Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6JXJ0

Protein Details
Accession A0A5N6JXJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-232DGPTRPAKVPKKIKAKKELDDGKKKWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-247GPTRPAKVPKKIKAKKELDDGKKKWQDFAAKGKFGKAAKK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 13.333, nucl 9.5, mito_nucl 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041297  Crb2_Tudor  
IPR002999  Tudor  
IPR043560  ZGPAT  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF18115  Tudor_3  
CDD cd20446  Tudor_SpSPF30-like  
Amino Acid Sequences MSELAGLENDIKEYKLQLETVQLGLQADPDNVELQTLKAELEEVISLTESTIAELKPAPAPVAQSKKPSELPVKEKWSRENHPAFKKAAPPPPEEPEVPTSFSVNDMVLAKWHSGDKGFYPARITSITGSSTSPVYIVKFKNYDTTETLRAKDIKPIVNPNKRKADGTPVVASVPTPPSTSNIISAAADIDPELAQQSKREPSKVSDGPTRPAKVPKKIKAKKELDDGKKKWQDFAAKGKFGKAAKKESMFRTPDGVNGRVGFTGSGQRAIRDGEREGATLCKIPEHHELFEASVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.17
5 0.21
6 0.23
7 0.23
8 0.22
9 0.19
10 0.18
11 0.17
12 0.17
13 0.13
14 0.12
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.1
21 0.09
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.08
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.09
36 0.07
37 0.08
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.16
48 0.23
49 0.3
50 0.32
51 0.36
52 0.39
53 0.42
54 0.44
55 0.46
56 0.47
57 0.47
58 0.5
59 0.52
60 0.59
61 0.6
62 0.6
63 0.62
64 0.61
65 0.59
66 0.62
67 0.64
68 0.64
69 0.66
70 0.67
71 0.62
72 0.57
73 0.6
74 0.57
75 0.55
76 0.5
77 0.48
78 0.48
79 0.5
80 0.5
81 0.43
82 0.39
83 0.36
84 0.33
85 0.3
86 0.26
87 0.22
88 0.18
89 0.19
90 0.16
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.17
105 0.18
106 0.17
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.19
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.12
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.17
128 0.23
129 0.24
130 0.25
131 0.24
132 0.26
133 0.3
134 0.3
135 0.3
136 0.27
137 0.28
138 0.25
139 0.27
140 0.27
141 0.24
142 0.25
143 0.34
144 0.41
145 0.48
146 0.53
147 0.54
148 0.59
149 0.56
150 0.55
151 0.47
152 0.46
153 0.41
154 0.41
155 0.35
156 0.28
157 0.27
158 0.25
159 0.24
160 0.16
161 0.14
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.12
166 0.15
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.12
185 0.18
186 0.21
187 0.23
188 0.24
189 0.27
190 0.36
191 0.39
192 0.4
193 0.41
194 0.41
195 0.46
196 0.5
197 0.49
198 0.43
199 0.48
200 0.51
201 0.52
202 0.6
203 0.63
204 0.68
205 0.73
206 0.79
207 0.8
208 0.81
209 0.77
210 0.78
211 0.79
212 0.77
213 0.8
214 0.75
215 0.75
216 0.74
217 0.68
218 0.61
219 0.57
220 0.55
221 0.5
222 0.57
223 0.55
224 0.54
225 0.54
226 0.53
227 0.53
228 0.48
229 0.5
230 0.45
231 0.45
232 0.46
233 0.52
234 0.56
235 0.57
236 0.63
237 0.58
238 0.53
239 0.5
240 0.43
241 0.43
242 0.42
243 0.37
244 0.3
245 0.28
246 0.28
247 0.23
248 0.23
249 0.17
250 0.14
251 0.2
252 0.18
253 0.23
254 0.22
255 0.23
256 0.24
257 0.27
258 0.29
259 0.25
260 0.26
261 0.26
262 0.27
263 0.27
264 0.27
265 0.26
266 0.25
267 0.24
268 0.22
269 0.2
270 0.2
271 0.24
272 0.33
273 0.35
274 0.35
275 0.34
276 0.35