Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V8R1

Protein Details
Accession H1V8R1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-447LANGSKPRRKRETKRQPANSGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
429-456GSKPRRKRETKRQPANSGIVRPRYRPKR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 8, pero 3, mito 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGDYARAQNLVFEIIRINAETHQAWTVLASIFREEGLNDKALMAMVIAAHLRPKDFAAWMNCASFAMSLAEAGQEGALKTALMCYSSAIKAQPTSLDARLGRAEASHRQGFLSQAITEFSYVIERRPLDIDVVRRLAEACVDSGGMEDLQKAVSAYKTYFAHARTADRNVERELSWHDVGIYVELFACAGDFTNAIAELKSLSRWLLGRQDDHKWDDCVDDREWDRDHGRRNLFPSFETAAHDLYAYGLGLPLEFRARLALYRLKIQDEEESNGHLQWLDPTESATATAIENFPYLIRDIADELFTVQRYSEALDFYELLRQSAYGQDATLLLHLGQCYLTKSDLVAAEDCFLVAIEVDENNIDARIELARIYEKAKEEEEALILVTEAIALQGITDGSNQFGDGMGDLSGDRGRSATGARASALANGSKPRRKRETKRQPANSGIVRPRYRPKRLVAPDQRMQEERARADELTRRYEIVRNLKKDIQTGDHSLIPTWMAAAGELVGEFRSFRKFYPWDKYLKFLGAANDVVFSASLRTQPGLSELAERLSKNMAPSLSDDKRMNVAYEDDGYRGIPFGEWLELFLDYAISLALANRAEEAYQVCEAARDSIVFVNSKDYMFMIHVAWAACAIYLSDEEMCVAVARFFMKVRQLDSDSYRMFAALCRLCQSPASWYNSGPAQKYILRQIKIIDASHLATTRTERGHESAVGERAGLAEAKQLDTCLLMLYGHILFTSTSYTFALNYFLRARTLDPLNPMINLSVGLGYIHHALKRQADNRQYLIMQGFACVFEFCHSKLSGTPDERREAFFGVARTFHMLGLHHLALEWYRKVAASEGAKGSEGPDVAEQQDSPSSRDVILSAAYNEYALFISSGTADELERSVLPRLVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.14
7 0.18
8 0.18
9 0.19
10 0.19
11 0.18
12 0.17
13 0.16
14 0.17
15 0.14
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.15
24 0.17
25 0.18
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.1
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.14
42 0.16
43 0.18
44 0.24
45 0.26
46 0.31
47 0.32
48 0.32
49 0.3
50 0.28
51 0.26
52 0.2
53 0.16
54 0.12
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.14
74 0.15
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.2
80 0.2
81 0.19
82 0.23
83 0.22
84 0.27
85 0.25
86 0.27
87 0.28
88 0.26
89 0.23
90 0.21
91 0.24
92 0.24
93 0.31
94 0.31
95 0.29
96 0.3
97 0.31
98 0.31
99 0.29
100 0.24
101 0.18
102 0.16
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.13
107 0.11
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.2
112 0.2
113 0.22
114 0.24
115 0.24
116 0.22
117 0.26
118 0.29
119 0.3
120 0.32
121 0.3
122 0.28
123 0.28
124 0.24
125 0.22
126 0.18
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.23
148 0.23
149 0.27
150 0.27
151 0.32
152 0.31
153 0.36
154 0.41
155 0.4
156 0.41
157 0.38
158 0.38
159 0.32
160 0.3
161 0.3
162 0.29
163 0.26
164 0.24
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.19
169 0.14
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.14
194 0.21
195 0.23
196 0.28
197 0.31
198 0.38
199 0.4
200 0.44
201 0.44
202 0.37
203 0.35
204 0.33
205 0.33
206 0.3
207 0.26
208 0.27
209 0.26
210 0.28
211 0.29
212 0.29
213 0.3
214 0.31
215 0.38
216 0.41
217 0.44
218 0.44
219 0.47
220 0.48
221 0.45
222 0.41
223 0.38
224 0.33
225 0.29
226 0.28
227 0.25
228 0.21
229 0.2
230 0.19
231 0.13
232 0.1
233 0.1
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.13
248 0.18
249 0.18
250 0.25
251 0.27
252 0.27
253 0.27
254 0.28
255 0.3
256 0.27
257 0.29
258 0.23
259 0.24
260 0.23
261 0.22
262 0.21
263 0.15
264 0.12
265 0.1
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.09
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.14
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.08
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.03
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.12
362 0.13
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.1
370 0.09
371 0.07
372 0.06
373 0.05
374 0.04
375 0.03
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.02
380 0.02
381 0.02
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.13
413 0.1
414 0.09
415 0.14
416 0.18
417 0.22
418 0.25
419 0.31
420 0.4
421 0.49
422 0.58
423 0.65
424 0.72
425 0.79
426 0.86
427 0.86
428 0.82
429 0.77
430 0.73
431 0.64
432 0.58
433 0.51
434 0.48
435 0.42
436 0.4
437 0.44
438 0.47
439 0.5
440 0.49
441 0.48
442 0.51
443 0.55
444 0.63
