4
12 0.42
13 0.45
14 0.44
15 0.4
16 0.39
17 0.41
18 0.41
19 0.43
20 0.4
21 0.41
22 0.4
23 0.39
24 0.37
25 0.32
26 0.3
27 0.29
28 0.37
29 0.33
30 0.36
31 0.38
32 0.4
33 0.41
34 0.42
35 0.37
36 0.29
37 0.33
38 0.3
39 0.27
40 0.23
41 0.22
42 0.17
43 0.2
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.17
48 0.19
49 0.18
50 0.22
51 0.21
52 0.28
53 0.24
54 0.24
55 0.23
56 0.21
57 0.22
58 0.19
59 0.17
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.12
81 0.13
82 0.16
83 0.18
84 0.19
85 0.2
86 0.2
87 0.22
88 0.21
89 0.2
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.19
94 0.18
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.17
100 0.16
101 0.14
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.14
133 0.16
134 0.14
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.15
142 0.16
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.22
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.19
151 0.16
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.19
157 0.17
158 0.17
159 0.2
160 0.21
161 0.22
162 0.22
163 0.22
164 0.22
165 0.21
166 0.19
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.14
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.12
189 0.17
190 0.16
191 0.18
192 0.22
193 0.27
194 0.3
195 0.31
196 0.28
197 0.26
198 0.29
199 0.32
200 0.33
201 0.34
202 0.36
203 0.42
204 0.45
205 0.48
206 0.46
207 0.49
208 0.53
209 0.58
210 0.62
211 0.62
212 0.68
213 0.74
214 0.83
215 0.88
216 0.88
217 0.88
218 0.88
219 0.9
220 0.9
221 0.89
222 0.88
223 0.86
224 0.77
225 0.68
226 0.6
227 0.51
228 0.41
229 0.3
230 0.21
231 0.13
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.19
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.14
290 0.18
291 0.2
292 0.22
293 0.25
294 0.25
295 0.25
296 0.25
297 0.22
298 0.21
299 0.2
300 0.18
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.12
305 0.1
306 0.07
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.1
312 0.14
313 0.2
314 0.25
315 0.31
316 0.36
317 0.45
318 0.53
319 0.58
320 0.63
321 0.68
322 0.71
323 0.68
324 0.71
325 0.65
326 0.6
327 0.57
328 0.49
329 0.4
330 0.32
331 0.29
332 0.19
333 0.16
334 0.13
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.1
343 0.16
344 0.16
345 0.2
346 0.2
347 0.21
348 0.21
349 0.21
350 0.24
351 0.2
352 0.25
353 0.23