Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V6H2

Protein Details
Accession H1V6H2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
372-393DQAQPPSHPKRQKVQHQPVSTQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
358-377GKQSGRRKGKAAKPDQAQPP
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034772  CPSF6/7  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG chig:CH63R_09937  -  
Amino Acid Sequences MAEEEFEIDIYGDAPQDQQDGNAENYDGQQANGHADDHHEHQEHHEQREDQQKHDHQTQQQDEYNEQQDAPAPQQGVKRKGDDRPVDPGATTALMISDLNWWNTDDDIRGYARAAHCEDEMKDITFSEHKVNGKSKGQAYVEFTTQQAATAAKHALEATDGGQGVPKKHQVTYSNPHVNPFRTLPKDAPNRAGKEQGSRPGSNYNSQGPPMGGGEFRGNGYRGRGGFNGPRGGMNQGGFNRNFSGGMGGGFNNNNNMGGGFNNGMGGGNFGGGGFQRGGGFGGGMRGGPGMRGGRGGMHNPMGGMGMGPMGGMPMGGMPNMGMMGGGMPGTTPPSLGLSQHCHNPSTPSTANGTSQRGKQSGRRKGKAAKPDQAQPPSHPKRQKVQHQPVSTQSQLVPAPEVGRWTKERGLEFTTRAPSLPDLPSSDFRMPPCSARHSGNPPELFPSCLQFIRPVRRGHTY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.14
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.16
12 0.17
13 0.21
14 0.18
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.14
22 0.17
23 0.2
24 0.22
25 0.28
26 0.26
27 0.26
28 0.31
29 0.41
30 0.43
31 0.44
32 0.47
33 0.41
34 0.46
35 0.56
36 0.53
37 0.47
38 0.51
39 0.54
40 0.54
41 0.61
42 0.62
43 0.57
44 0.65
45 0.67
46 0.64
47 0.62
48 0.57
49 0.52
50 0.5
51 0.48
52 0.38
53 0.32
54 0.25
55 0.24
56 0.24
57 0.24
58 0.21
59 0.19
60 0.21
61 0.28
62 0.35
63 0.39
64 0.41
65 0.45
66 0.47
67 0.53
68 0.59
69 0.6
70 0.55
71 0.56
72 0.56
73 0.5
74 0.44
75 0.38
76 0.3
77 0.23
78 0.19
79 0.11
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.17
99 0.17
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.23
107 0.23
108 0.2
109 0.18
110 0.17
111 0.18
112 0.17
113 0.18
114 0.17
115 0.21
116 0.22
117 0.27
118 0.31
119 0.35
120 0.37
121 0.41
122 0.39
123 0.41
124 0.4
125 0.39
126 0.4
127 0.36
128 0.34
129 0.29
130 0.27
131 0.22
132 0.2
133 0.17
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.07
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.16
153 0.2
154 0.19
155 0.21
156 0.26
157 0.28
158 0.34
159 0.4
160 0.47
161 0.51
162 0.49
163 0.52
164 0.49
165 0.47
166 0.42
167 0.38
168 0.35
169 0.3
170 0.32
171 0.32
172 0.38
173 0.45
174 0.44
175 0.48
176 0.47
177 0.47
178 0.47
179 0.49
180 0.41
181 0.39
182 0.41
183 0.41
184 0.4
185 0.36
186 0.36
187 0.37
188 0.37
189 0.34
190 0.33
191 0.3
192 0.26
193 0.26
194 0.25
195 0.19
196 0.17
197 0.14
198 0.13
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.12
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.16
213 0.18
214 0.21
215 0.22
216 0.19
217 0.19
218 0.17
219 0.18
220 0.16
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.15
229 0.15
230 0.12
231 0.11
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.11
282 0.13
283 0.14
284 0.14
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.02
300 0.02
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.02
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.09
322 0.09
323 0.11
324 0.15
325 0.18
326 0.21
327 0.27
328 0.28
329 0.27
330 0.27
331 0.3
332 0.29
333 0.31
334 0.3
335 0.26
336 0.28
337 0.29
338 0.32
339 0.32
340 0.35
341 0.31
342 0.35
343 0.38
344 0.38
345 0.39
346 0.44
347 0.5
348 0.55
349 0.62
350 0.62
351 0.64
352 0.7
353 0.75
354 0.78
355 0.76
356 0.74
357 0.69
358 0.72
359 0.74
360 0.72
361 0.66
362 0.62
363 0.64
364 0.63
365 0.67
366 0.66
367 0.63
368 0.65
369 0.73
370 0.78
371 0.78
372 0.81
373 0.82
374 0.8
375 0.78
376 0.75
377 0.73
378 0.63
379 0.54
380 0.43
381 0.38
382 0.33
383 0.3
384 0.25
385 0.19
386 0.2
387 0.18
388 0.22
389 0.19
390 0.23
391 0.25
392 0.28
393 0.31
394 0.35
395 0.37
396 0.37
397 0.42
398 0.42
399 0.42
400 0.43
401 0.43
402 0.39
403 0.36
404 0.34
405 0.3
406 0.3
407 0.29
408 0.26
409 0.25
410 0.3
411 0.33
412 0.37
413 0.39
414 0.37
415 0.36
416 0.39
417 0.37
418 0.37
419 0.39
420 0.4
421 0.4
422 0.42
423 0.49
424 0.52
425 0.58
426 0.62
427 0.59
428 0.53
429 0.55
430 0.51
431 0.47
432 0.39
433 0.35
434 0.3
435 0.28
436 0.28
437 0.3
438 0.38
439 0.45
440 0.5
441 0.52