Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6JTD8

Protein Details
Accession A0A5N6JTD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-245TASLDRPKARRKDNSVKKLFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-235KARR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Amino Acid Sequences MLLRMTNTVTQTYYNLERPFPATKVLKEAKYTFIIYTSKSPITRNIAIEPSTQELYKNNECSHEQKSPVRAARETTMSQSSRTAAITSKQPRLYSDNEIQFSDSSAATSSTIRPRNRRLVSTEQELASTTTSRRSSPAGSSRGVSPIPSRHPSRRVGDDVAQSTEGAFGTSAVERGDQKIGPGNPAAWGSGWSNSWSTIQGLASSVLGDLGDLVTDEGEGSARKTASLDRPKARRKDNSVKKLFELPQGAWGPTEQKKRNEAVIGAGSQSERDAALRTQKMTRVLENHSDLNGSIDINGNYKRRTSVDETSTRTQEDEGDALVYIHHVQKEDTLAGVILRYNCQPMVFRKANRFWPNDSIQTREVVILPVDACAIKGRPCDPPQDLGQGIDLLAPTPSLEDAPESWPPRSEPPIERPEENPWEHVQWVTFDSSPDSKPVEIARMPRRTLGYFPPRRRKSQATNSIASTPRGSYDLPRMSQTGALGDPIGSPASTTSQRTSNLGRRPSQSTSGSYFPPAGAANRPRRESVNEAADRLGWLRGPGGVGTLGKGVTTPGPGQDPLNTWARKHIPGIAIDSLPSSSILDSEIVPFGFRDELASIAESSYSPARSGSATPSNLGGSGIGLENAAAAIEGWVRRLAVKAPGTPLNGGRVSGDGSGDLIELLDGAGSDDGRGFELSPGRLRNNSSSRIGSSGREDLEGALRGRGVKGGKKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.31
4 0.32
5 0.35
6 0.38
7 0.34
8 0.38
9 0.36
10 0.36
11 0.44
12 0.49
13 0.48
14 0.5
15 0.51
16 0.48
17 0.47
18 0.47
19 0.37
20 0.35
21 0.34
22 0.3
23 0.33
24 0.34
25 0.35
26 0.35
27 0.36
28 0.39
29 0.45
30 0.47
31 0.45
32 0.44
33 0.44
34 0.43
35 0.43
36 0.39
37 0.35
38 0.31
39 0.28
40 0.24
41 0.23
42 0.3
43 0.34
44 0.37
45 0.34
46 0.37
47 0.41
48 0.44
49 0.47
50 0.46
51 0.45
52 0.46
53 0.51
54 0.55
55 0.58
56 0.58
57 0.54
58 0.51
59 0.5
60 0.5
61 0.45
62 0.4
63 0.42
64 0.38
65 0.37
66 0.35
67 0.31
68 0.27
69 0.26
70 0.23
71 0.17
72 0.2
73 0.29
74 0.33
75 0.4
76 0.42
77 0.42
78 0.45
79 0.48
80 0.49
81 0.47
82 0.49
83 0.49
84 0.47
85 0.46
86 0.44
87 0.39
88 0.35
89 0.29
90 0.2
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.13
96 0.16
97 0.23
98 0.31
99 0.37
100 0.44
101 0.52
102 0.61
103 0.65
104 0.65
105 0.64
106 0.66
107 0.66
108 0.64
109 0.6
110 0.5
111 0.45
112 0.41
113 0.35
114 0.26
115 0.22
116 0.16
117 0.18
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.25
123 0.31
124 0.39
125 0.37
126 0.36
127 0.37
128 0.37
129 0.37
130 0.34
131 0.28
132 0.24
133 0.26
134 0.32
135 0.36
136 0.41
137 0.45
138 0.51
139 0.56
140 0.58
141 0.58
142 0.56
143 0.55
144 0.54
145 0.53
146 0.49
147 0.44
148 0.39
149 0.31
150 0.26
151 0.22
152 0.17
153 0.11
154 0.08
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.09
161 0.1
162 0.12
163 0.15
164 0.13
165 0.14
166 0.2
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.18
174 0.11
175 0.13
176 0.11
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.14
213 0.23
214 0.32
215 0.39
216 0.44
217 0.54
218 0.63
219 0.69
220 0.73
221 0.72
222 0.72
223 0.76
224 0.79
225 0.81
226 0.8
227 0.75
228 0.69
229 0.68
230 0.61
231 0.55
232 0.47
233 0.37
234 0.37
235 0.35
236 0.33
237 0.25
238 0.23
239 0.23
240 0.26
241 0.35
242 0.33
243 0.36
244 0.41
245 0.43
246 0.46
247 0.43
248 0.37
249 0.31
250 0.28
251 0.23
252 0.19
253 0.17
254 0.14
255 0.12
256 0.11
257 0.08
258 0.05
259 0.05
260 0.07
261 0.08
262 0.16
263 0.17
264 0.19
265 0.21
266 0.24
267 0.3
268 0.3
269 0.31
270 0.28
271 0.3
272 0.34
273 0.34
274 0.32
275 0.26
276 0.25
277 0.21
278 0.19
279 0.15
280 0.1
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.17
291 0.22
292 0.26
293 0.28
