FuNGI

A0A5N6JQY2

Protein Details

Accession

A0A5N6JQY2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MPPRPKPPPVARPNPLRNMKP	Hydrophilic
341-364	YIKEMAEKKKNRKRKGKGNATENG	Basic
569-613	LNANKDWLRKQQQKDFEKRKAAMGPPKVTRQRKKKPRIGEGQTSV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-41	RPKPPPVARPNPLRNMKPIKAPTPLSRKAAMGAGRVKP
347-358	EKKKNRKRKGKG
585-605	EKRKAAMGPPKVTRQRKKKPR

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF00382 TFIIB

Amino Acid Sequences

MPPRPKPPPVARPNPLRNMKPIKAPTPLSRKAAMGAGRVKPRPACPNPQCNKPQIEDGVCHNCGTVVDDSNIVAEIQFGESSSGAAVVQGAHVGADQGGAQTLGPAFRRAGGGESNKENTLREGKRVMQALANQLGLSENVVGVGHQIFKLASMNNFIQGRRTDLVAAVCLYSACRKEQPCRVMLIDFADKSQVNVFQLGRIFKALHKQISLATDGILPVLPEDLIWKFASKLEFYEQTEKVADDAIRMVRRMSLDWMVMGRRPSGVCGACLILAARMNNFRRTVTEVVYVVKVTTATIQKRLEEFKRTPSSALTVEEFLNNEFLESAHDPPSFYRNSEAYIKEMAEKKKNRKRKGKGNATENGDNEGSDGGEENVESNKRQKSSSGAPVPTAEVRRDADGFAIPAIPTPKDQNIDPRLLDDAIEDESGTSFNKLVAEFGDADPVEAEVDDEVADEIEEATSAPKRGPGRPRNDEPPVEMPAEWLAVEDELEQQITEMVSDPHTQEHALSFAKAQKKAHYHLLLAESLHPQKHVSMDTHIGEDEFADDEEVINCVLPDAEVAKKEQIWLNANKDWLRKQQQKDFEKRKAAMGPPKVTRQRKKKPRIGEGQTSVASSPAEAAVNAMKERSWSKKINYEAIRDIFKTVGTRSGPGSIATSKVTSRDGSTAPASVAGDEIIEEEIDDDDIREPSEAGGDDWKGDANGEDYEDDFDADDAIGQGDIDEDDLWN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.85
3	0.78
4	0.77
5	0.77
6	0.72
7	0.72
8	0.7
9	0.65
10	0.64
11	0.66
12	0.65
13	0.66
14	0.68
15	0.63
16	0.58
17	0.54
18	0.48
19	0.48
20	0.42
21	0.39
22	0.4
23	0.42
24	0.48
25	0.49
26	0.52
27	0.51
28	0.54
29	0.58
30	0.57
31	0.61
32	0.62
33	0.71
34	0.73
35	0.78
36	0.77
37	0.74
38	0.73
39	0.65
40	0.62
41	0.58
42	0.56
43	0.49
44	0.49
45	0.5
46	0.45
47	0.42
48	0.35
49	0.28
50	0.25
51	0.25
52	0.21
53	0.16
54	0.16
55	0.16
56	0.16
57	0.16
58	0.16
59	0.12
60	0.09
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.07
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.05
78	0.05
79	0.05
80	0.05
81	0.04
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.05
88	0.06
89	0.07
90	0.09
91	0.1
92	0.12
93	0.12
94	0.14
95	0.15
96	0.15
97	0.17
98	0.21
99	0.26
100	0.29
101	0.33
102	0.34
103	0.35
104	0.35
105	0.33
106	0.3
107	0.35
108	0.32
109	0.32
110	0.34
111	0.36
112	0.41
113	0.43
114	0.4
115	0.34
116	0.35
117	0.37
118	0.35
119	0.31
120	0.25
121	0.22
122	0.21
123	0.17
124	0.14
125	0.09
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.05
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.07
134	0.08
135	0.08
136	0.09
137	0.11
138	0.12
139	0.12
140	0.16
141	0.16
142	0.21
143	0.23
144	0.23
145	0.25
146	0.24
147	0.28
148	0.24
149	0.25
150	0.2
151	0.21
152	0.21
153	0.18
154	0.18
155	0.12
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.12
160	0.13
161	0.15
162	0.2
163	0.24
164	0.31
165	0.4
166	0.44
167	0.43
168	0.45
169	0.44
170	0.39
171	0.36
172	0.33
173	0.29
174	0.24
175	0.22
176	0.21
177	0.19
178	0.19
179	0.2
180	0.17
181	0.14
182	0.17
183	0.17
184	0.17
185	0.2
186	0.2
187	0.19
188	0.18
189	0.18
190	0.16
191	0.25
192	0.27
193	0.26
194	0.26
195	0.26
196	0.27
197	0.28
198	0.28
199	0.2
200	0.16
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.09
205	0.07
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.04
210	0.06
211	0.06
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.15
220	0.17
221	0.21
222	0.24
223	0.3
224	0.28
225	0.28
226	0.28
227	0.26
228	0.22
229	0.2
230	0.17
231	0.1
232	0.13
233	0.15
234	0.15
235	0.16
236	0.16
237	0.15
238	0.16
239	0.16
240	0.17
241	0.15
242	0.14
243	0.14
244	0.16
245	0.15
246	0.16
247	0.16
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.13
252	0.17
253	0.16
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.12
260	0.08
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.15
265	0.17
266	0.21
267	0.22
268	0.21
269	0.21
270	0.26
271	0.27
272	0.23
273	0.24
274	0.21
275	0.21
276	0.21
277	0.19
278	0.14
279	0.12
280	0.09
281	0.07