445 0.63
446 0.62
447 0.61
448 0.59
449 0.58
450 0.49
451 0.46
452 0.39
453 0.33
454 0.27
455 0.24
456 0.22
457 0.2
458 0.21
459 0.24
460 0.22
461 0.23
462 0.23
463 0.21
464 0.21
465 0.25
466 0.29
467 0.34
468 0.38
469 0.37
470 0.41
471 0.44
472 0.43
473 0.42
474 0.38
475 0.32
476 0.28
477 0.28
478 0.26
479 0.24
480 0.23
481 0.2
482 0.18
483 0.14
484 0.11
485 0.08
486 0.06
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.04
497 0.05
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.17
502 0.21
503 0.27
504 0.36
505 0.38
506 0.42
507 0.43
508 0.46
509 0.41
510 0.37
511 0.32
512 0.25
513 0.24
514 0.18
515 0.18
516 0.14
517 0.13
518 0.12
519 0.11
520 0.09
521 0.07
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.1
530 0.11
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.15
536 0.14
537 0.13
538 0.14
539 0.14
540 0.13
541 0.15
542 0.13
543 0.12
544 0.16
545 0.23
546 0.23
547 0.26
548 0.26
549 0.25
550 0.28
551 0.27
552 0.24
553 0.17
554 0.17
555 0.14
556 0.15
557 0.15
558 0.12
559 0.12
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.08
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.07
568 0.06
569 0.07
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.04
576 0.05
577 0.04
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.05
582 0.05
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.07
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.08
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.09
597 0.07
598 0.08
599 0.09
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.13
604 0.14
605 0.14
606 0.13
607 0.11
608 0.11
609 0.11
610 0.12
611 0.09
612 0.09
613 0.11
614 0.1
615 0.1
616 0.09
617 0.08
618 0.07
619 0.06
620 0.05
621 0.04
622 0.04
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.06
634 0.07
635 0.07
636 0.1
637 0.15
638 0.17
639 0.19
640 0.23
641 0.26
642 0.28
643 0.32
644 0.36
645 0.31
646 0.3
647 0.28
648 0.23
649 0.2
650 0.18
651 0.22
652 0.17
653 0.18
654 0.2
655 0.2
656 0.21
657 0.22
658 0.22
659 0.22
660 0.26
661 0.32
662 0.3
663 0.3
664 0.31
665 0.35
666 0.37
667 0.31
668 0.26
669 0.23
670 0.25
671 0.27
672 0.35
673 0.38
674 0.36
675 0.36
676 0.36
677 0.38
678 0.39
679 0.36
680 0.28
681 0.23
682 0.23
683 0.24
684 0.23
685 0.18
686 0.15
687 0.18
688 0.2
689 0.2
690 0.2
691 0.21
692 0.22
693 0.25
694 0.25
695 0.25
696 0.25
697 0.26
698 0.24
699 0.21
700 0.19
701 0.16
702 0.15
703 0.12
704 0.08
705 0.09
706 0.1
707 0.12
708 0.12
709 0.12
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.08
714 0.07
715 0.06
716 0.06
717 0.08
718 0.08
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.11
725 0.09
726 0.1
727 0.11
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.16
732 0.13
733 0.16
734 0.18
735 0.18
736 0.19
737 0.2
738 0.21
739 0.23
740 0.27
741 0.26
742 0.27
743 0.31
744 0.31
745 0.3
746 0.29
747 0.23
748 0.19
749 0.16
750 0.12
751 0.08
752 0.07
753 0.07
754 0.06
755 0.07
756 0.1
757 0.12
758 0.12
759 0.15
760 0.17
761 0.25
762 0.33
763 0.37
764 0.43
765 0.49
766 0.53
767 0.53
768 0.55
769 0.48
770 0.42
771 0.37
772 0.32
773 0.24
774 0.2
775 0.18
776 0.14
777 0.15
778 0.12
779 0.11
780 0.11
781 0.13
782 0.13
783 0.17
784 0.17
785 0.18
786 0.21
787 0.27
788 0.34
789 0.37
790 0.44
791 0.45
792 0.51
793 0.51
794 0.51
795 0.46
796 0.4
797 0.36
798 0.32
799 0.3
800 0.26
801 0.25
802 0.23
803 0.25
804 0.24
805 0.22
806 0.2
807 0.18
808 0.19
809 0.25
810 0.23
811 0.19
812 0.18
813 0.18
814 0.19
815 0.23
816 0.2
817 0.15
818 0.16
819 0.16
820 0.17
821 0.19
822 0.23
823 0.22
824 0.27
825 0.29
826 0.29
827 0.29
828 0.28
829 0.27
830 0.23
831 0.19
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.17
836 0.18
837 0.17
838 0.16
839 0.22
840 0.22
841 0.22
842 0.23
843 0.23
844 0.22
845 0.23
846 0.2
847 0.16
848 0.17
849 0.16
850 0.15
851 0.14
852 0.14
853 0.13
854 0.13
855 0.12
856 0.11
857 0.09
858 0.08
859 0.06
860 0.07
861 0.07
862 0.08
863 0.08
864 0.09
865 0.08
866 0.09
867 0.1
868 0.11
869 0.12
870 0.13
871 0.16