294 0.33
295 0.39
296 0.43
297 0.45
298 0.45
299 0.4
300 0.34
301 0.28
302 0.22
303 0.17
304 0.12
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.12
333 0.2
334 0.24
335 0.26
336 0.32
337 0.36
338 0.45
339 0.49
340 0.5
341 0.44
342 0.46
343 0.46
344 0.47
345 0.43
346 0.38
347 0.32
348 0.29
349 0.27
350 0.22
351 0.19
352 0.12
353 0.11
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.09
364 0.11
365 0.16
366 0.18
367 0.23
368 0.24
369 0.26
370 0.26
371 0.28
372 0.26
373 0.21
374 0.2
375 0.15
376 0.13
377 0.11
378 0.09
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.04
387 0.04
388 0.06
389 0.09
390 0.14
391 0.15
392 0.15
393 0.16
394 0.18
395 0.21
396 0.23
397 0.25
398 0.24
399 0.3
400 0.38
401 0.39
402 0.4
403 0.39
404 0.41
405 0.43
406 0.4
407 0.35
408 0.29
409 0.28
410 0.26
411 0.24
412 0.18
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.11
417 0.1
418 0.12
419 0.14
420 0.14
421 0.15
422 0.15
423 0.13
424 0.14
425 0.15
426 0.17
427 0.17
428 0.24
429 0.31
430 0.35
431 0.36
432 0.37
433 0.39
434 0.36
435 0.36
436 0.38
437 0.4
438 0.44
439 0.53
440 0.62
441 0.63
442 0.68
443 0.71
444 0.7
445 0.69
446 0.71
447 0.72
448 0.67
449 0.66
450 0.62
451 0.61
452 0.54
453 0.45
454 0.36
455 0.25
456 0.2
457 0.19
458 0.17
459 0.14
460 0.22
461 0.25
462 0.25
463 0.26
464 0.26
465 0.25
466 0.26
467 0.23
468 0.17
469 0.12
470 0.11
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.09
480 0.11
481 0.13
482 0.15
483 0.18
484 0.2
485 0.23
486 0.28
487 0.33
488 0.38
489 0.42
490 0.44
491 0.45
492 0.49
493 0.5
494 0.49
495 0.44
496 0.41
497 0.39
498 0.37
499 0.34
500 0.3
501 0.27
502 0.21
503 0.19
504 0.16
505 0.14
506 0.18
507 0.26
508 0.35
509 0.4
510 0.42
511 0.42
512 0.45
513 0.48
514 0.47
515 0.45
516 0.45
517 0.41
518 0.4
519 0.38
520 0.36
521 0.31
522 0.26
523 0.2
524 0.1
525 0.09
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.09
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.13
544 0.14
545 0.15
546 0.17
547 0.19
548 0.2
549 0.28
550 0.27
551 0.25
552 0.32
553 0.35
554 0.35
555 0.34
556 0.36
557 0.31
558 0.32
559 0.37
560 0.31
561 0.27
562 0.25
563 0.24
564 0.18
565 0.15
566 0.14
567 0.1
568 0.07
569 0.07
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.09
581 0.1
582 0.09
583 0.1
584 0.11
585 0.12
586 0.11
587 0.1
588 0.11
589 0.09
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.16
598 0.2
599 0.25
600 0.25
601 0.26
602 0.27
603 0.26
604 0.25
605 0.23
606 0.16
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.05
615 0.05
616 0.03
617 0.03
618 0.04
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.09
623 0.1
624 0.11
625 0.12
626 0.15
627 0.2
628 0.24
629 0.27
630 0.31
631 0.36
632 0.37
633 0.38
634 0.37
635 0.35
636 0.32
637 0.29
638 0.24
639 0.21
640 0.2
641 0.18
642 0.17
643 0.11
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.08
648 0.06
649 0.05
650 0.05
651 0.04
652 0.04
653 0.03
654 0.04
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.07
659 0.07
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.12
664 0.17
665 0.2
666 0.25
667 0.3
668 0.32
669 0.36
670 0.39
671 0.45
672 0.48
673 0.5
674 0.5
675 0.49
676 0.48
677 0.49
678 0.47
679 0.4
680 0.39
681 0.39
682 0.34
683 0.31
684 0.3
685 0.26
686 0.29
687 0.3
688 0.25
689 0.2
690 0.2
691 0.21
692 0.21
693 0.24
694 0.24