282	0.1
283	0.14
284	0.15
285	0.21
286	0.22
287	0.23
288	0.26
289	0.31
290	0.31
291	0.33
292	0.33
293	0.36
294	0.41
295	0.41
296	0.39
297	0.34
298	0.34
299	0.28
300	0.28
301	0.2
302	0.15
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.11
307	0.1
308	0.08
309	0.07
310	0.06
311	0.05
312	0.08
313	0.09
314	0.1
315	0.13
316	0.13
317	0.13
318	0.14
319	0.18
320	0.16
321	0.15
322	0.16
323	0.13
324	0.16
325	0.2
326	0.2
327	0.18
328	0.19
329	0.19
330	0.2
331	0.25
332	0.27
333	0.31
334	0.37
335	0.46
336	0.54
337	0.63
338	0.69
339	0.74
340	0.79
341	0.82
342	0.86
343	0.86
344	0.85
345	0.83
346	0.79
347	0.74
348	0.68
349	0.57
350	0.49
351	0.38
352	0.3
353	0.22
354	0.16
355	0.1
356	0.07
357	0.06
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.12
366	0.15
367	0.16
368	0.17
369	0.17
370	0.21
371	0.26
372	0.35
373	0.36
374	0.34
375	0.33
376	0.33
377	0.34
378	0.31
379	0.27
380	0.18
381	0.15
382	0.15
383	0.15
384	0.15
385	0.14
386	0.12
387	0.11
388	0.1
389	0.08
390	0.08
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.1
397	0.13
398	0.14
399	0.15
400	0.22
401	0.25
402	0.27
403	0.26
404	0.25
405	0.24
406	0.22
407	0.22
408	0.13
409	0.1
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.12
428	0.11
429	0.11
430	0.11
431	0.1
432	0.08
433	0.06
434	0.07
435	0.03
436	0.04
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.04
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.11
452	0.14
453	0.21
454	0.31
455	0.39
456	0.48
457	0.55
458	0.61
459	0.64
460	0.67
461	0.62
462	0.56
463	0.51
464	0.44
465	0.37
466	0.31
467	0.25
468	0.19
469	0.18
470	0.13
471	0.1
472	0.07
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.06
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.07
487	0.09
488	0.1
489	0.1
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.11
494	0.12
495	0.11
496	0.11
497	0.12
498	0.17
499	0.23
500	0.26
501	0.27
502	0.31
503	0.36
504	0.39
505	0.46
506	0.43
507	0.38
508	0.38
509	0.4
510	0.34
511	0.29
512	0.27
513	0.23
514	0.22
515	0.22
516	0.19
517	0.16
518	0.16
519	0.19
520	0.19
521	0.17
522	0.18
523	0.22
524	0.22
525	0.23
526	0.22
527	0.19
528	0.16
529	0.14
530	0.12
531	0.08
532	0.07
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.06
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.06
546	0.08
547	0.09
548	0.12
549	0.14
550	0.14
551	0.17
552	0.19
553	0.23
554	0.27
555	0.32
556	0.36
557	0.37
558	0.41
559	0.42
560	0.43
561	0.43
562	0.47
563	0.51
564	0.54
565	0.59
566	0.64
567	0.71
568	0.76
569	0.82
570	0.82
571	0.81
572	0.81
573	0.74
574	0.71
575	0.68
576	0.66
577	0.64
578	0.62
579	0.61
580	0.57
581	0.65
582	0.69
583	0.73
584	0.75
585	0.77
586	0.8
587	0.83
588	0.89
589	0.88
590	0.89
591	0.89
592	0.9
593	0.87
594	0.86
595	0.8
596	0.74
597	0.66
598	0.57
599	0.46
600	0.36
601	0.28
602	0.17
603	0.13
604	0.09
605	0.09
606	0.07
607	0.09
608	0.1
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.11
613	0.14
614	0.19
615	0.25
616	0.29
617	0.34
618	0.39
619	0.47
620	0.52
621	0.59
622	0.59
623	0.58
624	0.58
625	0.56
626	0.54
627	0.47
628	0.44
629	0.34
630	0.31
631	0.27
632	0.21
633	0.24
634	0.22
635	0.23
636	0.23
637	0.26
638	0.25
639	0.23
640	0.26
641	0.2
642	0.21
643	0.21
644	0.21
645	0.18
646	0.2
647	0.22
648	0.2
649	0.21
650	0.23
651	0.22
652	0.25
653	0.25
654	0.24
655	0.22
656	0.23
657	0.2
658	0.16
659	0.15
660	0.11
661	0.09
662	0.08
663	0.08
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.09
673	0.09
674	0.1
675	0.1
676	0.1
677	0.09
678	0.13
679	0.12
680	0.12
681	0.16
682	0.16
683	0.16
684	0.16
685	0.17
686	0.14
687	0.13
688	0.13
689	0.11
690	0.11
691	0.12
692	0.13
693	0.13
694	0.15
695	0.15
696	0.14
697	0.12
698	0.11
699	0.1
700	0.09
701	0.09
702	0.07
703	0.07
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06

A0A5N6JQY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer