Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5N6JW50

Protein Details
Accession A0A5N6JW50   
Localization Confidence Medium
Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
443-474AVRASNTQKKVPPKTPPRRRTRLKAMVTQPPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
432-466KKKRALPPLPPAVRASNTQKKVPPKTPPRRRTRLK
Subcellular Location(s) cyto 5, cyto_nucl 14.5, nucl 22
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MDEFEVAYTLDNEQQFWDEIDDIVSAKCASYQLIDNALRSYLHFTTNFKEEYLQSEFEVAKCLQKLMQSELFAANKDYVRTQIVYSLMQEDVPATLHVISSFLLFDGRNNEITFEIMNKEGCFPRLLELVKKGNREDPTLHRLLLELLYEMSRMQRLSFEDLGQVDDEFISFLFQIIEELSDDVDDPYHYPVIRVLLVLNEQYMVASTSKLDPSHHLTNRVVKILSHKGSSYMTFGENIILLLNRETETSLQLLILKLLYLLFTTNATYEYFYTNDLRVLLDVIIRNLLDLPNEFVSLRHTYLRVLYPLLAHTQLKEPPYYKKDEVVKVLSILGGSGNAHWEPADETTIRLVERVAKVPWLREDDISEGEVARKLLGISLAPSQTGSSISVSDVAAVTEKPGVQTPSRKAESETIVPDHDAHVIVSSDELPKKKRALPPLPPAVRASNTQKKVPPKTPPRRRTRLKAMVTQPPEATEVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.11
11 0.11
12 0.09
13 0.08
14 0.1
15 0.09
16 0.1
17 0.12
18 0.16
19 0.17
20 0.25
21 0.27
22 0.26
23 0.27
24 0.27
25 0.24
26 0.22
27 0.25
28 0.18
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.28
33 0.33
34 0.33
35 0.27
36 0.29
37 0.25
38 0.29
39 0.31
40 0.28
41 0.23
42 0.26
43 0.26
44 0.23
45 0.26
46 0.21
47 0.21
48 0.2
49 0.21
50 0.19
51 0.22
52 0.25
53 0.27
54 0.32
55 0.28
56 0.29
57 0.34
58 0.33
59 0.3
60 0.28
61 0.25
62 0.21
63 0.22
64 0.2
65 0.18
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.2
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.2
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.12
94 0.14
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.15
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.15
111 0.16
112 0.2
113 0.22
114 0.22
115 0.27
116 0.34
117 0.38
118 0.4
119 0.39
120 0.4
121 0.41
122 0.41
123 0.4
124 0.38
125 0.41
126 0.4
127 0.38
128 0.32
129 0.3
130 0.28
131 0.23
132 0.17
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.13
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.18
151 0.15
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.19
201 0.28
202 0.29
203 0.31
204 0.31
205 0.38
206 0.39
207 0.38
208 0.32
209 0.23
210 0.27
211 0.31
212 0.31
213 0.24
214 0.22
215 0.22
216 0.23
217 0.23
218 0.19
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.17
290 0.19
291 0.16
292 0.15
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.18
302 0.19
303 0.21
304 0.21
305 0.27
306 0.31
307 0.37
308 0.34
309 0.38
310 0.44
311 0.45
312 0.48
313 0.43
314 0.4
315 0.34
316 0.33
317 0.26
318 0.19
319 0.14
320 0.09
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.11
332 0.09
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.11
339 0.15
340 0.17
341 0.2
342 0.19
343 0.23
344 0.25
345 0.28
346 0.32
347 0.32
348 0.31
349 0.29
350 0.31
351 0.28
352 0.28
353 0.26
354 0.21
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.13
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.13
389 0.16
390 0.2
391 0.28
392 0.33
393 0.41
394 0.44
395 0.44
396 0.44
397 0.47
398 0.47
399 0.45
400 0.43
401 0.37
402 0.35
403 0.35
404 0.32
405 0.27
406 0.23
407 0.17
408 0.13
409 0.12
410 0.11
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.15
415 0.19
416 0.23
417 0.26
418 0.31
419 0.37
420 0.44
421 0.49
422 0.55
423 0.6
424 0.66
425 0.73
426 0.78
427 0.76
428 0.71
429 0.67
430 0.62
431 0.54
432 0.5
433 0.5
434 0.49
435 0.5
436 0.54
437 0.57
438 0.62
439 0.69
440 0.71
441 0.72
442 0.73
443 0.8
444 0.85
445 0.89
446 0.9
447 0.91
448 0.93
449 0.92
450 0.92
451 0.91
452 0.88
453 0.87
454 0.85
455 0.84
456 0.79
457 0.73
458 0.62
459 0.54