Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6KIH0

Protein Details
Accession A0A5N6KIH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-111DEDDWNQQGKKSRKRREEKEQVEKVFGHydrophilic
194-214STILSRKRASRAKRNLPKLIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-100KKSRKRR
204-204R
Subcellular Location(s) cyto 7, nucl 5, golg 4, cyto_mito 4, plas 3, E.R. 3, mito_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038587  L40e_sf  
IPR001975  Ribosomal_L40e  
IPR033599  TAF1B/Rrn7  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR019954  Ubiquitin_CS  
IPR019956  Ubiquitin_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01020  Ribosomal_L40e  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00299  UBIQUITIN_1  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd01803  Ubl_ubiquitin  
Amino Acid Sequences MLSDICILVVFALGDLIYKTLVTLIILLGRRRQAGMRDVTTTYSKKKSRTFFNQIIEFLCETFEYGKKFCQRGHEQAGFTQTQQDEDDWNQQGKKSRKRREEKEQVEKVFGGRDATQLYLQCYQLILWKQTHWLVTVKGFPKELETVVRDLWELRLRVLQGSGEERSEYGTEFGSTTEGDDTDTDGTGYRSTASTILSRKRASRAKRNLPKLIETLGFCYLGILLLRLPTSLGEIYQWATRDEIIYTRAIKEIPKDMRTRLPGHYFRALEIHGILNGHRLHQTVLDMIYFYKFNFEMVFPPVNHKLLLYKHIRDLGLPVDIYTAVNHLAGLLQYDFSYPAHNKRLHGTAGYPEYQLISLIIIATKLSQPFDDILRHPESDSDPTAARINWAKWKTIMTEEPSEGLKRGDEIKITDTDVFKMTGAQMDDWMNWYHKTWIDDRDHKVPEQILELFPLPDITSEATVGIVEPDPIDRAKEVHKTLTLQKPVAHTDVNEPRDIVRPGEMYRRYRTIAELPESAQAFYEIAARNIGTSLQKLVYGVFTTEIQLEKWMLDERRKGLSEKEELEGEAEHDQSEEGKYKEDEVEDKHDERDEDSPMKEIYQKRLGLNFVDSRQQRQRRTSATMQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLKALASKFNCEKMICRKLVSLPVLPTAERRSADTPTNSAQRRSSSKCFALMAFGFTGRLWNGGLVRGCIDGFFAWPALYLRTIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.13
13 0.17
14 0.19
15 0.23
16 0.26
17 0.27
18 0.28
19 0.32
20 0.31
21 0.36
22 0.43
23 0.41
24 0.42
25 0.41
26 0.43
27 0.46
28 0.45
29 0.43
30 0.45
31 0.47
32 0.51
33 0.58
34 0.63
35 0.67
36 0.73
37 0.76
38 0.75
39 0.78
40 0.76
41 0.69
42 0.63
43 0.56
44 0.46
45 0.36
46 0.28
47 0.19
48 0.15
49 0.17
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.26
54 0.34
55 0.37
56 0.39
57 0.46
58 0.51
59 0.56
60 0.64
61 0.64
62 0.58
63 0.57
64 0.6
65 0.51
66 0.43
67 0.41
68 0.31
69 0.27
70 0.26
71 0.24
72 0.22
73 0.24
74 0.31
75 0.28
76 0.32
77 0.31
78 0.33
79 0.41
80 0.47
81 0.55
82 0.58
83 0.65
84 0.72
85 0.81
86 0.88
87 0.9
88 0.91
89 0.91
90 0.91
91 0.9
92 0.82
93 0.75
94 0.66
95 0.56
96 0.48
97 0.38
98 0.3
99 0.21
100 0.21
101 0.19
102 0.2
103 0.21
104 0.19
105 0.22
106 0.23
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.17
111 0.21
112 0.24
113 0.24
114 0.22
115 0.23
116 0.27
117 0.29
118 0.3
119 0.26
120 0.25
121 0.23
122 0.24
123 0.31
124 0.31
125 0.31
126 0.31
127 0.29
128 0.29
129 0.29
130 0.28
131 0.25
132 0.24
133 0.24
134 0.23
135 0.24
136 0.2
137 0.19
138 0.21
139 0.22
140 0.2
141 0.18
142 0.21
143 0.21
144 0.22
145 0.22
146 0.19
147 0.16
148 0.19
149 0.19
150 0.17
151 0.16
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.14
182 0.2
183 0.27
184 0.32
185 0.34
186 0.36
187 0.44
188 0.5
189 0.54
190 0.59
191 0.64
192 0.69
193 0.77
194 0.82
195 0.82
196 0.77
197 0.73
198 0.64
199 0.57
200 0.49
201 0.4
202 0.34
203 0.28
204 0.24
205 0.19
206 0.17
207 0.13
208 0.1
209 0.1
210 0.07
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.17
239 0.24
240 0.27
241 0.31
242 0.33
243 0.35
244 0.41
245 0.44
246 0.45
247 0.42
248 0.45
249 0.44
250 0.46
251 0.5
252 0.43
253 0.39
254 0.37
255 0.32
256 0.24
257 0.21
258 0.16
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.14
285 0.18
286 0.15
287 0.2
288 0.23
289 0.22
290 0.22
291 0.2
292 0.2
293 0.18
294 0.25
295 0.26
296 0.25
297 0.27
298 0.31
299 0.3
300 0.27
301 0.26
302 0.21
303 0.17
304 0.15
305 0.12
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.09
325 0.1
326 0.15
327 0.22
328 0.24
329 0.25
330 0.27
331 0.3
332 0.28
333 0.27
334 0.23
335 0.2
336 0.21
337 0.22
338 0.19
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.08
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.1
358 0.12
359 0.12
360 0.16
361 0.18
362 0.18
363 0.17
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.18
368 0.15
369 0.13
370 0.14
371 0.15
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.14
376 0.2
377 0.21
378 0.2
379 0.2
380 0.21
381 0.21
382 0.22
383 0.24
384 0.2
385 0.21
386 0.2
387 0.21
388 0.2
389 0.19
390 0.16
391 0.13
392 0.09
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.13
399 0.13
400 0.15
401 0.16
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.12
417 0.1
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.15
423 0.16
424 0.23
425 0.28
426 0.35
427 0.38
428 0.43
429 0.43
430 0.41
431 0.4
432 0.33
433 0.28
434 0.23
435 0.21
436 0.14
437 0.14
438 0.14
439 0.12
440 0.11
441 0.1
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.06
461 0.08
462 0.11
463 0.17
464 0.19
465 0.2
466 0.22
467 0.24
468 0.31
469 0.37
470 0.37
471 0.33
472 0.34
473 0.34
474 0.35
475 0.34
476 0.27
477 0.2
478 0.25
479 0.32
480 0.31
481 0.28
482 0.26
483 0.25
484 0.29
485 0.29
486 0.22
487 0.16
488 0.16
489 0.18
490 0.26
491 0.3
492 0.3
493 0.33
494 0.36
495 0.35
496 0.34
497 0.35
498 0.33
499 0.32
500 0.32
501 0.29
502 0.27
503 0.29
504 0.29
505 0.25
506 0.19
507 0.15
508 0.11
509 0.1
510 0.14
511 0.1
512 0.1
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.08
519 0.08
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.1
535 0.1
536 0.09
537 0.1
538 0.14
539 0.16
540 0.2
541 0.25
542 0.27
543 0.32
544 0.34
545 0.33
546 0.33
547 0.37
548 0.37
549 0.35
550 0.34
551 0.29
552 0.28
553 0.27
554 0.22
555 0.18
556 0.13
557 0.11
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.13
564 0.12
565 0.14
566 0.14
567 0.16
568 0.18
569 0.19
570 0.21
571 0.2
572 0.27
573 0.3
574 0.3
575 0.3
576 0.3
577 0.29
578 0.28
579 0.26
580 0.24
581 0.22
582 0.22
583 0.23
584 0.21
585 0.22
586 0.26
587 0.27
588 0.3
589 0.34
590 0.37
591 0.37
592 0.41
593 0.41
594 0.37
595 0.38
596 0.35
597 0.3
598 0.34
599 0.32
600 0.36
601 0.44
602 0.51
603 0.52
604 0.55
605 0.61
606 0.59
607 0.66
608 0.66
609 0.66
610 0.62
611 0.62
612 0.56
613 0.49
614 0.44
615 0.36
616 0.31
617 0.22
618 0.18
619 0.14
620 0.15
621 0.14
622 0.14
623 0.18
624 0.17
625 0.16
626 0.16
627 0.14
628 0.14
629 0.14
630 0.14
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.12
635 0.12
636 0.11
637 0.14
638 0.17
639 0.21
640 0.26
641 0.3
642 0.35
643 0.35
644 0.44
645 0.48
646 0.48
647 0.46
648 0.47
649 0.47
650 0.46
651 0.44
652 0.35
653 0.32
654 0.32
655 0.31
656 0.28
657 0.3
658 0.24
659 0.29
660 0.29
661 0.27
662 0.24
663 0.24
664 0.23
665 0.19
666 0.19
667 0.16
668 0.22
669 0.25
670 0.26
671 0.29
672 0.27
673 0.26
674 0.26
675 0.29
676 0.26
677 0.24
678 0.21
679 0.23
680 0.27
681 0.27
682 0.29
683 0.26
684 0.21
685 0.19
686 0.2
687 0.16
688 0.15
689 0.16
690 0.14
691 0.16
692 0.16
693 0.16
694 0.15
695 0.15
696 0.22
697 0.21
698 0.3
699 0.31
700 0.36
701 0.4
702 0.4
703 0.46
704 0.47
705 0.54
706 0.48
707 0.47
708 0.45
709 0.47
710 0.54
711 0.52
712 0.46
713 0.39
714 0.42
715 0.42
716 0.39
717 0.38
718 0.35
719 0.35
720 0.31
721 0.33
722 0.31
723 0.33
724 0.4
725 0.4
726 0.4
727 0.4
728 0.49
729 0.47
730 0.48
731 0.48
732 0.49
733 0.53
734 0.56
735 0.58
736 0.57
737 0.58
738 0.58
739 0.55
740 0.48
741 0.47
742 0.4
743 0.35
744 0.28
745 0.25
746 0.21
747 0.19
748 0.22
749 0.15
750 0.15
751 0.12
752 0.13
753 0.14
754 0.19
755 0.21
756 0.19
757 0.2
758 0.2
759 0.19
760 0.17
761 0.17
762 0.12
763 0.12
764 0.12
765 0.11
766 0.1
767 0.12
768 0.13
769 0.13